47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0890 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5163  phospholipase D/transphosphatidylase  76.72 
 
 
593 aa  880    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.111415 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3447  phospholipase D/transphosphatidylase  75.37 
 
 
613 aa  894    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964936  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1640  phospholipase D domain-containing protein  92.51 
 
 
601 aa  1096    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1993  phospholipase D/transphosphatidylase  92.68 
 
 
601 aa  1098    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2088  phospholipase D/transphosphatidylase  92.35 
 
 
601 aa  1120    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0687  hypothetical protein  92.51 
 
 
601 aa  1096    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128998  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4994  phospholipase D/transphosphatidylase  75.71 
 
 
598 aa  905    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.328627  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0575  hypothetical protein  92.51 
 
 
601 aa  1096    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.577633  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5274  phospholipase D/transphosphatidylase  75.71 
 
 
598 aa  905    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4634  phospholipase D/transphosphatidylase  76.38 
 
 
593 aa  884    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3093  phospholipase D/transphosphatidylase  75.71 
 
 
598 aa  905    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3012  hypothetical protein  66.83 
 
 
591 aa  812    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0890  hypothetical protein  100 
 
 
600 aa  1210    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6987  phospholipase D/Transphosphatidylase  69.68 
 
 
590 aa  835    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0376  phospholipase D/transphosphatidylase  75.71 
 
 
597 aa  912    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0503  phospholipase D  92.68 
 
 
601 aa  1098    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0772  hypothetical protein  92.51 
 
 
601 aa  1096    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3095  hypothetical protein  27.63 
 
 
548 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3425  hypothetical protein  27.48 
 
 
569 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3979  hypothetical protein  27.81 
 
 
589 aa  130  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4092  hypothetical protein  27.81 
 
 
589 aa  130  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0681122  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5186  hypothetical protein  29.95 
 
 
558 aa  124  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500471  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46540  hypothetical protein  25.35 
 
 
566 aa  118  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000624793  hitchhiker  0.00000317179 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3378  hypothetical protein  26.1 
 
 
575 aa  118  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1571  hypothetical protein  26.05 
 
 
561 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411121  normal  0.0104962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6541  hypothetical protein  26.4 
 
 
715 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.322515 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2486  hypothetical protein  28.42 
 
 
585 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1291  hypothetical protein  25.09 
 
 
575 aa  84  0.000000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3340  phospholipase D/transphosphatidylase  25.26 
 
 
575 aa  83.2  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.014748  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04805  hypothetical protein  31.9 
 
 
165 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207481  normal  0.316155 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  28.28 
 
 
479 aa  64.7  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0565  hypothetical protein  25 
 
 
659 aa  64.3  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  24.73 
 
 
376 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  26.71 
 
 
467 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  27.65 
 
 
545 aa  61.6  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  27.8 
 
 
472 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  25.76 
 
 
545 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  25.76 
 
 
545 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  24.45 
 
 
393 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  49.12 
 
 
404 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  25.93 
 
 
528 aa  50.4  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2007  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  27.76 
 
 
585 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  26.63 
 
 
189 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  26.92 
 
 
194 aa  47.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  24.74 
 
 
184 aa  45.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.76 
 
 
363 aa  44.7  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  40.35 
 
 
543 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>