39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6541 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6541  hypothetical protein  100 
 
 		 715 aa  1462    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.322515 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0565  hypothetical protein  35.52 
 
 		 659 aa  243  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3378  hypothetical protein  30.02 
 
 		 575 aa  197  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5186  hypothetical protein  28.45 
 
 		 558 aa  158  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3425  hypothetical protein  27.64 
 
 		 569 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1571  hypothetical protein  25.33 
 
 		 561 aa  134  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411121  normal  0.0104962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3095  hypothetical protein  28.69 
 
 		 548 aa  125  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2088  phospholipase D/transphosphatidylase  26.94 
 
 		 601 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0503  phospholipase D  26.77 
 
 		 601 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0772  hypothetical protein  26.77 
 
 		 601 aa  118  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0575  hypothetical protein  26.77 
 
 		 601 aa  118  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.577633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0687  hypothetical protein  26.77 
 
 		 601 aa  118  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128998  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1993  phospholipase D/transphosphatidylase  26.77 
 
 		 601 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1640  phospholipase D domain-containing protein  26.77 
 
 		 601 aa  118  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6987  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.05 
 
 		 590 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3447  phospholipase D/transphosphatidylase  25.95 
 
 		 613 aa  112  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0890  hypothetical protein  26.23 
 
 		 600 aa  107  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3012  hypothetical protein  26.54 
 
 		 591 aa  107  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0376  phospholipase D/transphosphatidylase  24.96 
 
 		 597 aa  98.2  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4634  phospholipase D/transphosphatidylase  25.16 
 
 		 593 aa  97.8  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5274  phospholipase D/transphosphatidylase  25.78 
 
 		 598 aa  95.5  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3093  phospholipase D/transphosphatidylase  25.78 
 
 		 598 aa  95.5  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4994  phospholipase D/transphosphatidylase  25.43 
 
 		 598 aa  94  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.328627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2486  hypothetical protein  25.75 
 
 		 585 aa  85.9  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3340  phospholipase D/transphosphatidylase  23.51 
 
 		 575 aa  81.6  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.014748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46540  hypothetical protein  22.38 
 
 		 566 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000624793  hitchhiker  0.00000317179 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5163  phospholipase D/transphosphatidylase  24.94 
 
 		 593 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.111415 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3979  hypothetical protein  26.28 
 
 		 589 aa  61.6  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4092  hypothetical protein  26.28 
 
 		 589 aa  61.6  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0681122  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_002950  PG1291  hypothetical protein  26.67 
 
 		 575 aa  57  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  51.02 
 
 		 189 aa  52  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  49.02 
 
 		 194 aa  51.6  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  39.66 
 
 		 197 aa  51.6  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  49.02 
 
 		 189 aa  51.2  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  25.52 
 
 		 404 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  45.83 
 
 		 184 aa  49.3  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  23.67 
 
 		 481 aa  47.8  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  25.31 
 
 		 545 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  27.24 
 
 		 545 aa  44.3  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>