122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4898 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1175  hypothetical protein  82.55 
 
 		 532 aa  780    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1192  hypothetical protein  82.55 
 
 		 529 aa  779    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1523  hypothetical protein  86.89 
 
 		 522 aa  835    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1202  hypothetical protein  82.55 
 
 		 529 aa  779    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.344019  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4898  hypothetical protein  100 
 
 		 531 aa  1035    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.834206  normal  0.0834013 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13428  hypothetical protein  74.25 
 
 		 527 aa  714    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0923  hypothetical protein  58.13 
 
 		 527 aa  539  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1747  hypothetical protein  55.54 
 
 		 536 aa  524  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3156  UMUC domain protein DNA-repair protein  49.53 
 
 		 510 aa  417  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000974062  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3467  DNA-repair protein  49.72 
 
 		 528 aa  394  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  normal  0.0126488 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3240  hypothetical protein  49.91 
 
 		 524 aa  365  1e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488053  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2945  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  42.86 
 
 		 505 aa  352  8.999999999999999e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.000000598538  decreased coverage  0.00000434939 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2039  hypothetical protein  41.7 
 
 		 581 aa  330  6e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.566112  normal  0.522751 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2288  DNA-repair protein  41.99 
 
 		 562 aa  317  4e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0994  hypothetical protein  40.66 
 
 		 527 aa  298  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21280  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  42.29 
 
 		 553 aa  293  6e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00165363  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15750  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  38.83 
 
 		 589 aa  280  6e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0334276  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1440  hypothetical protein  46.36 
 
 		 549 aa  278  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1896  putative DNA-directed DNA polymerase  39.56 
 
 		 520 aa  278  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.582074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5241  hypothetical protein  41.36 
 
 		 535 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0112063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1186  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  33.51 
 
 		 549 aa  226  6e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00000707508  normal  0.0119021 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1612  putative DNA-directed DNA polymerase  29.94 
 
 		 517 aa  72.8  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2256  hypothetical protein  24.78 
 
 		 501 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1120  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  27.46 
 
 		 515 aa  70.5  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4054  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  25.19 
 
 		 526 aa  69.3  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  26.84 
 
 		 471 aa  68.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  26.72 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2986  putative DNA-directed DNA polymerase  26.79 
 
 		 529 aa  68.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  25.45 
 
 		 477 aa  67  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3073  DNA-directed DNA polymerase  30.3 
 
 		 414 aa  67  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2667  hypothetical protein  24.74 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  24.76 
 
 		 471 aa  64.7  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  24.68 
 
 		 409 aa  63.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  26.6 
 
 		 525 aa  62  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.31 
 
 		 499 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  27.54 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1732  hypothetical protein  24.28 
 
 		 490 aa  60.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0965901  hitchhiker  0.00613419 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  26.29 
 
 		 407 aa  59.7  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2005  hypothetical protein  24.37 
 
 		 478 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  32.09 
 
 		 492 aa  58.9  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3469  hypothetical protein  26.64 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  23.03 
 
 		 500 aa  58.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3564  hypothetical protein  24.76 
 
 		 488 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4251  hypothetical protein  33.33 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240238  normal  0.380401 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2779  hypothetical protein  24.91 
 
 		 545 aa  57.4  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.989391 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  27.23 
 
 		 472 aa  56.6  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  26.62 
 
 		 507 aa  55.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  29.6 
 
 		 593 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  23.69 
 
 		 477 aa  55.1  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.293786 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  28.8 
 
 		 589 aa  55.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  26.09 
 
 		 433 aa  55.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  30.88 
 
 		 472 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  24.24 
 
 		 413 aa  54.3  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.29 
 
 		 473 aa  53.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00039  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  23.61 
 
 		 484 aa  52.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000511104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  26.45 
 
 		 410 aa  51.6  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4948  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  29.15 
 
 		 519 aa  51.2  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.777522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  25.77 
 
 		 507 aa  51.2  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  24 
 
 		 399 aa  51.6  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  25.43 
 
 		 409 aa  50.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  26.07 
 
 		 483 aa  51.2  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  25.6 
 
 		 354 aa  50.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2902  hypothetical protein  35.82 
 
 		 547 aa  51.2  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107212 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  25.62 
 
 		 436 aa  50.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  24.34 
 
 		 459 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  29.86 
 
 		 500 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  25.25 
 
 		 487 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1555  DNA-directed DNA polymerase  26.4 
 
 		 422 aa  50.4  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.558973  normal  0.0210398 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3205  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  23.66 
 
 		 527 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.663167  normal  0.015197 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4290  hypothetical protein  28.31 
 
 		 506 aa  49.7  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2201  hypothetical protein  28.07 
 
 		 555 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  23.89 
 
 		 459 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  24.02 
 
 		 486 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  27.3 
 
 		 472 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  21.92 
 
 		 506 aa  48.5  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1902  hypothetical protein  24.95 
 
 		 478 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4919  DNA-directed DNA polymerase  22.04 
 
 		 416 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3568  DNA-directed DNA polymerase  23.9 
 
 		 393 aa  48.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  25.88 
 
 		 469 aa  48.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  23.72 
 
 		 385 aa  48.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13520  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.38 
 
 		 433 aa  47.4  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  24.88 
 
 		 425 aa  47.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0951  DNA polymerase IV  27.94 
 
 		 379 aa  47.4  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  24.52 
 
 		 409 aa  47.4  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28877  DNA repair protein  24.51 
 
 		 1118 aa  47  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.765985 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  29.63 
 
 		 410 aa  47  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  22.69 
 
 		 479 aa  47  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  29.44 
 
 		 499 aa  46.2  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  29.32 
 
 		 481 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2337  hypothetical protein  28.33 
 
 		 539 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30742  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5725  hypothetical protein  28.63 
 
 		 468 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0108  putative DNA repair enzyme  26.17 
 
 		 534 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1458  putative DNA repair enzyme  25.84 
 
 		 534 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3095  DNA polymerase IV  29.73 
 
 		 454 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3155  DNA polymerase IV  29.73 
 
 		 452 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.945689  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  26.26 
 
 		 423 aa  45.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2249  hypothetical protein  27.33 
 
 		 569 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0732725  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2751  DNA polymerase IV  26.67 
 
 		 404 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3768  DNA-directed DNA polymerase  24.39 
 
 		 394 aa  44.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.26 
 
 		 548 aa  45.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397333 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>