115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2403 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2403  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 		 586 aa  1137    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.103504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1906  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.08 
 
 		 536 aa  380  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.279209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0718  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.49 
 
 		 551 aa  357  3.9999999999999996e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1506  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.78 
 
 		 622 aa  354  2.9999999999999997e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2427  phospholipase-like protein  40.1 
 
 		 620 aa  343  5e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.926405  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0629  hypothetical protein  29.93 
 
 		 550 aa  145  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2347  phospholipase D/transphosphatidylase  28.65 
 
 		 559 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  29.47 
 
 		 556 aa  137  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2595  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.03 
 
 		 560 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2448  phospholipase D/transphosphatidylase  30.28 
 
 		 558 aa  127  6e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0308  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.08 
 
 		 611 aa  108  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0808  Phospholipase D  24.77 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0604  phospholipase D/transphosphatidylase  24.71 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  28.18 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0878  phospholipase D/transphosphatidylase  26.22 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  28.3 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3474  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.09 
 
 		 577 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.365967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.9 
 
 		 489 aa  58.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  25.36 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.3 
 
 		 541 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  30.64 
 
 		 479 aa  56.6  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3949  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.84 
 
 		 472 aa  56.2  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.56 
 
 		 487 aa  57  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03233  cardiolipin synthase  29.53 
 
 		 472 aa  56.2  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0270  phospholipase D  24.76 
 
 		 299 aa  56.2  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.97 
 
 		 526 aa  55.5  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56410  putative phospholipase  28.87 
 
 		 359 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  26.6 
 
 		 386 aa  54.3  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1024  phospholipase D family protein  25.84 
 
 		 422 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  24.43 
 
 		 467 aa  54.3  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0892  phospholipase family protein  28.31 
 
 		 385 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2066  cardiolipin synthetase  29.45 
 
 		 479 aa  51.2  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.941706  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  29.45 
 
 		 479 aa  51.2  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  27.5 
 
 		 385 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  33.54 
 
 		 491 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.8 
 
 		 430 aa  50.4  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1296  phospholipase D/transphosphatidylase  26.38 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3413  hypothetical protein  26.8 
 
 		 961 aa  50.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0649675  normal  0.019371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4459  phospholipase  27.92 
 
 		 385 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335011  hitchhiker  0.000764366 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.7 
 
 		 487 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.53 
 
 		 484 aa  50.1  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  33.07 
 
 		 489 aa  49.3  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1712  phospholipase D/transphosphatidylase  26.39 
 
 		 545 aa  49.3  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0931  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.72 
 
 		 385 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  26.52 
 
 		 484 aa  49.3  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  36.59 
 
 		 490 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  26.97 
 
 		 491 aa  48.5  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1408  conserved hypothetical cardiolipin synthase  23.64 
 
 		 299 aa  48.5  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1716  GTP-binding protein  23.64 
 
 		 299 aa  48.5  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.866049  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  27.74 
 
 		 479 aa  47.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2012  cardiolipin synthetase  30.28 
 
 		 479 aa  47.8  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  28.65 
 
 		 213 aa  47.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  28.65 
 
 		 213 aa  47.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  36.59 
 
 		 223 aa  47.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  26.8 
 
 		 401 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  35.48 
 
 		 481 aa  47.4  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  27.56 
 
 		 183 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  36.59 
 
 		 207 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  28.83 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  27.91 
 
 		 545 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3471  phospholipase D/transphosphatidylase  29.54 
 
 		 471 aa  47  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.169298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  36.59 
 
 		 207 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  36.59 
 
 		 207 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  36.59 
 
 		 207 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  36.59 
 
 		 207 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  36.59 
 
 		 207 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  26.35 
 
 		 492 aa  46.6  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3151  cardiolipin synthase 2  25.86 
 
 		 401 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  24.92 
 
 		 486 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  24.92 
 
 		 486 aa  46.6  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2063  cardiolipin synthetase  24.92 
 
 		 486 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  25.88 
 
 		 483 aa  47  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  27.91 
 
 		 545 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2360  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.17 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6043  cardiolipin synthetase  29.05 
 
 		 479 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2034  cardiolipin synthetase  29.05 
 
 		 479 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4507  phospholipase D/transphosphatidylase  26.37 
 
 		 372 aa  46.2  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0482  phospholipase D/transphosphatidylase  28.7 
 
 		 191 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.858411  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0041  phospholipase D/transphosphatidylase  28.3 
 
 		 196 aa  45.8  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0711  phospholipase D/transphosphatidylase  22.92 
 
 		 294 aa  45.8  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  29.05 
 
 		 479 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0483  phospholipase D/transphosphatidylase  26.53 
 
 		 467 aa  45.8  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  25.75 
 
 		 486 aa  45.8  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.52 
 
 		 486 aa  46.2  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.11 
 
 		 474 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  33.64 
 
 		 234 aa  45.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  28.05 
 
 		 197 aa  45.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0354  phospholipase D/transphosphatidylase  28.7 
 
 		 191 aa  45.4  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00184279 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2240  cardiolipin synthetase  23.35 
 
 		 485 aa  45.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.21 
 
 		 477 aa  45.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0548  cardiolipin synthase  26.53 
 
 		 467 aa  45.4  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.09 
 
 		 196 aa  45.4  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  26.92 
 
 		 169 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  28.66 
 
 		 180 aa  44.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  27.89 
 
 		 467 aa  45.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.57 
 
 		 492 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3068  phospholipase D/transphosphatidylase  37.88 
 
 		 394 aa  44.7  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478794  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1167  phospholipase D/transphosphatidylase  27.87 
 
 		 537 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.613652 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.1 
 
 		 483 aa  44.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3636  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.65 
 
 		 479 aa  44.7  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>