49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4634 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5163  phospholipase D/transphosphatidylase  98.15 
 
 		 593 aa  1181    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.111415 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3447  phospholipase D/transphosphatidylase  87.69 
 
 		 613 aa  1050    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1640  phospholipase D domain-containing protein  76.92 
 
 		 601 aa  888    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1993  phospholipase D/transphosphatidylase  77.09 
 
 		 601 aa  890    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2088  phospholipase D/transphosphatidylase  77.42 
 
 		 601 aa  920    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0687  hypothetical protein  76.92 
 
 		 601 aa  888    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128998  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4994  phospholipase D/transphosphatidylase  90.47 
 
 		 598 aa  1097    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.328627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0575  hypothetical protein  76.92 
 
 		 601 aa  888    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.577633  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5274  phospholipase D/transphosphatidylase  91.3 
 
 		 598 aa  1103    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4634  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 593 aa  1202    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3093  phospholipase D/transphosphatidylase  91.3 
 
 		 598 aa  1103    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3012  hypothetical protein  71.26 
 
 		 591 aa  861    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0890  hypothetical protein  76.38 
 
 		 600 aa  873    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6987  phospholipase D/Transphosphatidylase  72.45 
 
 		 590 aa  862    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0376  phospholipase D/transphosphatidylase  90.12 
 
 		 597 aa  1095    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0503  phospholipase D  77.09 
 
 		 601 aa  890    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0772  hypothetical protein  76.92 
 
 		 601 aa  888    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3095  hypothetical protein  29.12 
 
 		 548 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3425  hypothetical protein  27.45 
 
 		 569 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46540  hypothetical protein  26.52 
 
 		 566 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000624793  hitchhiker  0.00000317179 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3378  hypothetical protein  28.29 
 
 		 575 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3340  phospholipase D/transphosphatidylase  26.24 
 
 		 575 aa  115  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.014748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2486  hypothetical protein  28.87 
 
 		 585 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5186  hypothetical protein  27.39 
 
 		 558 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1571  hypothetical protein  25.74 
 
 		 561 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411121  normal  0.0104962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6541  hypothetical protein  25.04 
 
 		 715 aa  105  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.322515 
 
 
-
 
NC_002950  PG1291  hypothetical protein  24.65 
 
 		 575 aa  101  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4092  hypothetical protein  28.57 
 
 		 589 aa  90.5  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0681122  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3979  hypothetical protein  28.57 
 
 		 589 aa  90.5  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04805  hypothetical protein  40.22 
 
 		 165 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207481  normal  0.316155 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  29.83 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  26.17 
 
 		 545 aa  68.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  29.57 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  27.42 
 
 		 528 aa  63.9  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  26.78 
 
 		 545 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  26.78 
 
 		 545 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  24.11 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0565  hypothetical protein  24.72 
 
 		 659 aa  61.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  27.56 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  27.05 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  26.45 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2007  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  26.67 
 
 		 585 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  27.03 
 
 		 392 aa  48.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  26.15 
 
 		 184 aa  44.7  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.09 
 
 		 386 aa  45.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  40.74 
 
 		 194 aa  44.7  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  42.11 
 
 		 543 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  40.74 
 
 		 189 aa  44.3  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  37.7 
 
 		 151 aa  44.3  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>