16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2978 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2978  hypothetical protein  100 
 
 
531 aa  1101    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3413  hypothetical protein  30.91 
 
 
961 aa  210  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0649675  normal  0.019371 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5459  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.76 
 
 
534 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146903  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3474  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.67 
 
 
577 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.365967  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  24.68 
 
 
556 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214347  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2347  phospholipase D/transphosphatidylase  22.33 
 
 
559 aa  67  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0629  hypothetical protein  22.69 
 
 
550 aa  62.8  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2448  phospholipase D/transphosphatidylase  21.75 
 
 
558 aa  56.6  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1506  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.29 
 
 
622 aa  50.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46540  hypothetical protein  29.41 
 
 
566 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000624793  hitchhiker  0.00000317179 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0308  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.11 
 
 
611 aa  48.5  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2595  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.04 
 
 
560 aa  47.8  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0718  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.56 
 
 
551 aa  47.8  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0525  phospholipase D/transphosphatidylase  26.67 
 
 
203 aa  47  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13850  predicted protein  27.43 
 
 
440 aa  45.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.144632  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4685  hypothetical protein  38.89 
 
 
389 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192913  normal  0.0818693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>