65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0644 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0644  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  100 
 
 
193 aa  399  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524645  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1319  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  52.7 
 
 
219 aa  155  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4695  nuclease-related protein  38.56 
 
 
206 aa  106  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  28.39 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  29.1 
 
 
196 aa  59.7  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.04 
 
 
196 aa  57.4  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.07 
 
 
229 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.88 
 
 
363 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  28.48 
 
 
205 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  26.32 
 
 
183 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  29.87 
 
 
219 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  23.53 
 
 
193 aa  52.4  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  28.87 
 
 
176 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  27.42 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  31.61 
 
 
487 aa  49.3  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  24.14 
 
 
252 aa  48.5  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  23.03 
 
 
186 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  22.38 
 
 
230 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  24.49 
 
 
169 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  27.61 
 
 
208 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  26.09 
 
 
176 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  26.09 
 
 
176 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  24.31 
 
 
183 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  28.47 
 
 
481 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  30.53 
 
 
376 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.77 
 
 
484 aa  44.7  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  26.96 
 
 
758 aa  45.1  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  30.77 
 
 
487 aa  44.7  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  25.75 
 
 
242 aa  44.7  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  21.68 
 
 
230 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  20.98 
 
 
404 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  25.66 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  30 
 
 
420 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1682  phospholipase D/transphosphatidylase  26.11 
 
 
474 aa  43.9  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  23.97 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0440  phospholipase D family protein  25.81 
 
 
439 aa  44.3  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  25.75 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0432  phospholipase D family protein  25 
 
 
311 aa  43.9  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  31.3 
 
 
393 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1868  phospholipase D/transphosphatidylase  25.93 
 
 
300 aa  43.9  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.705897  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  25.55 
 
 
286 aa  43.5  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  25.75 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  24.11 
 
 
286 aa  43.1  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  27.15 
 
 
177 aa  42.7  0.003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6196  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.14 
 
 
203 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477108  normal  0.875629 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.83 
 
 
430 aa  42.4  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  25.68 
 
 
207 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_002620  TC0433  phospholipase D family protein  25.78 
 
 
448 aa  42.4  0.004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.395138  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.33 
 
 
420 aa  42  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.2 
 
 
386 aa  42.4  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  25.5 
 
 
207 aa  42  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  25.5 
 
 
207 aa  42  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  25.5 
 
 
207 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  25.5 
 
 
207 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.31 
 
 
476 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  25.5 
 
 
207 aa  42  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  25.5 
 
 
207 aa  42  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  25.5 
 
 
223 aa  42  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  25.5 
 
 
223 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.62 
 
 
349 aa  41.6  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0911  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.12 
 
 
485 aa  41.2  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000528236 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  25.68 
 
 
207 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  23.32 
 
 
545 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  25.68 
 
 
242 aa  41.2  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  27.74 
 
 
481 aa  41.2  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>