13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4685 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4685  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  741    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192913  normal  0.0818693 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0329  hypothetical protein  26.02 
 
 
594 aa  63.5  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0312  hypothetical protein  26.53 
 
 
594 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0080  hypothetical protein  23.08 
 
 
336 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.723937  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6760  hypothetical protein  30.2 
 
 
331 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2104  hypothetical protein  30.77 
 
 
334 aa  50.8  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2406  hypothetical protein  26.71 
 
 
348 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0114  hypothetical protein  33.88 
 
 
164 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0101503  hitchhiker  0.00333564 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2978  hypothetical protein  36.25 
 
 
531 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0191  hypothetical protein  24.81 
 
 
182 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1844  hypothetical protein  22.56 
 
 
346 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0423  hypothetical protein  31.62 
 
 
337 aa  44.3  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21680  hypothetical protein  27.78 
 
 
335 aa  42.7  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.2828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>