57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1154 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1154  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  337  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15532  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1166  hypothetical protein  99.42 
 
 		 173 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.112926 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1276  hypothetical protein  86.71 
 
 		 173 aa  269  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180189  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0795  hypothetical protein  86.71 
 
 		 173 aa  269  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.689612  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1248  hypothetical protein  85.55 
 
 		 173 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11619 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2043  hypothetical protein  85.55 
 
 		 173 aa  263  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4419  hypothetical protein  91.91 
 
 		 173 aa  261  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.429401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1459  hypothetical protein  51.55 
 
 		 181 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.59537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1592  hypothetical protein  51.55 
 
 		 201 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1489  hypothetical protein  51.55 
 
 		 201 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2796  hypothetical protein  49.71 
 
 		 210 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0198268  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0546  hypothetical protein  51.25 
 
 		 161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283484  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0607  hypothetical protein  51.25 
 
 		 161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1263  hypothetical protein  51.25 
 
 		 161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0540209  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  35.87 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  35.87 
 
 		 190 aa  80.9  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  33.59 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  33.59 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  27.61 
 
 		 176 aa  67.4  0.00000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  30.12 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  33.33 
 
 		 176 aa  62  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  33.33 
 
 		 176 aa  62  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  29.24 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  31.52 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  30.12 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  29.56 
 
 		 758 aa  54.3  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  29.44 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  29.45 
 
 		 186 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  25.75 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  27.13 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  28.87 
 
 		 404 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.17 
 
 		 386 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  34.94 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  23.39 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.44 
 
 		 196 aa  48.1  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  30.22 
 
 		 223 aa  48.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  27.27 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  28.16 
 
 		 176 aa  44.3  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  26.88 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  29.41 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1506  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.68 
 
 		 622 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  29.86 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0232  phospholipase D/transphosphatidylase  22.96 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0919591  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  31.13 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  26.97 
 
 		 180 aa  42.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3572  phospholipase D/transphosphatidylase  30.08 
 
 		 180 aa  42.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  22.38 
 
 		 376 aa  42.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  28.78 
 
 		 207 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  28.78 
 
 		 207 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  28.78 
 
 		 207 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  28.78 
 
 		 207 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  28.78 
 
 		 207 aa  42  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  28.78 
 
 		 223 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  28.78 
 
 		 207 aa  42  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  29.14 
 
 		 245 aa  41.6  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  26.8 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  27.17 
 
 		 487 aa  40.8  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>