More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1563 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 371 aa  769    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  73.57 
 
 		 369 aa  556  1e-157  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  52.84 
 
 		 363 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  53.37 
 
 		 355 aa  349  4e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  49.07 
 
 		 385 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  50.14 
 
 		 381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  49.44 
 
 		 365 aa  335  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  50.58 
 
 		 372 aa  333  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  51.83 
 
 		 378 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  50 
 
 		 354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  46.28 
 
 		 378 aa  326  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  46.28 
 
 		 378 aa  326  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  48.86 
 
 		 378 aa  324  1e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  51.42 
 
 		 359 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  47.12 
 
 		 371 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  50.28 
 
 		 363 aa  316  5e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  49.86 
 
 		 360 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  48.24 
 
 		 360 aa  312  5.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  48.97 
 
 		 356 aa  311  9e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  48.07 
 
 		 375 aa  311  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  50 
 
 		 359 aa  310  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  49.16 
 
 		 396 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  48.85 
 
 		 373 aa  309  5e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  45.28 
 
 		 374 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  50.15 
 
 		 380 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2097  DNA-directed DNA polymerase  52.05 
 
 		 373 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  47.49 
 
 		 358 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  47.9 
 
 		 353 aa  300  3e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  46.82 
 
 		 359 aa  300  4e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  48.53 
 
 		 376 aa  294  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  46.48 
 
 		 357 aa  294  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  50.48 
 
 		 359 aa  288  9e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  45.91 
 
 		 359 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0961  DNA polymerase IV  44.47 
 
 		 359 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215034  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  47.06 
 
 		 368 aa  284  2.0000000000000002e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  42.98 
 
 		 364 aa  278  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1185  DNA polymerase IV  47.7 
 
 		 358 aa  277  3e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000335845  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2527  DNA polymerase IV  47.84 
 
 		 355 aa  276  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  43.9 
 
 		 356 aa  276  4e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  43.9 
 
 		 356 aa  276  4e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0951  DNA polymerase IV  43.33 
 
 		 379 aa  276  6e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126406  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3604  DNA polymerase IV  47.52 
 
 		 364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3552  DNA polymerase IV  46.2 
 
 		 358 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  41.93 
 
 		 364 aa  270  2e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3422  DNA polymerase IV  44.41 
 
 		 360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0949  DNA polymerase IV  45.81 
 
 		 359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0947  DNA polymerase IV  45.81 
 
 		 359 aa  269  5e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  44.12 
 
 		 369 aa  268  8e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1114  DNA polymerase IV  45.87 
 
 		 357 aa  268  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3092  DNA polymerase IV  42.78 
 
 		 358 aa  268  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0935  DNA polymerase IV  46.2 
 
 		 358 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  43.93 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0985  DNA polymerase IV  45.48 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3355  DNA polymerase IV  45.87 
 
 		 358 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3427  DNA polymerase IV  45.87 
 
 		 358 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  43.93 
 
 		 408 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  42.58 
 
 		 361 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2871  DNA polymerase IV  43.99 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  40.62 
 
 		 367 aa  265  8e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  42.05 
 
 		 466 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  38.59 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0383  ImpB/MucB/SamB family protein  41.83 
 
 		 357 aa  263  3e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00108419  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  45.68 
 
 		 356 aa  263  4.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  41.76 
 
 		 418 aa  262  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  40.17 
 
 		 425 aa  263  4.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  42.42 
 
 		 418 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52310  DNA polymerase IV  44.63 
 
 		 349 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.88026 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1586  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  41.91 
 
 		 361 aa  262  6.999999999999999e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  42.4 
 
 		 356 aa  262  8e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  44.97 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  42.13 
 
 		 418 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5448  DNA polymerase IV  40.88 
 
 		 379 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4587  DNA polymerase IV  44.07 
 
 		 349 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.099232  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0276  DNA polymerase IV  46.56 
 
 		 351 aa  259  6e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.820662 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1859  DNA polymerase IV  42.09 
 
 		 392 aa  258  8e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0260  DNA polymerase IV  46.56 
 
 		 351 aa  258  8e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1876  DNA polymerase IV  44.48 
 
 		 360 aa  258  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0460  DNA polymerase IV  42.61 
 
 		 356 aa  258  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00226  DNA polymerase IV  46.23 
 
 		 351 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3376  DNA-directed DNA polymerase  46.23 
 
 		 351 aa  258  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00229  hypothetical protein  46.23 
 
 		 351 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0265  DNA polymerase IV  46.23 
 
 		 351 aa  257  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3349  DNA polymerase IV  46.23 
 
 		 351 aa  258  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0285  DNA polymerase IV  46.23 
 
 		 351 aa  256  4e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2052  DNA polymerase IV  43.79 
 
 		 407 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2179  DNA polymerase IV  41.21 
 
 		 405 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288104  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  39.71 
 
 		 384 aa  256  5e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2619  DNA polymerase IV  42.09 
 
 		 403 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2332  DNA-directed DNA polymerase  44.94 
 
 		 353 aa  256  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353166  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  42.42 
 
 		 399 aa  256  7e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  43.06 
 
 		 389 aa  255  8e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4215  DNA polymerase IV  42.74 
 
 		 354 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0762  DNA polymerase IV  45.42 
 
 		 352 aa  255  9e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  39.83 
 
 		 410 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3394  DNA polymerase IV  41.6 
 
 		 364 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320161  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2751  DNA polymerase IV  41.81 
 
 		 404 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2675  DNA polymerase IV  41.81 
 
 		 406 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3083  DNA polymerase IV  41.81 
 
 		 400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0614  DNA polymerase IV  40.32 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0228  DNA polymerase IV  46.2 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.190428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>