More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28877 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_28877  DNA repair protein  100 
 
 		 1118 aa  2305    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.765985 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03909  deoxycytidyl transferase (Eurofung)  30.12 
 
 		 1139 aa  405  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.310555 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01660  conserved hypothetical protein  31.41 
 
 		 1246 aa  261  5.0000000000000005e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49385  predicted protein  27.8 
 
 		 1125 aa  232  4e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25113  predicted protein  32.5 
 
 		 618 aa  229  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109915  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1114  DNA polymerase IV  32.23 
 
 		 357 aa  131  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0383  ImpB/MucB/SamB family protein  31.68 
 
 		 357 aa  131  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00108419  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03373  DNA-directed polymerase kappa, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01270)  27.76 
 
 		 612 aa  126  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0947  DNA polymerase IV  31.79 
 
 		 359 aa  126  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3604  DNA polymerase IV  30.67 
 
 		 364 aa  125  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0961  DNA polymerase IV  31.33 
 
 		 359 aa  125  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215034  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0951  DNA polymerase IV  32 
 
 		 379 aa  125  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126406  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1185  DNA polymerase IV  30.33 
 
 		 358 aa  124  7e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000335845  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0985  DNA polymerase IV  31.89 
 
 		 359 aa  125  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2871  DNA polymerase IV  31.99 
 
 		 359 aa  124  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0931  DNA polymerase IV  32.26 
 
 		 353 aa  124  9e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.643762  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  29.46 
 
 		 359 aa  124  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3092  DNA polymerase IV  30.98 
 
 		 358 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0949  DNA polymerase IV  31.56 
 
 		 359 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3427  DNA polymerase IV  30.9 
 
 		 358 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0935  DNA polymerase IV  30.56 
 
 		 358 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3422  DNA polymerase IV  30.98 
 
 		 360 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3552  DNA polymerase IV  30.56 
 
 		 358 aa  121  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3355  DNA polymerase IV  30.56 
 
 		 358 aa  121  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  28.57 
 
 		 834 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  27.39 
 
 		 419 aa  120  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  30.99 
 
 		 378 aa  120  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  30.99 
 
 		 378 aa  120  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13630  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  29.78 
 
 		 458 aa  119  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  26.98 
 
 		 372 aa  119  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2527  DNA polymerase IV  32.57 
 
 		 355 aa  119  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  27.96 
 
 		 399 aa  118  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  30.19 
 
 		 345 aa  118  6e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0597  DNA polymerase IV  34.43 
 
 		 355 aa  118  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0614  DNA polymerase IV  34.07 
 
 		 355 aa  118  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  29.49 
 
 		 413 aa  117  7.999999999999999e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  26.77 
 
 		 378 aa  117  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3990  DNA polymerase IV  28.87 
 
 		 353 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1726  DNA polymerase IV  31.9 
 
 		 352 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000164893  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  27.69 
 
 		 417 aa  117  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2507  DNA-directed DNA polymerase  31.46 
 
 		 358 aa  117  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  30.41 
 
 		 378 aa  116  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  28.53 
 
 		 375 aa  116  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1397  DNA polymerase IV  33.33 
 
 		 354 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1876  DNA polymerase IV  30.88 
 
 		 360 aa  115  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  25.51 
 
 		 410 aa  115  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  29.43 
 
 		 425 aa  115  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  26.63 
 
 		 419 aa  115  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  28.75 
 
 		 373 aa  114  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  30.79 
 
 		 353 aa  114  8.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  31.39 
 
 		 368 aa  114  9e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4012  DNA polymerase IV  30.91 
 
 		 354 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333158  normal  0.93726 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2179  DNA polymerase IV  28.94 
 
 		 405 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288104  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  27.97 
 
 		 358 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  34.15 
 
 		 389 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0957  DNA polymerase IV  29.8 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  26.72 
 
 		 395 aa  113  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  33.2 
 
 		 374 aa  113  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0285  DNA polymerase IV  31.35 
 
 		 351 aa  113  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5448  DNA polymerase IV  28.8 
 
 		 379 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52310  DNA polymerase IV  33.81 
 
 		 349 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.88026 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  29.8 
 
 		 369 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  30.6 
 
 		 356 aa  112  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  29.62 
 
 		 356 aa  112  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2052  DNA polymerase IV  29.04 
 
 		 407 aa  112  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4587  DNA polymerase IV  33.1 
 
 		 349 aa  112  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.099232  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  25.32 
 
 		 371 aa  112  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  29.62 
 
 		 356 aa  112  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1128  DNA polymerase IV  29.73 
 
 		 429 aa  112  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456598  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0265  DNA polymerase IV  31.35 
 
 		 351 aa  112  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  30.1 
 
 		 357 aa  112  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00226  DNA polymerase IV  31.35 
 
 		 351 aa  112  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3376  DNA-directed DNA polymerase  31.35 
 
 		 351 aa  112  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3349  DNA polymerase IV  31.35 
 
 		 351 aa  112  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00229  hypothetical protein  31.35 
 
 		 351 aa  112  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4326  DNA-directed DNA polymerase  27.83 
 
 		 463 aa  112  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  28.1 
 
 		 412 aa  112  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3438  DNA polymerase IV  29.47 
 
 		 352 aa  112  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0276  DNA polymerase IV  31.35 
 
 		 351 aa  111  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.820662 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0260  DNA polymerase IV  31.35 
 
 		 351 aa  111  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2844  DNA polymerase IV  28.57 
 
 		 411 aa  111  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.900402  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  26.54 
 
 		 412 aa  110  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1195  DNA polymerase IV  28.87 
 
 		 353 aa  110  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  27.94 
 
 		 369 aa  110  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  26.09 
 
 		 466 aa  110  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  28.66 
 
 		 410 aa  110  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1040  DNA polymerase IV  29.25 
 
 		 352 aa  110  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  29.87 
 
 		 385 aa  110  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  26.86 
 
 		 412 aa  110  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  29.49 
 
 		 354 aa  110  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0228  DNA polymerase IV  31.33 
 
 		 354 aa  110  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.190428  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0460  DNA polymerase IV  27.3 
 
 		 356 aa  110  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  28.8 
 
 		 383 aa  109  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  27.88 
 
 		 409 aa  109  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2071  DNA-directed DNA polymerase  30.26 
 
 		 348 aa  108  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  29.21 
 
 		 385 aa  108  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  28.8 
 
 		 408 aa  108  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.48 
 
 		 407 aa  108  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03264  DNA polymerase IV  29.23 
 
 		 372 aa  108  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  28.16 
 
 		 430 aa  108  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>