45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A1640 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0890  hypothetical protein  92.35 
 
 
600 aa  1077    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3447  phospholipase D/transphosphatidylase  76.25 
 
 
613 aa  916    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964936  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0575  hypothetical protein  100 
 
 
601 aa  1215    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.577633  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5274  phospholipase D/transphosphatidylase  76.92 
 
 
598 aa  928    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0687  hypothetical protein  100 
 
 
601 aa  1215    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128998  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4634  phospholipase D/transphosphatidylase  76.92 
 
 
593 aa  904    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2088  phospholipase D/transphosphatidylase  99.5 
 
 
601 aa  1206    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3093  phospholipase D/transphosphatidylase  76.92 
 
 
598 aa  928    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3012  hypothetical protein  67.73 
 
 
591 aa  823    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4994  phospholipase D/transphosphatidylase  76.92 
 
 
598 aa  928    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.328627  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5163  phospholipase D/transphosphatidylase  77.3 
 
 
593 aa  899    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.111415 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0376  phospholipase D/transphosphatidylase  76.79 
 
 
597 aa  931    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0503  phospholipase D  99.83 
 
 
601 aa  1212    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6987  phospholipase D/Transphosphatidylase  69.57 
 
 
590 aa  837    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0772  hypothetical protein  100 
 
 
601 aa  1215    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1993  phospholipase D/transphosphatidylase  99.83 
 
 
601 aa  1212    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1640  phospholipase D domain-containing protein  100 
 
 
601 aa  1215    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3095  hypothetical protein  29.46 
 
 
548 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5186  hypothetical protein  29.41 
 
 
558 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500471  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4092  hypothetical protein  28.39 
 
 
589 aa  128  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0681122  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3979  hypothetical protein  28.39 
 
 
589 aa  128  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3425  hypothetical protein  27.24 
 
 
569 aa  128  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46540  hypothetical protein  25.53 
 
 
566 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000624793  hitchhiker  0.00000317179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6541  hypothetical protein  26.94 
 
 
715 aa  123  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.322515 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3378  hypothetical protein  25.78 
 
 
575 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2486  hypothetical protein  28.87 
 
 
585 aa  110  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1571  hypothetical protein  25.88 
 
 
561 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411121  normal  0.0104962 
 
 
-
 
NC_002950  PG1291  hypothetical protein  25 
 
 
575 aa  86.7  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  27.3 
 
 
545 aa  71.2  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  29.66 
 
 
479 aa  69.7  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  26.16 
 
 
467 aa  67  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_003296  RS04805  hypothetical protein  36 
 
 
165 aa  64.7  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207481  normal  0.316155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3340  phospholipase D/transphosphatidylase  48.44 
 
 
575 aa  64.7  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.014748  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  25.17 
 
 
545 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  28.97 
 
 
472 aa  63.5  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  25.17 
 
 
545 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  25.18 
 
 
376 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0565  hypothetical protein  25.69 
 
 
659 aa  60.1  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  25.55 
 
 
393 aa  57  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  26.6 
 
 
528 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2007  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  27.76 
 
 
585 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  25.62 
 
 
404 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02951  hypothetical protein  24.81 
 
 
260 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  24.88 
 
 
184 aa  45.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  22.3 
 
 
543 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>