79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0232 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0232  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
282 aa  565  1e-160  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0919591  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0711  phospholipase D/transphosphatidylase  48.57 
 
 
294 aa  273  3e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  33.21 
 
 
286 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  32.14 
 
 
286 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1010  phospholipase D/Transphosphatidylase  20.08 
 
 
366 aa  53.9  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.680316  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1868  phospholipase D/transphosphatidylase  26.85 
 
 
300 aa  53.9  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.705897  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  30.71 
 
 
177 aa  52.8  0.000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  21.48 
 
 
467 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  20.48 
 
 
363 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0357  phospholipase D family protein  23.27 
 
 
359 aa  50.8  0.00003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.217708  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  24.22 
 
 
472 aa  50.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0440  phospholipase D family protein  22.71 
 
 
439 aa  49.3  0.00006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  24.34 
 
 
481 aa  48.9  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  24.53 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  26.52 
 
 
183 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.82 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  26.81 
 
 
196 aa  47.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0432  phospholipase D family protein  24.39 
 
 
311 aa  47.8  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  25.6 
 
 
175 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0436  phospholipase D family protein  24.23 
 
 
394 aa  47.4  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.356752  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  27.48 
 
 
234 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2427  phospholipase-like protein  20.06 
 
 
620 aa  46.6  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.926405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1179  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.97 
 
 
247 aa  46.6  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02951  hypothetical protein  23.29 
 
 
260 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  24.03 
 
 
487 aa  46.2  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  23.93 
 
 
213 aa  46.2  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  23.93 
 
 
213 aa  46.2  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  28.47 
 
 
205 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  28.8 
 
 
190 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  25.35 
 
 
219 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  25.58 
 
 
162 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  30 
 
 
184 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4909  putative phospholipase  29.81 
 
 
385 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0402008  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0041  phospholipase D/transphosphatidylase  29.53 
 
 
196 aa  45.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  20.22 
 
 
393 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56410  putative phospholipase  29.81 
 
 
359 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  25.35 
 
 
194 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  27.36 
 
 
208 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  31.58 
 
 
386 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  29.06 
 
 
509 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  29.06 
 
 
509 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1296  phospholipase D/transphosphatidylase  29.82 
 
 
385 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293816  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  20.31 
 
 
376 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  20.07 
 
 
404 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0546  hypothetical protein  33.68 
 
 
161 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283484  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  28.81 
 
 
509 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  25.19 
 
 
758 aa  43.5  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1263  hypothetical protein  33.68 
 
 
161 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0540209  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0525  phospholipase D/transphosphatidylase  31.07 
 
 
203 aa  43.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  29.06 
 
 
509 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  29.06 
 
 
509 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0607  hypothetical protein  33.68 
 
 
161 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1459  hypothetical protein  33.68 
 
 
181 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.59537  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  29.06 
 
 
509 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1297  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.97 
 
 
453 aa  43.5  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.641599  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  29.06 
 
 
509 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  29.06 
 
 
509 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1592  hypothetical protein  33.68 
 
 
201 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0447  phospholipase D family protein  21.89 
 
 
358 aa  43.1  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1489  hypothetical protein  33.68 
 
 
201 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0931  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.03 
 
 
385 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  25.6 
 
 
223 aa  43.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1565  phospholipase D/transphosphatidylase  47.06 
 
 
191 aa  42.7  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4459  phospholipase  28.95 
 
 
385 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335011  hitchhiker  0.000764366 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0354  phospholipase D/transphosphatidylase  47.06 
 
 
191 aa  42.7  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00184279 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  27.91 
 
 
207 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  27.91 
 
 
207 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  27.91 
 
 
207 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  27.91 
 
 
223 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  27.91 
 
 
207 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  27.91 
 
 
207 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  27.91 
 
 
207 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  30.43 
 
 
176 aa  42.4  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  30.43 
 
 
176 aa  42.4  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  27.42 
 
 
188 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  23.91 
 
 
479 aa  42.4  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  28.21 
 
 
509 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  28.21 
 
 
509 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  20.85 
 
 
430 aa  42  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>