44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2730 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2730  endonuclease  100 
 
 		 258 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.966957  normal  0.749975 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2519  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  54.4 
 
 		 251 aa  199  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796104  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0468  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  51.91 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2205  phospholipase D/transphosphatidylase  36.27 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3852  phospholipase D/transphosphatidylase  33.87 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.0109744 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1275  hypothetical protein  30.69 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0815  hypothetical protein  30.91 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.740919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0831  hypothetical protein  30.91 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2320  phospholipase D/Transphosphatidylase  30 
 
 		 241 aa  53.5  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4882  hypothetical protein  30.41 
 
 		 234 aa  52.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03300  hypothetical protein  29.34 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4172  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.59 
 
 		 564 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4284  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.59 
 
 		 564 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.730338 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3316  cardiolipin synthetase  26.52 
 
 		 492 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  31.25 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  23.94 
 
 		 176 aa  47  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2189  cardiolipin synthetase  27.59 
 
 		 486 aa  46.2  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0493  phospholipase D, putative  29.94 
 
 		 553 aa  46.2  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  30 
 
 		 451 aa  46.2  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4096  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.32 
 
 		 413 aa  45.8  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0796  phospholipase D/transphosphatidylase  31.54 
 
 		 562 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829142  normal  0.0553202 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1045  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.78 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1869  cardiolipin synthetase domain-containing protein  24.29 
 
 		 403 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  25.79 
 
 		 376 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0208  putative phospholipase D  31.17 
 
 		 550 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1383  putative phospholipase D  31.17 
 
 		 550 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0239  putative phospholipase D  31.17 
 
 		 550 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1580  putative phospholipase D  31.17 
 
 		 550 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2702  phospholipase D family protein  31.17 
 
 		 550 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4980  phospholipase D/transphosphatidylase  28.89 
 
 		 538 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0978  phospholipase D, putative  31.17 
 
 		 595 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2558  phospholipase D family protein  30.52 
 
 		 550 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140702  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.12 
 
 		 349 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  30.14 
 
 		 176 aa  43.1  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2292  cardiolipin synthetase  26.21 
 
 		 486 aa  42.7  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1991  cardiolipin synthetase  26.21 
 
 		 486 aa  42.7  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24820  cardiolipin synthase 2  26.83 
 
 		 363 aa  42.7  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868846  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  30.37 
 
 		 481 aa  42.4  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1918  cardiolipin synthetase domain protein  24.29 
 
 		 403 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0228  phospholipase D/transphosphatidylase  27.42 
 
 		 267 aa  42.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122659 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  26.9 
 
 		 486 aa  42  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2063  cardiolipin synthetase  26.9 
 
 		 486 aa  42  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  26.9 
 
 		 486 aa  42  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2295  cardiolipin synthetase  25.9 
 
 		 486 aa  42  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>