More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0865 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1551  cardiolipin synthetase  58.26 
 
 
547 aa  659    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000970599  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0865  cardiolipin synthetase  100 
 
 
589 aa  1219    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000163382 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1732  cardiolipin synthetase  57.51 
 
 
555 aa  650    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000620411  normal  0.647101 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  36.71 
 
 
532 aa  335  1e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3316  cardiolipin synthetase  35.16 
 
 
492 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2292  cardiolipin synthetase  34.87 
 
 
486 aa  312  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1930  cardiolipin synthetase  34.28 
 
 
486 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.608673  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1991  cardiolipin synthetase  34.69 
 
 
486 aa  311  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1873  cardiolipin synthetase  34.28 
 
 
486 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1406  cardiolipin synthetase  34.28 
 
 
486 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.202549  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1588  cardiolipin synthetase  34.28 
 
 
486 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1867  cardiolipin synthetase  34.28 
 
 
486 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01223  cardiolipin synthetase  33.57 
 
 
486 aa  310  5e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.081482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2399  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.57 
 
 
486 aa  310  5e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0519529  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1397  cardiolipin synthetase  33.57 
 
 
486 aa  310  5e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.620611  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1891  cardiolipin synthetase  33.57 
 
 
486 aa  310  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0254745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1358  cardiolipin synthetase  33.57 
 
 
486 aa  310  5e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000070923  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2379  cardiolipin synthetase  33.57 
 
 
486 aa  310  5e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173283  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01233  hypothetical protein  33.57 
 
 
486 aa  310  5e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1735  cardiolipin synthetase  33.39 
 
 
486 aa  309  9e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0392497  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2689  cardiolipin synthetase  34.71 
 
 
486 aa  309  9e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.087528  hitchhiker  0.00198607 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1418  cardiolipin synthetase  33.39 
 
 
486 aa  307  3e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.183618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  33.98 
 
 
486 aa  307  4.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  33.98 
 
 
486 aa  307  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2063  cardiolipin synthetase  33.98 
 
 
486 aa  306  9.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2295  cardiolipin synthetase  33.39 
 
 
486 aa  295  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2189  cardiolipin synthetase  34.43 
 
 
486 aa  293  6e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1948  cardiolipin synthetase  33.7 
 
 
486 aa  282  9e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  30.13 
 
 
484 aa  235  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  29.45 
 
 
489 aa  211  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1986  phospholipase D/transphosphatidylase  28.14 
 
 
475 aa  197  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477384  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4302  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.67 
 
 
491 aa  194  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000415539  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  28.84 
 
 
476 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2290  cardiolipin synthetase  35.29 
 
 
485 aa  190  8e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189738  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1579  cardiolipin synthetase  40.16 
 
 
484 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.643479  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2320  cardiolipin synthetase  48.33 
 
 
490 aa  182  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.254629  hitchhiker  0.00334531 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2240  cardiolipin synthetase  36.67 
 
 
485 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02693  cardiolipin synthetase  34.12 
 
 
484 aa  177  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  26.71 
 
 
509 aa  177  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  26.53 
 
 
509 aa  177  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  26.53 
 
 
509 aa  177  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  26.35 
 
 
509 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  26.35 
 
 
509 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  33.81 
 
 
484 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  25.95 
 
 
509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.58 
 
 
492 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  26.09 
 
 
509 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  36.15 
 
 
491 aa  174  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  48.31 
 
 
484 aa  174  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  35.27 
 
 
492 aa  172  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  26.35 
 
 
509 aa  171  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  26.17 
 
 
509 aa  170  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  27.24 
 
 
476 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  26.22 
 
 
499 aa  168  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  29.57 
 
 
488 aa  167  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0305  cardiolipin synthetase  37.09 
 
 
483 aa  166  1.0000000000000001e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0281725  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0385  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.05 
 
 
508 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0354  cardiolipin synthetase  25.91 
 
 
511 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00517773  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  25.69 
 
 
483 aa  162  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0345  cardiolipin synthetase  25.32 
 
 
511 aa  162  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1396  phospholipase D/transphosphatidylase  25.62 
 
 
514 aa  160  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.704033  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0829  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  25.58 
 
 
495 aa  160  6e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00137347  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  29.15 
 
 
494 aa  157  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  29.15 
 
 
494 aa  157  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  44.51 
 
 
478 aa  156  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1291  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.09 
 
 
509 aa  153  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1793  phospholipase D/transphosphatidylase  23.39 
 
 
497 aa  153  8e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.734015  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.75 
 
 
482 aa  153  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1412  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.9 
 
 
517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0222  putative cardiolipin synthetase  25.55 
 
 
497 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3949  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.31 
 
 
472 aa  146  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3636  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.09 
 
 
479 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2457  phospholipase D/transphosphatidylase  22.63 
 
 
517 aa  144  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000591951  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0548  cardiolipin synthase  40.66 
 
 
467 aa  144  6e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0483  phospholipase D/transphosphatidylase  40.66 
 
 
467 aa  144  6e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2373  phospholipase D/transphosphatidylase  32.68 
 
 
479 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3849  cardiolipin synthetase 2  42.51 
 
 
491 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.45957  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2049  cardiolipin synthetase 2  32.3 
 
 
479 aa  140  8.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0781048  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  23.51 
 
 
486 aa  139  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08050  cardiolipin synthetase 2  42.78 
 
 
495 aa  139  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283071  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1387  cardiolipin synthetase 2  23.28 
 
 
477 aa  138  3.0000000000000003e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1113  phospholipase D/transphosphatidylase  33.97 
 
 
478 aa  137  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5195  cardiolipin synthetase domain-containing protein  27.36 
 
 
397 aa  137  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5046  cardiolipin synthetase domain-containing protein  27.36 
 
 
397 aa  137  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.560279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5591  cardiolipin synthetase domain-containing protein  27.36 
 
 
397 aa  137  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5524  cardiolipin synthetase domain protein  27.1 
 
 
397 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5477  cardiolipin synthetase domain-containing protein  26.86 
 
 
397 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5439  cardiolipin synthetase domain protein  27.36 
 
 
397 aa  137  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.443747 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5030  cardiolipin synthetase domain-containing protein  27.36 
 
 
397 aa  137  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3346  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.27 
 
 
395 aa  136  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000729556  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  40.78 
 
 
484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0582  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.88 
 
 
486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  24.17 
 
 
487 aa  135  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5144  phospholipase D/transphosphatidylase  27.54 
 
 
397 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.8 
 
 
485 aa  133  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  26.07 
 
 
396 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  23.55 
 
 
485 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1682  phospholipase D/transphosphatidylase  24.04 
 
 
474 aa  131  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.16 
 
 
483 aa  131  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4114  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.33 
 
 
467 aa  130  9.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0831123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>