More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_13630 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_13630  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  100 
 
 		 458 aa  892    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5052  DNA-directed DNA polymerase  55.02 
 
 		 448 aa  391  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4326  DNA-directed DNA polymerase  53.17 
 
 		 463 aa  381  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2975  DNA polymerase IV  55.33 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.949481  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  48.48 
 
 		 466 aa  352  8.999999999999999e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  46.17 
 
 		 834 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11570  DNA polymerase IV  44.32 
 
 		 463 aa  293  4e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2771  DNA polymerase IV  45.13 
 
 		 453 aa  290  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.259095  normal  0.570468 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3642  DNA polymerase IV  44.05 
 
 		 455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2635  DNA-directed DNA polymerase  45.13 
 
 		 466 aa  284  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.959569  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3115  DNA polymerase IV  43.02 
 
 		 452 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.259823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3155  DNA polymerase IV  43.17 
 
 		 452 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.945689  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3095  DNA polymerase IV  43.17 
 
 		 454 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0076  DNA-directed DNA polymerase  49.37 
 
 		 577 aa  266  4e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  44.99 
 
 		 425 aa  265  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3002  DNA-directed DNA polymerase  43.24 
 
 		 449 aa  263  4e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20590  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  44.57 
 
 		 489 aa  263  6.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  39.17 
 
 		 389 aa  251  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  42.77 
 
 		 426 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  44.54 
 
 		 378 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  44.54 
 
 		 378 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  43.86 
 
 		 424 aa  240  4e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06310  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  43.26 
 
 		 454 aa  238  1e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  45.27 
 
 		 410 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  45.48 
 
 		 419 aa  237  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  40.55 
 
 		 385 aa  236  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  45.48 
 
 		 355 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  39.32 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  44.51 
 
 		 419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  35.23 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  42.78 
 
 		 386 aa  234  3e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  43.1 
 
 		 356 aa  234  3e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  44.25 
 
 		 406 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  42.86 
 
 		 430 aa  231  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  39.37 
 
 		 358 aa  231  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  43.8 
 
 		 417 aa  230  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  43.13 
 
 		 399 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  42.9 
 
 		 374 aa  229  7e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  42.82 
 
 		 412 aa  229  8e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  41.06 
 
 		 429 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  40.28 
 
 		 359 aa  227  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  43.35 
 
 		 418 aa  227  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  40.92 
 
 		 354 aa  227  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  41 
 
 		 413 aa  226  9e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  38.75 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  41.08 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  38.57 
 
 		 385 aa  224  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  43.35 
 
 		 418 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  40.86 
 
 		 381 aa  223  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  40.78 
 
 		 481 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0687  DNA-directed DNA polymerase  41.09 
 
 		 444 aa  223  6e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000344848  hitchhiker  0.00527115 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  40.56 
 
 		 431 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  42.22 
 
 		 402 aa  223  8e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  43.06 
 
 		 418 aa  222  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  39.48 
 
 		 363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  42.73 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2445  DNA polymerase IV  39.66 
 
 		 429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255034  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  44.09 
 
 		 385 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  42.62 
 
 		 415 aa  219  7e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  39.44 
 
 		 391 aa  219  7.999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  37.16 
 
 		 408 aa  219  8.999999999999998e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  37.29 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  43.75 
 
 		 432 aa  219  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  39.01 
 
 		 417 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  37.29 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  40 
 
 		 423 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  40.91 
 
 		 422 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  36.26 
 
 		 359 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  40.38 
 
 		 396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  35.99 
 
 		 409 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  39.17 
 
 		 371 aa  216  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  40.28 
 
 		 378 aa  216  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1555  DNA-directed DNA polymerase  43.97 
 
 		 422 aa  216  7e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.558973  normal  0.0210398 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  35.07 
 
 		 364 aa  216  8e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  41.36 
 
 		 380 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  41.92 
 
 		 407 aa  215  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  41.21 
 
 		 418 aa  215  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2961  DNA-directed DNA polymerase  33.52 
 
 		 356 aa  215  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  39.83 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13520  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  41.09 
 
 		 433 aa  215  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  39.17 
 
 		 368 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  39.09 
 
 		 390 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  37.29 
 
 		 407 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  40.75 
 
 		 432 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  38.97 
 
 		 435 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  37.07 
 
 		 354 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  39.66 
 
 		 360 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  35.94 
 
 		 360 aa  213  4.9999999999999996e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0614  DNA polymerase IV  36.14 
 
 		 355 aa  213  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  41.64 
 
 		 376 aa  213  5.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  39.6 
 
 		 445 aa  213  7.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  40.23 
 
 		 356 aa  212  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  36.29 
 
 		 356 aa  212  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  39.78 
 
 		 436 aa  212  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  38.62 
 
 		 365 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  40.28 
 
 		 408 aa  212  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  34.72 
 
 		 409 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  39.6 
 
 		 445 aa  211  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0597  DNA polymerase IV  35.33 
 
 		 355 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  35 
 
 		 409 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>