More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1444 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  100 
 
 		 466 aa  922    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2975  DNA polymerase IV  56.14 
 
 		 443 aa  424  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.949481  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5052  DNA-directed DNA polymerase  55.7 
 
 		 448 aa  410  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4326  DNA-directed DNA polymerase  55.38 
 
 		 463 aa  393  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13630  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  48.48 
 
 		 458 aa  347  4e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  49.32 
 
 		 834 aa  336  5e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  50 
 
 		 418 aa  299  7e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  50 
 
 		 418 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  49.72 
 
 		 418 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  48.06 
 
 		 399 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11570  DNA polymerase IV  46.28 
 
 		 463 aa  291  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  46.33 
 
 		 385 aa  286  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  49.26 
 
 		 419 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  47.8 
 
 		 380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  48.41 
 
 		 410 aa  283  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  44.57 
 
 		 363 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2771  DNA polymerase IV  45.43 
 
 		 453 aa  282  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.259095  normal  0.570468 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2635  DNA-directed DNA polymerase  44.19 
 
 		 466 aa  281  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.959569  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  49.7 
 
 		 419 aa  279  7e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  45.45 
 
 		 378 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  45.76 
 
 		 415 aa  278  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  47.28 
 
 		 410 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  44.29 
 
 		 363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20590  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  42.89 
 
 		 489 aa  272  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  45.53 
 
 		 374 aa  271  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  46.52 
 
 		 381 aa  270  4e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  44.92 
 
 		 378 aa  270  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  44.92 
 
 		 378 aa  270  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  40.88 
 
 		 372 aa  270  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  42.57 
 
 		 358 aa  270  5e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3642  DNA polymerase IV  42.37 
 
 		 455 aa  269  8e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  43.88 
 
 		 430 aa  269  8e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  42.52 
 
 		 365 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  41.51 
 
 		 408 aa  266  7e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  42.11 
 
 		 369 aa  266  8e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  42.05 
 
 		 371 aa  265  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3155  DNA polymerase IV  42.79 
 
 		 452 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.945689  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3115  DNA polymerase IV  42.73 
 
 		 452 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.259823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  40.28 
 
 		 389 aa  265  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3095  DNA polymerase IV  42.79 
 
 		 454 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  38.46 
 
 		 371 aa  263  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  45.77 
 
 		 356 aa  262  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  43.25 
 
 		 359 aa  262  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  39.6 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  44.87 
 
 		 375 aa  260  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  38.86 
 
 		 364 aa  260  4e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  40.29 
 
 		 360 aa  260  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  40.94 
 
 		 393 aa  259  6e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  43.98 
 
 		 424 aa  258  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  45.53 
 
 		 355 aa  258  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3002  DNA-directed DNA polymerase  43.02 
 
 		 449 aa  258  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  41.55 
 
 		 399 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  44.41 
 
 		 425 aa  258  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  42.25 
 
 		 385 aa  257  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  41.21 
 
 		 359 aa  257  3e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  47.92 
 
 		 420 aa  257  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  50 
 
 		 422 aa  256  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3609  DNA-directed DNA polymerase  45.28 
 
 		 405 aa  256  6e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  43.7 
 
 		 378 aa  255  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  43.4 
 
 		 373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  43.11 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  40.7 
 
 		 354 aa  254  3e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  38.89 
 
 		 367 aa  253  6e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  46.29 
 
 		 409 aa  251  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  44.9 
 
 		 426 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0076  DNA-directed DNA polymerase  46.24 
 
 		 577 aa  251  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  44.02 
 
 		 419 aa  250  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  45.8 
 
 		 406 aa  249  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  42.06 
 
 		 397 aa  249  7e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  44.51 
 
 		 356 aa  248  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  43.31 
 
 		 431 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  42.9 
 
 		 402 aa  247  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  42.29 
 
 		 407 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  42.82 
 
 		 429 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  41.06 
 
 		 359 aa  246  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  41.71 
 
 		 396 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  42.11 
 
 		 391 aa  245  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  42.11 
 
 		 435 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  44.26 
 
 		 449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  47.92 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  44.26 
 
 		 417 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3530  DNA polymerase IV  40.83 
 
 		 421 aa  244  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2410  DNA polymerase IV  42.98 
 
 		 429 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.18017 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  44.9 
 
 		 360 aa  244  3e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  39.89 
 
 		 385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  43.38 
 
 		 417 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  40.37 
 
 		 423 aa  242  9e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  42.52 
 
 		 376 aa  242  9e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  42.82 
 
 		 432 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  45.88 
 
 		 481 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  40.06 
 
 		 390 aa  240  4e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  45.43 
 
 		 386 aa  240  4e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  41.64 
 
 		 360 aa  239  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  41.46 
 
 		 369 aa  239  6.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  38.4 
 
 		 364 aa  239  8e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  42.13 
 
 		 408 aa  239  9e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  38.48 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  39 
 
 		 367 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  40.68 
 
 		 368 aa  238  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  44.48 
 
 		 413 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>