205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0290 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  100 
 
 		 176 aa  364  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  54.97 
 
 		 169 aa  183  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  51.72 
 
 		 193 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  53.76 
 
 		 183 aa  181  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  54.12 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  51.19 
 
 		 183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  53.05 
 
 		 207 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  53.05 
 
 		 207 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  53.05 
 
 		 207 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  53.05 
 
 		 207 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  53.05 
 
 		 207 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  53.05 
 
 		 207 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  53.05 
 
 		 223 aa  167  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  49.11 
 
 		 242 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  50.91 
 
 		 245 aa  165  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  49.11 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  49.39 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  49.39 
 
 		 207 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  49.39 
 
 		 207 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  49.39 
 
 		 242 aa  157  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  47.31 
 
 		 180 aa  155  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  44.38 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  44.87 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  39.33 
 
 		 186 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  44.38 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  42.04 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  35.36 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  38.19 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  36.23 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  36.23 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  35.14 
 
 		 213 aa  99  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  38.19 
 
 		 234 aa  99.4  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  31.41 
 
 		 404 aa  99  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  35.14 
 
 		 213 aa  99  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  38.46 
 
 		 194 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  32.76 
 
 		 176 aa  96.3  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  38.51 
 
 		 189 aa  96.3  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  38.31 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6196  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  38.46 
 
 		 203 aa  96.3  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477108  normal  0.875629 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  36.81 
 
 		 176 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  35.97 
 
 		 758 aa  92  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  35.16 
 
 		 196 aa  90.1  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  34.87 
 
 		 252 aa  87.8  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  32.3 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  34.25 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  40 
 
 		 208 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.64 
 
 		 196 aa  84.7  6e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  35.29 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  32.6 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  37.5 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.4 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  34.87 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  31.82 
 
 		 392 aa  78.6  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  33.79 
 
 		 376 aa  77.4  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.5 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30.92 
 
 		 229 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  27.61 
 
 		 487 aa  72  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.44 
 
 		 363 aa  72  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  29.45 
 
 		 481 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  33.97 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  29.76 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  29.76 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  27.46 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0525  phospholipase D/transphosphatidylase  28.28 
 
 		 203 aa  60.8  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7357  hypothetical protein  39.47 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000600434  normal  0.754367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4695  nuclease-related protein  26.83 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.33 
 
 		 484 aa  57.8  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0357  phospholipase D family protein  31.4 
 
 		 359 aa  57  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.217708  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1010  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.35 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.680316  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1297  phospholipase D/transphosphatidylase  33.06 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  26.4 
 
 		 467 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0213  phospholipase D/transphosphatidylase  35.07 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.387625  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02951  hypothetical protein  26.97 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  26.81 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3340  phospholipase D/transphosphatidylase  26.55 
 
 		 575 aa  54.3  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.014748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3572  phospholipase D/transphosphatidylase  30.89 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3119  hypothetical protein  33.33 
 
 		 383 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274638  hitchhiker  0.00609959 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  28.97 
 
 		 472 aa  53.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1868  phospholipase D/transphosphatidylase  26.83 
 
 		 300 aa  52  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.705897  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  25.15 
 
 		 545 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  25.15 
 
 		 545 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3503  phospholipase D/transphosphatidylase  29.73 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000511387  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  27.81 
 
 		 545 aa  50.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  31.93 
 
 		 484 aa  49.7  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0482  phospholipase D/transphosphatidylase  25.75 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.858411  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1319  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  25.18 
 
 		 219 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4017  phospholipase D/transphosphatidylase  31.09 
 
 		 451 aa  48.5  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000999569 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0354  phospholipase D/transphosphatidylase  26.71 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00184279 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1027  phospholipase D/transphosphatidylase  27.61 
 
 		 184 aa  48.5  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422314  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3755  hypothetical protein  27.66 
 
 		 451 aa  48.5  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563494  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  32.89 
 
 		 478 aa  48.5  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0252  phospholipase D/transphosphatidylase  33.06 
 
 		 356 aa  48.5  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1565  phospholipase D/transphosphatidylase  26.71 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  22.4 
 
 		 543 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2290  phospholipase D/transphosphatidylase  33.33 
 
 		 427 aa  48.1  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  hitchhiker  0.000316655 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  25.55 
 
 		 286 aa  48.1  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0432  phospholipase D family protein  28.83 
 
 		 311 aa  48.1  0.00007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  34.13 
 
 		 420 aa  47.8  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  26.28 
 
 		 286 aa  47.8  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  24.58 
 
 		 479 aa  47.4  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>