More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0145 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
399 aa  767    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  78.52 
 
 
418 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  77.49 
 
 
418 aa  554  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  77.75 
 
 
418 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  47.45 
 
 
399 aa  323  5e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  49.87 
 
 
409 aa  315  7e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  50.26 
 
 
386 aa  309  5e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  40.66 
 
 
393 aa  305  7e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  49.86 
 
 
419 aa  303  5.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  50.14 
 
 
419 aa  301  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  44.5 
 
 
412 aa  301  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  47.22 
 
 
410 aa  299  7e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  50.13 
 
 
385 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  45.45 
 
 
425 aa  296  5e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  45.24 
 
 
397 aa  293  4e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  48.06 
 
 
466 aa  293  5e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  41.41 
 
 
408 aa  292  7e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  45.75 
 
 
371 aa  290  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  45.27 
 
 
426 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  45.04 
 
 
415 aa  285  8e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  51.31 
 
 
481 aa  285  8e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  47.68 
 
 
420 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  47.69 
 
 
402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  44.58 
 
 
402 aa  282  6.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  47.74 
 
 
356 aa  281  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  44.38 
 
 
358 aa  281  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  39.95 
 
 
385 aa  281  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  41.94 
 
 
384 aa  280  4e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  42.7 
 
 
372 aa  279  7e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  39.9 
 
 
409 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  45.45 
 
 
834 aa  277  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  40.25 
 
 
409 aa  277  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  44.84 
 
 
424 aa  276  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  46.31 
 
 
419 aa  277  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  43.26 
 
 
410 aa  275  8e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  40.4 
 
 
409 aa  275  9e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  46.29 
 
 
430 aa  274  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  46.35 
 
 
356 aa  273  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  45.08 
 
 
414 aa  270  5e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  44.1 
 
 
421 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  46.39 
 
 
415 aa  269  7e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  41.48 
 
 
408 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  42.35 
 
 
408 aa  268  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  44.81 
 
 
413 aa  268  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  42.23 
 
 
360 aa  267  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  39.85 
 
 
409 aa  268  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  44.56 
 
 
430 aa  268  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3609  DNA-directed DNA polymerase  44.76 
 
 
405 aa  266  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  44.11 
 
 
407 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  39.12 
 
 
390 aa  266  4e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  46.92 
 
 
380 aa  266  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  48.02 
 
 
355 aa  266  5e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  47.04 
 
 
363 aa  266  5.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  45.71 
 
 
417 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  40.41 
 
 
391 aa  264  2e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  44.07 
 
 
406 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4326  DNA-directed DNA polymerase  49.72 
 
 
463 aa  263  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  36.34 
 
 
410 aa  263  3e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  41.18 
 
 
407 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  46.39 
 
 
378 aa  263  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  46.39 
 
 
378 aa  263  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  46.43 
 
 
422 aa  262  6e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  39.79 
 
 
390 aa  262  6.999999999999999e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  41.76 
 
 
369 aa  262  6.999999999999999e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  41.52 
 
 
408 aa  262  8e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  44.93 
 
 
369 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1021  DNA polymerase IV  42.97 
 
 
401 aa  259  5.0000000000000005e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.6656  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  44.3 
 
 
417 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  44.3 
 
 
449 aa  259  8e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  42.82 
 
 
373 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5052  DNA-directed DNA polymerase  50 
 
 
448 aa  258  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5685  DNA polymerase IV  42.93 
 
 
424 aa  257  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273553 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  38.83 
 
 
359 aa  257  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5438  DNA polymerase IV  44.9 
 
 
407 aa  256  6e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151264  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  42.42 
 
 
371 aa  255  8e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  43.52 
 
 
417 aa  255  9e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  44.81 
 
 
359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  39.14 
 
 
389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5059  DNA polymerase IV  45.57 
 
 
407 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315945  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  40.41 
 
 
359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5147  DNA polymerase IV  45.57 
 
 
407 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  46.02 
 
 
376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  43.32 
 
 
407 aa  254  3e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3810  DNA polymerase IV  42.46 
 
 
428 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0803828  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  41.75 
 
 
385 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  41.94 
 
 
400 aa  253  5.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  39.59 
 
 
425 aa  253  6e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06310  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  40.49 
 
 
454 aa  253  6e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  47.97 
 
 
407 aa  252  7e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  47.06 
 
 
374 aa  252  7e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  44.44 
 
 
378 aa  252  9.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  43.11 
 
 
395 aa  251  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  44.2 
 
 
360 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  42.78 
 
 
375 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  40.3 
 
 
413 aa  250  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  43.61 
 
 
359 aa  249  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  35.59 
 
 
395 aa  249  5e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  42.2 
 
 
418 aa  249  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  42.82 
 
 
378 aa  249  6e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  37.05 
 
 
385 aa  249  6e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>