17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4882 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4882  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  479  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1045  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  93.53 
 
 		 230 aa  333  1e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2320  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.08 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03300  hypothetical protein  38.3 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0815  hypothetical protein  31.98 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.740919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0831  hypothetical protein  31.98 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0228  phospholipase D/transphosphatidylase  44.83 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122659 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1335  phospholipase D/transphosphatidylase  44.83 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.602811  normal  0.886104 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3572  phospholipase D/transphosphatidylase  32.03 
 
 		 180 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2730  endonuclease  29.29 
 
 		 258 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.966957  normal  0.749975 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3503  phospholipase D/transphosphatidylase  30.47 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000511387  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  34.07 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3852  phospholipase D/transphosphatidylase  28.14 
 
 		 263 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.0109744 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  33.33 
 
 		 184 aa  42.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  32.74 
 
 		 175 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0432  phospholipase D family protein  26.92 
 
 		 311 aa  42  0.008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  35.71 
 
 		 242 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>