23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1844 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1844  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  704    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2406  hypothetical protein  63.11 
 
 		 348 aa  424  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1318  hypothetical protein  39.77 
 
 		 332 aa  205  9e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.444184  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2433  hypothetical protein  39.13 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21680  hypothetical protein  36.83 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.2828  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0200  hypothetical protein  39.41 
 
 		 333 aa  178  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0423  hypothetical protein  38.42 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2104  hypothetical protein  37.35 
 
 		 334 aa  166  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0080  hypothetical protein  37.83 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.723937  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0177  hypothetical protein  42.06 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022221 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3215  hypothetical protein  40.24 
 
 		 379 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000550519  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3934  hypothetical protein  35.84 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0257  hypothetical protein  41.11 
 
 		 332 aa  106  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  hitchhiker  0.00111717 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4513  hypothetical protein  35.56 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0114  hypothetical protein  37.25 
 
 		 164 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0101503  hitchhiker  0.00333564 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6760  hypothetical protein  29.63 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0191  hypothetical protein  33.51 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2650  hypothetical protein  32.87 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5160  hypothetical protein  31.34 
 
 		 523 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417539  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1569  hypothetical protein  28.1 
 
 		 353 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2993  hypothetical protein  25.2 
 
 		 511 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.300626  normal  0.564635 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3440  hypothetical protein  25.59 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00117447  normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4685  hypothetical protein  22.56 
 
 		 389 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192913  normal  0.0818693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>