More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_25113 on replicon NC_009364
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009364  OSTLU_25113  predicted protein  100 
 
 
618 aa  1269    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109915  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03909  deoxycytidyl transferase (Eurofung)  32.3 
 
 
1139 aa  253  7e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.310555 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28877  DNA repair protein  32.5 
 
 
1118 aa  229  1e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.765985 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01660  conserved hypothetical protein  31.7 
 
 
1246 aa  195  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49385  predicted protein  31.59 
 
 
1125 aa  190  7e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3604  DNA polymerase IV  34.45 
 
 
364 aa  160  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85941  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3422  DNA polymerase IV  34.74 
 
 
360 aa  159  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0951  DNA polymerase IV  34.55 
 
 
379 aa  153  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126406  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3092  DNA polymerase IV  34.63 
 
 
358 aa  152  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2961  DNA-directed DNA polymerase  26.8 
 
 
356 aa  152  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0961  DNA polymerase IV  34.04 
 
 
359 aa  151  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215034  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  28.96 
 
 
356 aa  150  5e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  31.18 
 
 
364 aa  150  5e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0935  DNA polymerase IV  33.89 
 
 
358 aa  150  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3427  DNA polymerase IV  33.89 
 
 
358 aa  150  9e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1114  DNA polymerase IV  34.86 
 
 
357 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0949  DNA polymerase IV  34 
 
 
359 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  33.06 
 
 
430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3355  DNA polymerase IV  33.55 
 
 
358 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3552  DNA polymerase IV  33.55 
 
 
358 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  30.25 
 
 
367 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0985  DNA polymerase IV  33.22 
 
 
359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0947  DNA polymerase IV  33.78 
 
 
359 aa  147  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  29.41 
 
 
364 aa  147  6e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2527  DNA polymerase IV  34.04 
 
 
355 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0614  DNA polymerase IV  34.84 
 
 
355 aa  146  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0931  DNA polymerase IV  31.47 
 
 
353 aa  146  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.643762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3438  DNA polymerase IV  33.45 
 
 
352 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  32.61 
 
 
410 aa  145  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2871  DNA polymerase IV  33.8 
 
 
359 aa  145  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  32.88 
 
 
399 aa  145  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  27.6 
 
 
356 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  27.6 
 
 
356 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0597  DNA polymerase IV  34.49 
 
 
355 aa  145  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0460  DNA polymerase IV  29.67 
 
 
356 aa  144  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1586  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  29.7 
 
 
361 aa  144  4e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  31.49 
 
 
425 aa  144  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  33.97 
 
 
413 aa  144  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0762  DNA polymerase IV  35.83 
 
 
352 aa  142  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3291  DNA polymerase IV  33.1 
 
 
352 aa  141  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  31.18 
 
 
409 aa  142  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  31.51 
 
 
406 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0622  DNA-directed DNA polymerase  30.29 
 
 
365 aa  141  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  30.91 
 
 
409 aa  141  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0285  DNA polymerase IV  35.43 
 
 
351 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0276  DNA polymerase IV  35.04 
 
 
351 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.820662 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  28.85 
 
 
360 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002716  DNA polymerase IV  32.52 
 
 
356 aa  140  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0260  DNA polymerase IV  35.04 
 
 
351 aa  140  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0265  DNA polymerase IV  35.04 
 
 
351 aa  140  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00226  DNA polymerase IV  35.04 
 
 
351 aa  140  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3376  DNA-directed DNA polymerase  35.04 
 
 
351 aa  140  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3349  DNA polymerase IV  35.04 
 
 
351 aa  140  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00229  hypothetical protein  35.04 
 
 
351 aa  140  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37100  DNA polymerase IV  33.22 
 
 
353 aa  139  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  31.35 
 
 
408 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0243  ImpB/MucB/SamB family protein  29.66 
 
 
409 aa  139  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  31.78 
 
 
356 aa  139  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  29.7 
 
 
409 aa  139  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  29.11 
 
 
358 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0228  DNA polymerase IV  34.92 
 
 
354 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.190428  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  30.61 
 
 
378 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3990  DNA polymerase IV  30.56 
 
 
353 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  29.03 
 
 
412 aa  138  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3296  DNA polymerase IV  34.65 
 
 
352 aa  137  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3157  DNA polymerase IV  34.65 
 
 
352 aa  137  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2071  DNA-directed DNA polymerase  32.52 
 
 
348 aa  137  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3784  DNA-directed DNA polymerase  33.46 
 
 
352 aa  137  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.466948  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3308  DNA polymerase IV  34.65 
 
 
352 aa  137  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00714145  hitchhiker  0.00000429031 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1185  DNA polymerase IV  32.27 
 
 
358 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000335845  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0962  DNA polymerase IV  36.08 
 
 
353 aa  137  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  38.22 
 
 
402 aa  137  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0362  DNA polymerase IV  35.29 
 
 
351 aa  137  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.933253  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0354  DNA polymerase IV  35.29 
 
 
351 aa  137  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000360383 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03264  DNA polymerase IV  33.71 
 
 
372 aa  137  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  29.17 
 
 
345 aa  137  7.000000000000001e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0347  DNA polymerase IV  35.29 
 
 
351 aa  137  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1726  DNA polymerase IV  32.98 
 
 
352 aa  137  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000164893  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0927  DNA polymerase IV  31.82 
 
 
352 aa  137  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  38.1 
 
 
407 aa  136  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  30.91 
 
 
408 aa  136  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  31.05 
 
 
365 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0957  DNA polymerase IV  33.83 
 
 
304 aa  136  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  31 
 
 
359 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0343  DNA polymerase IV  35.29 
 
 
351 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.663031 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1397  DNA polymerase IV  30.56 
 
 
354 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1195  DNA polymerase IV  32.4 
 
 
353 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0352  DNA polymerase IV  35.29 
 
 
351 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.990512 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  28.24 
 
 
368 aa  135  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2097  DNA-directed DNA polymerase  32.34 
 
 
373 aa  134  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0894  DNA polymerase IV  32.52 
 
 
352 aa  134  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1876  DNA polymerase IV  31.72 
 
 
360 aa  134  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  30.46 
 
 
422 aa  134  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  30.93 
 
 
411 aa  134  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13710  DNA polymerase IV involved in DNA repair  31.73 
 
 
431 aa  134  6.999999999999999e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1342  DNA polymerase IV  32.59 
 
 
359 aa  134  6.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0560  DNA polymerase IV  33.33 
 
 
365 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  28.8 
 
 
359 aa  133  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  27.96 
 
 
412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  31.58 
 
 
361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>