More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2492 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 409 aa  848    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  95.6 
 
 		 409 aa  816    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  68.64 
 
 		 407 aa  588  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  68.81 
 
 		 408 aa  589  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  71.29 
 
 		 413 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  64.04 
 
 		 410 aa  551  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  62.81 
 
 		 410 aa  535  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  61.61 
 
 		 411 aa  530  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  61.58 
 
 		 409 aa  527  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  62.47 
 
 		 409 aa  527  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  43.01 
 
 		 395 aa  294  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  44.27 
 
 		 400 aa  291  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  41.25 
 
 		 410 aa  290  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  39.74 
 
 		 425 aa  285  7e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  41.05 
 
 		 385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  42.3 
 
 		 395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  39.74 
 
 		 385 aa  278  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  40 
 
 		 408 aa  277  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  40.26 
 
 		 399 aa  277  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  38.99 
 
 		 412 aa  276  7e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  39.95 
 
 		 419 aa  274  3e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  40.21 
 
 		 419 aa  272  9e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  41.95 
 
 		 481 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  40.15 
 
 		 399 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  36.52 
 
 		 397 aa  268  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  37.14 
 
 		 386 aa  267  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  38.82 
 
 		 415 aa  267  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  39.32 
 
 		 402 aa  266  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  37.89 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  38.35 
 
 		 430 aa  263  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  38.83 
 
 		 418 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  40.05 
 
 		 410 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  38.58 
 
 		 418 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  38.96 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  37.91 
 
 		 420 aa  260  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  38.32 
 
 		 418 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  38.7 
 
 		 393 aa  259  8e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  36.73 
 
 		 408 aa  257  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3073  DNA-directed DNA polymerase  35.21 
 
 		 414 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  37.37 
 
 		 417 aa  253  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  40.76 
 
 		 378 aa  252  7e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  38.05 
 
 		 422 aa  252  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  37.76 
 
 		 406 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  36.28 
 
 		 426 aa  250  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  36.5 
 
 		 408 aa  249  9e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  39.94 
 
 		 371 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0370  DNA-directed DNA polymerase  38.48 
 
 		 423 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  37.6 
 
 		 430 aa  247  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  37.47 
 
 		 409 aa  248  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  39.6 
 
 		 360 aa  246  4e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  38.97 
 
 		 364 aa  244  9.999999999999999e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  40.7 
 
 		 354 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  37.79 
 
 		 399 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  38.11 
 
 		 424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2083  DNA-directed DNA polymerase  36.5 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.968018  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  36.18 
 
 		 407 aa  239  8e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  36.6 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  39.77 
 
 		 359 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  38.48 
 
 		 385 aa  237  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  39.77 
 
 		 372 aa  236  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1670  DNA-directed DNA polymerase  38.06 
 
 		 419 aa  236  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000999976  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  36.08 
 
 		 412 aa  236  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  36.21 
 
 		 414 aa  236  6e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  36.62 
 
 		 417 aa  236  6e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  35.92 
 
 		 412 aa  235  8e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  40.29 
 
 		 368 aa  236  8e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  38.55 
 
 		 364 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  36.6 
 
 		 412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  36.34 
 
 		 412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  36.34 
 
 		 412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  36.34 
 
 		 412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  36.34 
 
 		 412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  36.34 
 
 		 412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  37.9 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  35.86 
 
 		 395 aa  233  3e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  37.82 
 
 		 414 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  38.89 
 
 		 378 aa  234  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  36.97 
 
 		 380 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  34.87 
 
 		 425 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  36.08 
 
 		 412 aa  233  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  39.94 
 
 		 359 aa  233  6e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  39.24 
 
 		 383 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  37.68 
 
 		 358 aa  233  7.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  39.24 
 
 		 361 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  36.56 
 
 		 385 aa  232  9e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  39.24 
 
 		 408 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  35.4 
 
 		 412 aa  232  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  34.12 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  36.81 
 
 		 414 aa  231  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  36.76 
 
 		 360 aa  229  5e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  39.37 
 
 		 396 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  37.68 
 
 		 356 aa  229  6e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2975  DNA polymerase IV  38.78 
 
 		 443 aa  229  7e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.949481  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  40.52 
 
 		 381 aa  229  8e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0622  DNA-directed DNA polymerase  37.78 
 
 		 365 aa  228  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  36.27 
 
 		 423 aa  228  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  34.03 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  38.89 
 
 		 374 aa  227  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  34.63 
 
 		 391 aa  226  7e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  40.76 
 
 		 376 aa  226  7e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>