More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2663 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 358 aa  729    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  69.97 
 
 		 371 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  69.5 
 
 		 372 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  56.05 
 
 		 359 aa  371  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  54.26 
 
 		 365 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  51.91 
 
 		 380 aa  350  2e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  54.12 
 
 		 363 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  53.18 
 
 		 359 aa  346  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  52.2 
 
 		 385 aa  344  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  50.56 
 
 		 357 aa  342  5.999999999999999e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  54.84 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  53.35 
 
 		 354 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  54.25 
 
 		 378 aa  339  4e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  50.44 
 
 		 360 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  50.44 
 
 		 363 aa  337  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2097  DNA-directed DNA polymerase  53.67 
 
 		 373 aa  336  2.9999999999999997e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  52.19 
 
 		 359 aa  335  5e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  51.62 
 
 		 378 aa  335  9e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  49 
 
 		 381 aa  335  1e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  52.35 
 
 		 355 aa  334  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  52.06 
 
 		 396 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  49.71 
 
 		 359 aa  330  2e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  51.61 
 
 		 376 aa  329  6e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  50.15 
 
 		 373 aa  323  4e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  50.29 
 
 		 359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  48.97 
 
 		 375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  54.03 
 
 		 353 aa  318  9e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  49.12 
 
 		 356 aa  318  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  52.79 
 
 		 368 aa  316  4e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  46.96 
 
 		 378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  46.96 
 
 		 378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  47.49 
 
 		 371 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  47.38 
 
 		 369 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  47.06 
 
 		 369 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  46.04 
 
 		 374 aa  302  5.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  42.98 
 
 		 364 aa  301  1e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  46.33 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  45.59 
 
 		 399 aa  301  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  43.47 
 
 		 367 aa  300  2e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  46.22 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2179  DNA polymerase IV  45.75 
 
 		 405 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52310  DNA polymerase IV  47.09 
 
 		 349 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.88026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4587  DNA polymerase IV  46.54 
 
 		 349 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.099232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  45.29 
 
 		 408 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  45.29 
 
 		 383 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  45.29 
 
 		 361 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  44.57 
 
 		 418 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  44.28 
 
 		 418 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0383  ImpB/MucB/SamB family protein  45.45 
 
 		 357 aa  286  4e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00108419  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0927  DNA polymerase IV  46.04 
 
 		 352 aa  285  7e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  43.59 
 
 		 356 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  43.59 
 
 		 356 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37100  DNA polymerase IV  43.39 
 
 		 353 aa  283  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  43.99 
 
 		 418 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5448  DNA polymerase IV  45.45 
 
 		 379 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1963  DNA polymerase IV  45.77 
 
 		 357 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.148262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1859  DNA polymerase IV  44.71 
 
 		 392 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2052  DNA polymerase IV  45 
 
 		 407 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1635  DNA polymerase IV  45.03 
 
 		 357 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.107243  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  44.38 
 
 		 399 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1587  DNA polymerase IV  44.44 
 
 		 362 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3604  DNA polymerase IV  46.65 
 
 		 364 aa  280  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3990  DNA polymerase IV  47.71 
 
 		 353 aa  279  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  43.59 
 
 		 356 aa  279  6e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3291  DNA polymerase IV  45.32 
 
 		 352 aa  278  8e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4012  DNA polymerase IV  43.24 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333158  normal  0.93726 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0931  DNA polymerase IV  46.38 
 
 		 353 aa  277  2e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.643762  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  43.79 
 
 		 369 aa  276  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1397  DNA polymerase IV  47.39 
 
 		 354 aa  275  6e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1128  DNA polymerase IV  45.16 
 
 		 429 aa  276  6e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456598  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3422  DNA polymerase IV  46.37 
 
 		 360 aa  275  7e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0965  DNA polymerase IV  45.45 
 
 		 350 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3092  DNA polymerase IV  46.94 
 
 		 358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1727  DNA polymerase IV  44.12 
 
 		 404 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0894  DNA polymerase IV  44.57 
 
 		 352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2675  DNA polymerase IV  44.12 
 
 		 406 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1508  DNA polymerase IV  44.12 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408147  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4215  DNA polymerase IV  43.27 
 
 		 354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1726  DNA polymerase IV  43.79 
 
 		 352 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000164893  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3083  DNA polymerase IV  44.12 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2236  DNA polymerase IV  44.12 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.783166  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2751  DNA polymerase IV  44.12 
 
 		 404 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1342  DNA polymerase IV  47.37 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  43.18 
 
 		 408 aa  273  4.0000000000000004e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1203  DNA polymerase IV  44.44 
 
 		 354 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1232  DNA polymerase IV  45.28 
 
 		 354 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46587  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3394  DNA polymerase IV  45.71 
 
 		 364 aa  271  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320161  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2871  DNA polymerase IV  44.72 
 
 		 359 aa  271  9e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1876  DNA polymerase IV  45.77 
 
 		 360 aa  271  9e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3438  DNA polymerase IV  43.86 
 
 		 352 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2619  DNA polymerase IV  43.82 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0285  DNA polymerase IV  44.96 
 
 		 351 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  42.57 
 
 		 466 aa  270  4e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00226  DNA polymerase IV  44.96 
 
 		 351 aa  269  5e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3376  DNA-directed DNA polymerase  44.96 
 
 		 351 aa  269  5e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3349  DNA polymerase IV  44.96 
 
 		 351 aa  269  5e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0961  DNA polymerase IV  46.49 
 
 		 359 aa  269  5e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215034  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00229  hypothetical protein  44.96 
 
 		 351 aa  269  5e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0265  DNA polymerase IV  44.96 
 
 		 351 aa  268  8e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0947  DNA polymerase IV  46.04 
 
 		 359 aa  268  8e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>