60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1592 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1489  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  394  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1592  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  394  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1459  hypothetical protein  99.45 
 
 
181 aa  346  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.59537  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0607  hypothetical protein  99.38 
 
 
161 aa  307  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1263  hypothetical protein  99.38 
 
 
161 aa  307  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0540209  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0546  hypothetical protein  99.38 
 
 
161 aa  307  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283484  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2796  hypothetical protein  85.43 
 
 
210 aa  298  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0198268  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1154  hypothetical protein  50.62 
 
 
173 aa  121  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15532  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1166  hypothetical protein  50.62 
 
 
173 aa  121  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.112926 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4419  hypothetical protein  51.97 
 
 
173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.429401  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1248  hypothetical protein  50.31 
 
 
173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.11619 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0795  hypothetical protein  50.94 
 
 
173 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.689612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1276  hypothetical protein  50.94 
 
 
173 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180189  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2043  hypothetical protein  51.25 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  40.58 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  40.58 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  36.64 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  36.64 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  35.46 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  37.14 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  26.67 
 
 
176 aa  63.5  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  30.66 
 
 
758 aa  60.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  38.69 
 
 
189 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  39.71 
 
 
194 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  32.21 
 
 
207 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  32.21 
 
 
242 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  32.59 
 
 
245 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  33.33 
 
 
189 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  32.33 
 
 
207 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  32.33 
 
 
207 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  32.33 
 
 
207 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  32.33 
 
 
242 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  28.89 
 
 
184 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  26.61 
 
 
162 aa  54.3  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  30.94 
 
 
223 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  36.47 
 
 
176 aa  52.4  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  36.47 
 
 
176 aa  52.4  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  23.29 
 
 
177 aa  52.4  0.000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0232  phospholipase D/transphosphatidylase  29.63 
 
 
282 aa  50.4  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0919591  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  30.66 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  30.66 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  30.66 
 
 
223 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  30.66 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  30.66 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  30.66 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  30.66 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  28.67 
 
 
219 aa  48.9  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  26.11 
 
 
183 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.48 
 
 
198 aa  47.8  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  31.63 
 
 
203 aa  46.6  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  28.68 
 
 
183 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  28.68 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  30.77 
 
 
176 aa  47.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.67 
 
 
196 aa  46.2  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  26.85 
 
 
193 aa  45.4  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  28.37 
 
 
180 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0711  phospholipase D/transphosphatidylase  29.03 
 
 
294 aa  44.3  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  37.08 
 
 
197 aa  43.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.97 
 
 
386 aa  42.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  32.23 
 
 
481 aa  41.2  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>