111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5407 on replicon NC_012851
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  100 
 
 		 188 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  95.74 
 
 		 190 aa  370  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  44.94 
 
 		 213 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  44.94 
 
 		 213 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  39.26 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  37.41 
 
 		 234 aa  97.1  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  35.39 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  37.65 
 
 		 252 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  36.21 
 
 		 219 aa  87.8  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  34.47 
 
 		 205 aa  86.3  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  38.82 
 
 		 245 aa  86.3  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  37.16 
 
 		 175 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  39.47 
 
 		 207 aa  85.5  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  39.47 
 
 		 242 aa  85.5  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  31.48 
 
 		 183 aa  84.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  38.82 
 
 		 207 aa  84.3  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  38.26 
 
 		 223 aa  84.3  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  35.1 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  38.16 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  38.16 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  38.16 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.77 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  37.5 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  33.73 
 
 		 758 aa  79.7  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  34.27 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  30.63 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  37.58 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  40 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  37.58 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  37.58 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  37.58 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  37.58 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  37.58 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2796  hypothetical protein  37.93 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0198268  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  32.89 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0795  hypothetical protein  38.67 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.689612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1276  hypothetical protein  38.67 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180189  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  36.73 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  32.21 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  30.97 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  33.54 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1592  hypothetical protein  40.58 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1489  hypothetical protein  40.58 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  37.12 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1263  hypothetical protein  40.58 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0540209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0607  hypothetical protein  40.58 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1459  hypothetical protein  40.58 
 
 		 181 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.59537  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0546  hypothetical protein  40.58 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283484  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  33.12 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  35.81 
 
 		 392 aa  72.8  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  29.93 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1248  hypothetical protein  38.51 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11619 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  33.12 
 
 		 189 aa  72  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  35.62 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  35.29 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1166  hypothetical protein  36.41 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.112926 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.35 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4419  hypothetical protein  37.84 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.429401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  31.1 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  30.95 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1154  hypothetical protein  35.87 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15532  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  28.28 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  32.06 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  32.06 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6196  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  32.16 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477108  normal  0.875629 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2043  hypothetical protein  34.46 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.08 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  29.05 
 
 		 393 aa  61.6  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  34.88 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.11 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  30.14 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.58 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.38 
 
 		 484 aa  52.8  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4695  nuclease-related protein  29.93 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_002620  TC0432  phospholipase D family protein  32.41 
 
 		 311 aa  52  0.000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  28.35 
 
 		 234 aa  52  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0213  phospholipase D/transphosphatidylase  33.83 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.387625  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0440  phospholipase D family protein  32.76 
 
 		 439 aa  50.8  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  31.2 
 
 		 481 aa  49.3  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1571  hypothetical protein  36.51 
 
 		 561 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411121  normal  0.0104962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  25.43 
 
 		 528 aa  48.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  25.44 
 
 		 545 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  28.19 
 
 		 487 aa  47.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0525  phospholipase D/transphosphatidylase  30.17 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1297  phospholipase D/transphosphatidylase  30.88 
 
 		 355 aa  47  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  32.82 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0629  hypothetical protein  26.14 
 
 		 550 aa  46.2  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2595  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.57 
 
 		 560 aa  46.2  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1319  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  25 
 
 		 219 aa  45.1  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  22.77 
 
 		 543 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  27.52 
 
 		 482 aa  44.7  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  24.85 
 
 		 545 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  46.67 
 
 		 739 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0711  phospholipase D/transphosphatidylase  27.69 
 
 		 294 aa  43.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  46.67 
 
 		 739 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37710  Cardiolipin synthase protein  34.59 
 
 		 386 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0357  phospholipase D family protein  23.38 
 
 		 359 aa  42.7  0.003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.217708  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2448  phospholipase D/transphosphatidylase  28.1 
 
 		 558 aa  42.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1986  phospholipase D/transphosphatidylase  33.06 
 
 		 475 aa  42.4  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0232  phospholipase D/transphosphatidylase  27.42 
 
 		 282 aa  42.4  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0919591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>