47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1291 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1291  hypothetical protein  100 
 
 
575 aa  1197    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3340  phospholipase D/transphosphatidylase  53.67 
 
 
575 aa  621  1e-176  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.014748  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2486  hypothetical protein  49.66 
 
 
585 aa  551  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46540  hypothetical protein  34.62 
 
 
566 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000624793  hitchhiker  0.00000317179 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4092  hypothetical protein  29.77 
 
 
589 aa  213  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0681122  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3979  hypothetical protein  29.77 
 
 
589 aa  213  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6987  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.51 
 
 
590 aa  123  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3012  hypothetical protein  26.05 
 
 
591 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3095  hypothetical protein  25.41 
 
 
548 aa  109  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3447  phospholipase D/transphosphatidylase  25.41 
 
 
613 aa  107  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964936  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0376  phospholipase D/transphosphatidylase  24.46 
 
 
597 aa  100  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1571  hypothetical protein  23.42 
 
 
561 aa  99.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411121  normal  0.0104962 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5274  phospholipase D/transphosphatidylase  24.65 
 
 
598 aa  97.8  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3093  phospholipase D/transphosphatidylase  24.65 
 
 
598 aa  97.8  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4994  phospholipase D/transphosphatidylase  24.33 
 
 
598 aa  97.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.328627  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4634  phospholipase D/transphosphatidylase  24.65 
 
 
593 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5163  phospholipase D/transphosphatidylase  24.87 
 
 
593 aa  93.6  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.111415 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3378  hypothetical protein  24.02 
 
 
575 aa  89  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2088  phospholipase D/transphosphatidylase  25 
 
 
601 aa  88.2  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1993  phospholipase D/transphosphatidylase  24.83 
 
 
601 aa  88.2  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0503  phospholipase D  24.83 
 
 
601 aa  88.2  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0575  hypothetical protein  24.83 
 
 
601 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.577633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0687  hypothetical protein  24.83 
 
 
601 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128998  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1640  phospholipase D domain-containing protein  24.83 
 
 
601 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0772  hypothetical protein  24.83 
 
 
601 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0890  hypothetical protein  25.09 
 
 
600 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04805  hypothetical protein  35.48 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207481  normal  0.316155 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  24.77 
 
 
376 aa  70.1  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3425  hypothetical protein  23.15 
 
 
569 aa  68.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  25.58 
 
 
393 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6541  hypothetical protein  26.3 
 
 
715 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.322515 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  26.37 
 
 
545 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0565  hypothetical protein  40.91 
 
 
659 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  22.64 
 
 
467 aa  50.4  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5186  hypothetical protein  28.7 
 
 
558 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500471  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  30.77 
 
 
184 aa  49.3  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  27.5 
 
 
186 aa  48.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  25.24 
 
 
545 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  25.24 
 
 
545 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  24.07 
 
 
487 aa  47.4  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  25.69 
 
 
176 aa  45.8  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  36 
 
 
479 aa  45.4  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.39 
 
 
363 aa  45.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  21.8 
 
 
472 aa  44.7  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  28 
 
 
196 aa  43.9  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2007  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  26.18 
 
 
585 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.44 
 
 
386 aa  43.5  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>