More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0738 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 425 aa  855    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  52.73 
 
 		 412 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  53.14 
 
 		 385 aa  388  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  53.11 
 
 		 386 aa  382  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  58.75 
 
 		 481 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  50.39 
 
 		 397 aa  376  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  48.74 
 
 		 426 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  46.6 
 
 		 384 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  42.48 
 
 		 389 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  47.45 
 
 		 410 aa  330  4e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  44.68 
 
 		 393 aa  320  3e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  46.38 
 
 		 418 aa  310  4e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  45.89 
 
 		 418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  45.89 
 
 		 418 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  43.72 
 
 		 391 aa  302  9e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  42.67 
 
 		 390 aa  301  2e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  43.19 
 
 		 390 aa  299  6e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  45.03 
 
 		 420 aa  296  5e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  39.1 
 
 		 408 aa  296  5e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  43.07 
 
 		 430 aa  293  4e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  38.8 
 
 		 409 aa  293  5e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  39.53 
 
 		 409 aa  293  5e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  45.89 
 
 		 424 aa  291  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  45.62 
 
 		 422 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  45.17 
 
 		 402 aa  291  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  46.23 
 
 		 409 aa  291  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  42.93 
 
 		 385 aa  290  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  47.38 
 
 		 399 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  39.74 
 
 		 409 aa  285  7e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  44.76 
 
 		 407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  44.5 
 
 		 406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  39.23 
 
 		 409 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  43.54 
 
 		 417 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  42.04 
 
 		 399 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  39.39 
 
 		 408 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  38.97 
 
 		 425 aa  281  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  42.01 
 
 		 415 aa  280  3e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  39.58 
 
 		 407 aa  279  6e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  42.74 
 
 		 354 aa  279  7e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  44.51 
 
 		 419 aa  277  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  41.33 
 
 		 369 aa  277  3e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  42.64 
 
 		 408 aa  276  7e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  41.78 
 
 		 415 aa  275  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  42.48 
 
 		 359 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  36.55 
 
 		 410 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  46.49 
 
 		 360 aa  270  4e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  44.88 
 
 		 419 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  41.73 
 
 		 410 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  42.42 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  38.56 
 
 		 411 aa  268  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  38.9 
 
 		 413 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  42.49 
 
 		 372 aa  266  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  42.37 
 
 		 432 aa  265  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7420  DNA polymerase IV  40.82 
 
 		 429 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108606  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2961  DNA-directed DNA polymerase  39.83 
 
 		 356 aa  265  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  41.76 
 
 		 431 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  40.47 
 
 		 432 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3235  DNA-directed DNA polymerase  38.95 
 
 		 380 aa  263  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  38.72 
 
 		 385 aa  263  4e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  40.17 
 
 		 371 aa  263  6e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  41.11 
 
 		 385 aa  262  6.999999999999999e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  38.7 
 
 		 410 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  40.89 
 
 		 408 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1429  DNA polymerase IV  41.15 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.587123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13630  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  44.99 
 
 		 458 aa  260  3e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  39.74 
 
 		 435 aa  260  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2445  DNA polymerase IV  40.73 
 
 		 429 aa  260  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255034  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  40.94 
 
 		 417 aa  260  4e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  43.18 
 
 		 369 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  40.85 
 
 		 367 aa  259  6e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  41.32 
 
 		 417 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  40.46 
 
 		 435 aa  259  8e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  43.07 
 
 		 374 aa  258  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  41.32 
 
 		 449 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  40.58 
 
 		 423 aa  258  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  42.23 
 
 		 395 aa  257  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  44.71 
 
 		 356 aa  258  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  40.88 
 
 		 371 aa  257  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  44.41 
 
 		 466 aa  258  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  39.15 
 
 		 418 aa  257  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  40 
 
 		 429 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  44.84 
 
 		 359 aa  257  3e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  40.91 
 
 		 378 aa  256  4e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  40.91 
 
 		 378 aa  256  4e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  42.06 
 
 		 358 aa  256  6e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  41.07 
 
 		 407 aa  256  7e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  38.71 
 
 		 413 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  42.02 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  43.36 
 
 		 359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  42.03 
 
 		 355 aa  253  3e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1274  DNA polymerase IV  38.62 
 
 		 436 aa  253  4.0000000000000004e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0719979  normal  0.0370886 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  39.43 
 
 		 395 aa  253  5.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  39.9 
 
 		 400 aa  253  5.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2410  DNA polymerase IV  39.18 
 
 		 429 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.18017 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  40.53 
 
 		 417 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0687  DNA-directed DNA polymerase  39.8 
 
 		 444 aa  251  1e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000344848  hitchhiker  0.00527115 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  43.64 
 
 		 378 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  41.91 
 
 		 363 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1745  DNA polymerase IV  39.9 
 
 		 428 aa  250  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  40.12 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>