51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6987 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5163  phospholipase D/transphosphatidylase  72.62 
 
 		 593 aa  848    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.111415 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3447  phospholipase D/transphosphatidylase  73.64 
 
 		 613 aa  884    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1640  phospholipase D domain-containing protein  69.57 
 
 		 601 aa  820    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1993  phospholipase D/transphosphatidylase  69.73 
 
 		 601 aa  822    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2088  phospholipase D/transphosphatidylase  69.73 
 
 		 601 aa  843    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0687  hypothetical protein  69.57 
 
 		 601 aa  820    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128998  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0575  hypothetical protein  69.57 
 
 		 601 aa  820    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.577633  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5274  phospholipase D/transphosphatidylase  72.85 
 
 		 598 aa  880    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4634  phospholipase D/transphosphatidylase  72.45 
 
 		 593 aa  850    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4994  phospholipase D/transphosphatidylase  72.18 
 
 		 598 aa  874    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.328627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3093  phospholipase D/transphosphatidylase  72.85 
 
 		 598 aa  880    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6987  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 		 590 aa  1218    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3012  hypothetical protein  92.39 
 
 		 591 aa  1117    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0890  hypothetical protein  69.35 
 
 		 600 aa  820    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0376  phospholipase D/transphosphatidylase  72.47 
 
 		 597 aa  877    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0503  phospholipase D  69.73 
 
 		 601 aa  822    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0772  hypothetical protein  69.57 
 
 		 601 aa  820    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3095  hypothetical protein  27.79 
 
 		 548 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5186  hypothetical protein  28.69 
 
 		 558 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3425  hypothetical protein  27.3 
 
 		 569 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2486  hypothetical protein  29.05 
 
 		 585 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46540  hypothetical protein  26.36 
 
 		 566 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000624793  hitchhiker  0.00000317179 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3979  hypothetical protein  25.61 
 
 		 589 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4092  hypothetical protein  25.61 
 
 		 589 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0681122  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_002950  PG1291  hypothetical protein  26.51 
 
 		 575 aa  124  7e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1571  hypothetical protein  27.78 
 
 		 561 aa  123  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411121  normal  0.0104962 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3378  hypothetical protein  27.27 
 
 		 575 aa  115  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6541  hypothetical protein  26.03 
 
 		 715 aa  114  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.322515 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3340  phospholipase D/transphosphatidylase  26.02 
 
 		 575 aa  111  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.014748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  27.61 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_003296  RS04805  hypothetical protein  38.89 
 
 		 165 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207481  normal  0.316155 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  28.43 
 
 		 545 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  27.16 
 
 		 528 aa  68.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  28.88 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  26.17 
 
 		 472 aa  66.6  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0565  hypothetical protein  24.49 
 
 		 659 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  25.27 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  27.42 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  25.85 
 
 		 545 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  25.51 
 
 		 545 aa  60.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2007  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  29.19 
 
 		 585 aa  57.4  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02951  hypothetical protein  25.58 
 
 		 260 aa  55.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  25.36 
 
 		 404 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  49.3  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  22.03 
 
 		 286 aa  48.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  44.44 
 
 		 184 aa  47.8  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  23.73 
 
 		 543 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  21.75 
 
 		 487 aa  47.4  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  22.03 
 
 		 286 aa  47  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  41.38 
 
 		 177 aa  43.9  0.008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  20.45 
 
 		 234 aa  43.9  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>