44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1248 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1248  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.11619 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0795  hypothetical protein  97.11 
 
 
173 aa  310  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.689612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1276  hypothetical protein  97.11 
 
 
173 aa  310  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180189  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1166  hypothetical protein  86.13 
 
 
173 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.112926 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1154  hypothetical protein  85.55 
 
 
173 aa  268  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15532  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4419  hypothetical protein  89.6 
 
 
173 aa  254  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.429401  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2043  hypothetical protein  79.77 
 
 
173 aa  240  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0546  hypothetical protein  50.31 
 
 
161 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283484  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0607  hypothetical protein  50.31 
 
 
161 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1263  hypothetical protein  50.31 
 
 
161 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0540209  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1459  hypothetical protein  50.31 
 
 
181 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.59537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1592  hypothetical protein  50.31 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1489  hypothetical protein  50.31 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2796  hypothetical protein  50.6 
 
 
210 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0198268  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  38.26 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  38.51 
 
 
188 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  27.61 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  33.59 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  33.59 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  31.58 
 
 
184 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  28.46 
 
 
175 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  30.46 
 
 
176 aa  58.5  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  30.46 
 
 
176 aa  58.5  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  26.72 
 
 
234 aa  57.8  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  27.81 
 
 
162 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  30.13 
 
 
758 aa  53.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  29.45 
 
 
186 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  25.87 
 
 
404 aa  47.4  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  28.14 
 
 
219 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  29.23 
 
 
196 aa  46.6  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  26.54 
 
 
193 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1506  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.84 
 
 
622 aa  45.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  20.47 
 
 
177 aa  44.3  0.0009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  25 
 
 
196 aa  43.9  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  25.53 
 
 
183 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  27.78 
 
 
189 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2427  phospholipase-like protein  29.69 
 
 
620 aa  43.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.926405  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  27.78 
 
 
194 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  27.78 
 
 
176 aa  42.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  28.06 
 
 
189 aa  42.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  29.35 
 
 
487 aa  42  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  28.68 
 
 
197 aa  42  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.23 
 
 
386 aa  42  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1906  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.79 
 
 
536 aa  40.8  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.279209  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>