More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1396 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1396  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 514 aa  1056    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.704033  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0354  cardiolipin synthetase  58.51 
 
 		 511 aa  625  1e-178  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00517773  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0345  cardiolipin synthetase  58.51 
 
 		 511 aa  624  1e-177  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1291  phospholipase D/Transphosphatidylase  57.32 
 
 		 509 aa  608  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2457  phospholipase D/transphosphatidylase  48.65 
 
 		 517 aa  486  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000591951  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1412  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.34 
 
 		 517 aa  390  1e-107  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0429  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.7 
 
 		 530 aa  383  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1054  cardiolipin synthetase  41.33 
 
 		 531 aa  377  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.549629  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1279  cardiolipin synthetase  42.89 
 
 		 449 aa  368  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.624146  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1331  phospholipase D/transphosphatidylase  38.26 
 
 		 519 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000112238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  33.41 
 
 		 514 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  33.41 
 
 		 514 aa  265  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  33.41 
 
 		 514 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  33.41 
 
 		 514 aa  265  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  33.41 
 
 		 514 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  33.41 
 
 		 514 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  34.04 
 
 		 502 aa  263  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  33.19 
 
 		 514 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  32.31 
 
 		 514 aa  262  8e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  32.97 
 
 		 514 aa  262  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  32.35 
 
 		 502 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  32.97 
 
 		 514 aa  259  7e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  32.75 
 
 		 514 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  32.04 
 
 		 509 aa  250  5e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  30.89 
 
 		 509 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  30.89 
 
 		 509 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  31.43 
 
 		 509 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  31.43 
 
 		 509 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  31.22 
 
 		 509 aa  247  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  30.92 
 
 		 509 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  30.92 
 
 		 509 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  31.43 
 
 		 509 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  30.93 
 
 		 509 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.65 
 
 		 541 aa  243  5e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  30.19 
 
 		 485 aa  237  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  32.25 
 
 		 490 aa  232  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  31 
 
 		 472 aa  229  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  30.6 
 
 		 499 aa  228  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  28.57 
 
 		 487 aa  228  2e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.67 
 
 		 483 aa  226  9e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.74 
 
 		 478 aa  225  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  32.03 
 
 		 476 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.01 
 
 		 477 aa  224  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  32.55 
 
 		 477 aa  224  4e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  31.82 
 
 		 476 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  31.09 
 
 		 483 aa  223  8e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  29 
 
 		 482 aa  222  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.91 
 
 		 492 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.2 
 
 		 485 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  29.54 
 
 		 505 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  31.94 
 
 		 488 aa  215  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  29.54 
 
 		 505 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  32.96 
 
 		 494 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  32.96 
 
 		 494 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  30.61 
 
 		 480 aa  212  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0093  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.89 
 
 		 463 aa  211  3e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325157 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl626  cardiolipin synthetase  29.57 
 
 		 521 aa  210  5e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2322  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.41 
 
 		 498 aa  208  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.822451  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1793  phospholipase D/transphosphatidylase  29.05 
 
 		 497 aa  207  3e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.734015  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0582  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.87 
 
 		 486 aa  207  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0829  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.1 
 
 		 495 aa  207  4e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00137347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2033  cardiolipin synthetase  28.57 
 
 		 484 aa  206  9e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0028874  hitchhiker  0.0000142083 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30.39 
 
 		 484 aa  206  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  30.86 
 
 		 470 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.16 
 
 		 481 aa  203  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2866  phospholipase D/transphosphatidylase  27.08 
 
 		 482 aa  201  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0748  cardiolipin synthetase  31.4 
 
 		 483 aa  201  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.83977  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0735  cardiolipin synthetase  31.18 
 
 		 483 aa  200  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00981982  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.1 
 
 		 526 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.33 
 
 		 486 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  28.33 
 
 		 490 aa  197  6e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0385  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.74 
 
 		 508 aa  194  4e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  26.48 
 
 		 474 aa  194  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  26.6 
 
 		 481 aa  193  5e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  27.41 
 
 		 484 aa  193  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  27.31 
 
 		 473 aa  191  4e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  27.82 
 
 		 481 aa  190  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  25.73 
 
 		 482 aa  190  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  27 
 
 		 486 aa  190  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  26.71 
 
 		 481 aa  189  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1097  phospholipase D/transphosphatidylase  29.1 
 
 		 486 aa  189  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  26.02 
 
 		 477 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  26.02 
 
 		 477 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  26.27 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  26.27 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  26.27 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  26.27 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  26.27 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  26.16 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  26.27 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  25.16 
 
 		 481 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  25.11 
 
 		 479 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  26.32 
 
 		 479 aa  187  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  26.36 
 
 		 479 aa  187  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  25.74 
 
 		 479 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1211  cardiolipin synthetase  28.04 
 
 		 489 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.298817  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1821  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.44 
 
 		 486 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3316  cardiolipin synthetase  26.43 
 
 		 492 aa  184  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.02 
 
 		 490 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  25.96 
 
 		 479 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>