135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4982 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  100 
 
 
252 aa  517  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  40 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  40 
 
 
162 aa  106  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  39.01 
 
 
177 aa  106  4e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  37.91 
 
 
207 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  36.65 
 
 
175 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  38.16 
 
 
207 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  38.16 
 
 
242 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  37.91 
 
 
242 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  37.91 
 
 
207 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  37.91 
 
 
207 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  33.96 
 
 
219 aa  95.1  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  37.25 
 
 
245 aa  94.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  37.84 
 
 
183 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  37.84 
 
 
169 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  36.42 
 
 
183 aa  92  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  37.25 
 
 
207 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  37.25 
 
 
207 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  37.25 
 
 
207 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  37.25 
 
 
207 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  37.25 
 
 
207 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  37.25 
 
 
207 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  38.04 
 
 
190 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  37.25 
 
 
223 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  33.54 
 
 
180 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  35.1 
 
 
193 aa  90.5  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  34.01 
 
 
208 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  36.65 
 
 
186 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  37.65 
 
 
188 aa  89.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  33.52 
 
 
213 aa  88.2  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  35.95 
 
 
223 aa  88.2  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  34.87 
 
 
176 aa  87.8  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  33.52 
 
 
213 aa  88.2  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  34.64 
 
 
758 aa  87  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  34.81 
 
 
184 aa  85.1  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6196  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  35.62 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477108  normal  0.875629 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.55 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  37.06 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  29.03 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  34 
 
 
393 aa  72  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  33.57 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  30.28 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  32.06 
 
 
176 aa  68.6  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  30.99 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  37.29 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  29.79 
 
 
404 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  32.67 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.26 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  31.34 
 
 
176 aa  65.1  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  31.34 
 
 
176 aa  65.1  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.08 
 
 
198 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  28.29 
 
 
234 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  28.32 
 
 
194 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  32.2 
 
 
184 aa  62  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  27.5 
 
 
189 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  27.56 
 
 
203 aa  62  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4695  nuclease-related protein  31.58 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  27.71 
 
 
189 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  29.94 
 
 
392 aa  59.3  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.71 
 
 
386 aa  58.9  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.76 
 
 
363 aa  58.5  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1716  GTP-binding protein  30.88 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.866049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1408  conserved hypothetical cardiolipin synthase  30.88 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5144  phospholipase D/transphosphatidylase  29.53 
 
 
397 aa  56.2  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1010  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.65 
 
 
366 aa  55.8  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.680316  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0270  phospholipase D  31.62 
 
 
299 aa  55.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1868  phospholipase D/transphosphatidylase  28.17 
 
 
300 aa  55.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.705897  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7357  hypothetical protein  35.11 
 
 
219 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000600434  normal  0.754367 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5439  cardiolipin synthetase domain protein  29.66 
 
 
397 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.443747 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5046  cardiolipin synthetase domain-containing protein  29.66 
 
 
397 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.560279  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5524  cardiolipin synthetase domain protein  29.66 
 
 
397 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5030  cardiolipin synthetase domain-containing protein  29.66 
 
 
397 aa  52.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5477  cardiolipin synthetase domain-containing protein  29.53 
 
 
397 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30.71 
 
 
349 aa  52.4  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  25.14 
 
 
545 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  25.14 
 
 
545 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  34.26 
 
 
420 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  30 
 
 
151 aa  52  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5195  cardiolipin synthetase domain-containing protein  28.97 
 
 
397 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5591  cardiolipin synthetase domain-containing protein  28.97 
 
 
397 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  25.69 
 
 
487 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2290  phospholipase D/transphosphatidylase  35.4 
 
 
427 aa  52  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  hitchhiker  0.000316655 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  27.81 
 
 
481 aa  51.6  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1297  phospholipase D/transphosphatidylase  31.03 
 
 
355 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1319  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.11 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  25.53 
 
 
286 aa  50.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0525  phospholipase D/transphosphatidylase  27.75 
 
 
203 aa  50.4  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0222  putative cardiolipin synthetase  28.24 
 
 
497 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.32 
 
 
476 aa  49.7  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  25.53 
 
 
286 aa  49.3  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  28.57 
 
 
458 aa  49.3  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0232  phospholipase D/transphosphatidylase  24.53 
 
 
282 aa  48.1  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0919591  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  21.05 
 
 
543 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0644  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  24.14 
 
 
193 aa  48.5  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524645  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3962  cardiolipin synthetase 2  30.09 
 
 
470 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123365  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2007  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  35.38 
 
 
585 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.3 
 
 
445 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3867  phospholipase D/transphosphatidylase  25.5 
 
 
397 aa  47  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  28.03 
 
 
486 aa  46.6  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  30.71 
 
 
420 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>