40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0565 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0565  hypothetical protein  100 
 
 
659 aa  1357    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6541  hypothetical protein  35.29 
 
 
715 aa  272  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.322515 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3378  hypothetical protein  27.65 
 
 
575 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3095  hypothetical protein  27.68 
 
 
548 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1571  hypothetical protein  24.62 
 
 
561 aa  82.4  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411121  normal  0.0104962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3425  hypothetical protein  23.4 
 
 
569 aa  75.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3012  hypothetical protein  25.99 
 
 
591 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4634  phospholipase D/transphosphatidylase  25.28 
 
 
593 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0376  phospholipase D/transphosphatidylase  24.56 
 
 
597 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6987  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.42 
 
 
590 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4994  phospholipase D/transphosphatidylase  23.62 
 
 
598 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.328627  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3340  phospholipase D/transphosphatidylase  25.67 
 
 
575 aa  67.4  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.014748  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2088  phospholipase D/transphosphatidylase  26.13 
 
 
601 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3447  phospholipase D/transphosphatidylase  23.76 
 
 
613 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964936  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5274  phospholipase D/transphosphatidylase  24.65 
 
 
598 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3093  phospholipase D/transphosphatidylase  24.65 
 
 
598 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0890  hypothetical protein  25.62 
 
 
600 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5163  phospholipase D/transphosphatidylase  24.55 
 
 
593 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.111415 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0503  phospholipase D  25.99 
 
 
601 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1993  phospholipase D/transphosphatidylase  25.99 
 
 
601 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0575  hypothetical protein  25.99 
 
 
601 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.577633  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0772  hypothetical protein  25.99 
 
 
601 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1640  phospholipase D domain-containing protein  25.99 
 
 
601 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0687  hypothetical protein  25.99 
 
 
601 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128998  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2486  hypothetical protein  24.22 
 
 
585 aa  60.5  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5186  hypothetical protein  28.85 
 
 
558 aa  58.2  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500471  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46540  hypothetical protein  22.31 
 
 
566 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000624793  hitchhiker  0.00000317179 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4092  hypothetical protein  22.72 
 
 
589 aa  54.7  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0681122  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3979  hypothetical protein  22.72 
 
 
589 aa  54.7  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1291  hypothetical protein  40.91 
 
 
575 aa  52.8  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  30.63 
 
 
194 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  51.02 
 
 
189 aa  48.9  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  36.67 
 
 
197 aa  48.5  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  51.02 
 
 
189 aa  48.1  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  26.87 
 
 
176 aa  45.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  22 
 
 
481 aa  45.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  43.75 
 
 
184 aa  45.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  40 
 
 
213 aa  43.9  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  40 
 
 
213 aa  43.9  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_003296  RS04805  hypothetical protein  30.21 
 
 
165 aa  43.9  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207481  normal  0.316155 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>