201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2331 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  100 
 
 		 189 aa  380  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  97.35 
 
 		 194 aa  348  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  86.75 
 
 		 189 aa  292  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  50.31 
 
 		 197 aa  164  8e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  43.4 
 
 		 184 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  43.4 
 
 		 213 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  43.4 
 
 		 213 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  32.26 
 
 		 176 aa  119  3.9999999999999996e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  39.19 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  38.78 
 
 		 203 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.37 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  39.73 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  39.73 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  38.36 
 
 		 207 aa  104  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  38.75 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  38.36 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  38.75 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  38.36 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  38.75 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  38.99 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  38.95 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  39.66 
 
 		 186 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  31.69 
 
 		 177 aa  94  1e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  36.48 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  37.11 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  36.48 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  36.48 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  36.48 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  36.48 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  36.48 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  35.93 
 
 		 175 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  35.85 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  35 
 
 		 219 aa  90.5  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  32.35 
 
 		 169 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  32.35 
 
 		 183 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  32.89 
 
 		 180 aa  86.3  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  33.33 
 
 		 184 aa  85.1  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  30.77 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  31.47 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  29.63 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  32.65 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  31.07 
 
 		 404 aa  79.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  37.21 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.48 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  32.63 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  34.69 
 
 		 758 aa  78.2  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  26.88 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.26 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  32.09 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  32.77 
 
 		 392 aa  67.8  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  29.05 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  31.03 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  27.15 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  29.66 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3095  hypothetical protein  33.33 
 
 		 548 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.71 
 
 		 363 aa  62  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  31.78 
 
 		 196 aa  62  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.75 
 
 		 252 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3378  hypothetical protein  54.9 
 
 		 575 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6196  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  26.54 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477108  normal  0.875629 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.11 
 
 		 484 aa  59.3  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  30.53 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  29.69 
 
 		 481 aa  55.8  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1592  hypothetical protein  35.43 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3425  hypothetical protein  46.3 
 
 		 569 aa  55.1  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1459  hypothetical protein  36.26 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.59537  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1489  hypothetical protein  35.43 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  29.32 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5186  hypothetical protein  35.82 
 
 		 558 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  27.74 
 
 		 393 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  28.12 
 
 		 487 aa  52.4  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0711  phospholipase D/transphosphatidylase  27.87 
 
 		 294 aa  52.4  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.94 
 
 		 386 aa  52  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2796  hypothetical protein  32.22 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0198268  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  32.08 
 
 		 556 aa  51.6  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1263  hypothetical protein  36.81 
 
 		 161 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0540209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0607  hypothetical protein  36.81 
 
 		 161 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0546  hypothetical protein  36.81 
 
 		 161 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283484  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  27.82 
 
 		 286 aa  51.2  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6541  hypothetical protein  49.02 
 
 		 715 aa  51.6  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.322515 
 
 
-
 
NC_002620  TC0432  phospholipase D family protein  28.87 
 
 		 311 aa  51.2  0.000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07550  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase  34.13 
 
 		 410 aa  51.2  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.76587 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1906  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.96 
 
 		 536 aa  50.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.279209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  31.88 
 
 		 424 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1319  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.71 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4096  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.06 
 
 		 413 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0890  hypothetical protein  26.44 
 
 		 600 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  27.92 
 
 		 492 aa  50.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2817  phospholipase D/transphosphatidylase  33.6 
 
 		 412 aa  49.3  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230147  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  31.88 
 
 		 424 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3641  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.67 
 
 		 384 aa  49.3  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.823276  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  28.49 
 
 		 403 aa  48.5  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0565  hypothetical protein  49.02 
 
 		 659 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.29 
 
 		 430 aa  48.1  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3012  hypothetical protein  23.98 
 
 		 591 aa  47.8  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1571  hypothetical protein  24.42 
 
 		 561 aa  47.8  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411121  normal  0.0104962 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.07 
 
 		 349 aa  47.8  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  33.07 
 
 		 479 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  33.07 
 
 		 479 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.07 
 
 		 481 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>