41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3979 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_3979  hypothetical protein  100 
 
 		 589 aa  1208    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4092  hypothetical protein  100 
 
 		 589 aa  1208    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0681122  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46540  hypothetical protein  35.02 
 
 		 566 aa  323  5e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000624793  hitchhiker  0.00000317179 
 
 
-
 
NC_003296  RS04805  hypothetical protein  80.92 
 
 		 165 aa  224  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207481  normal  0.316155 
 
 
-
 
NC_002950  PG1291  hypothetical protein  29.77 
 
 		 575 aa  213  1e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2486  hypothetical protein  30.16 
 
 		 585 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3340  phospholipase D/transphosphatidylase  31 
 
 		 575 aa  196  7e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.014748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2088  phospholipase D/transphosphatidylase  28.24 
 
 		 601 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6987  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.61 
 
 		 590 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0890  hypothetical protein  28.36 
 
 		 600 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3095  hypothetical protein  26.39 
 
 		 548 aa  126  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0503  phospholipase D  28.24 
 
 		 601 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1993  phospholipase D/transphosphatidylase  28.24 
 
 		 601 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1640  phospholipase D domain-containing protein  28.24 
 
 		 601 aa  125  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0772  hypothetical protein  28.24 
 
 		 601 aa  125  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0687  hypothetical protein  28.24 
 
 		 601 aa  125  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128998  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0575  hypothetical protein  28.24 
 
 		 601 aa  125  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.577633  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3447  phospholipase D/transphosphatidylase  27.38 
 
 		 613 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3425  hypothetical protein  24.34 
 
 		 569 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4994  phospholipase D/transphosphatidylase  26.59 
 
 		 598 aa  113  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.328627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5274  phospholipase D/transphosphatidylase  26.35 
 
 		 598 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3093  phospholipase D/transphosphatidylase  26.35 
 
 		 598 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0376  phospholipase D/transphosphatidylase  26.43 
 
 		 597 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3012  hypothetical protein  27.3 
 
 		 591 aa  100  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1571  hypothetical protein  24.43 
 
 		 561 aa  97.8  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411121  normal  0.0104962 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3378  hypothetical protein  25.75 
 
 		 575 aa  92.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5163  phospholipase D/transphosphatidylase  28.44 
 
 		 593 aa  91.3  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.111415 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4634  phospholipase D/transphosphatidylase  28.88 
 
 		 593 aa  90.5  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5186  hypothetical protein  22.8 
 
 		 558 aa  90.1  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  20.83 
 
 		 545 aa  67.4  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  20.87 
 
 		 545 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6541  hypothetical protein  26.05 
 
 		 715 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.322515 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  22.04 
 
 		 543 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  23.47 
 
 		 487 aa  52  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1454  hypothetical protein  22.79 
 
 		 473 aa  51.6  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0565  hypothetical protein  41.67 
 
 		 659 aa  51.2  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  23.43 
 
 		 528 aa  50.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  23.71 
 
 		 376 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  25.27 
 
 		 467 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.22 
 
 		 386 aa  45.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  24.2 
 
 		 472 aa  45.4  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>