More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1107 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 385 aa  769    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  41.18 
 
 		 393 aa  312  6.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  41.42 
 
 		 399 aa  277  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  41.82 
 
 		 420 aa  267  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  40.68 
 
 		 384 aa  263  4e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  38.72 
 
 		 425 aa  263  4e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  42.67 
 
 		 402 aa  263  4.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  44.22 
 
 		 378 aa  261  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  38.82 
 
 		 408 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  44.22 
 
 		 378 aa  261  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  43.35 
 
 		 417 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  40.21 
 
 		 385 aa  253  5.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  41.21 
 
 		 410 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  37.5 
 
 		 389 aa  249  5e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  42.11 
 
 		 419 aa  249  8e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  43.1 
 
 		 418 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  43.1 
 
 		 418 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  42.65 
 
 		 374 aa  246  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  43.39 
 
 		 418 aa  246  6e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  41.1 
 
 		 406 aa  246  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  42.98 
 
 		 399 aa  245  9e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  37.05 
 
 		 425 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  37.21 
 
 		 426 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  42.04 
 
 		 422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  38.89 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  42.73 
 
 		 419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  40.06 
 
 		 367 aa  243  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  39.89 
 
 		 466 aa  243  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  40.47 
 
 		 424 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  39.04 
 
 		 390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  40.32 
 
 		 408 aa  242  6e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  43.07 
 
 		 360 aa  243  6e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  35.06 
 
 		 412 aa  241  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  38.77 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  39.04 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  37.96 
 
 		 415 aa  239  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  38.95 
 
 		 386 aa  239  4e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  37.94 
 
 		 368 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  34.81 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  34.81 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  34.81 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  34.81 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  40.26 
 
 		 409 aa  238  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  34.81 
 
 		 412 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  39.05 
 
 		 385 aa  237  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  34.81 
 
 		 412 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0949  DNA-directed DNA polymerase  40.21 
 
 		 385 aa  237  3e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.868276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  38.84 
 
 		 372 aa  237  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  36.41 
 
 		 412 aa  236  7e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  41.27 
 
 		 435 aa  235  9e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  35.29 
 
 		 399 aa  235  9e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  38.19 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  38.37 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  36.83 
 
 		 409 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  39.09 
 
 		 430 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  38.08 
 
 		 354 aa  234  3e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  33.77 
 
 		 412 aa  233  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  39.35 
 
 		 355 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  37.63 
 
 		 431 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  33.51 
 
 		 412 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1377  DNA polymerase IV  38.54 
 
 		 431 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  40 
 
 		 356 aa  232  9e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  36.56 
 
 		 409 aa  232  9e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  39.41 
 
 		 432 aa  232  9e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  37.79 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  33.77 
 
 		 412 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  40.29 
 
 		 378 aa  231  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  38.02 
 
 		 417 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  38.02 
 
 		 449 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2445  DNA polymerase IV  36.87 
 
 		 429 aa  229  5e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255034  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  37.89 
 
 		 417 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  39.71 
 
 		 481 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  37.05 
 
 		 417 aa  227  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  37 
 
 		 408 aa  227  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6871  DNA-directed DNA polymerase  35.01 
 
 		 404 aa  227  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  36.83 
 
 		 413 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  36.29 
 
 		 409 aa  226  6e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  38.28 
 
 		 423 aa  226  6e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  34.68 
 
 		 414 aa  226  7e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  40.62 
 
 		 414 aa  225  9e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  35.81 
 
 		 429 aa  225  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  40.94 
 
 		 354 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7420  DNA polymerase IV  39.68 
 
 		 429 aa  225  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108606  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0622  DNA-directed DNA polymerase  36.18 
 
 		 365 aa  225  1e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  35.71 
 
 		 435 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  35.73 
 
 		 409 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  36.43 
 
 		 432 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1370  DNA-directed DNA polymerase  36.05 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.67195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0937  DNA-directed DNA polymerase  38.52 
 
 		 436 aa  224  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  32.73 
 
 		 412 aa  224  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  36.1 
 
 		 369 aa  224  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  35.92 
 
 		 371 aa  223  6e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  36.75 
 
 		 418 aa  222  7e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  38.83 
 
 		 430 aa  222  9e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  35 
 
 		 385 aa  222  9e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  36.51 
 
 		 423 aa  222  9e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5260  DNA polymerase IV  39.05 
 
 		 415 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3545  UMUC-like DNA-repair protein  40.38 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  38.94 
 
 		 383 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1285  DNA polymerase IV  37.74 
 
 		 431 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25949  normal  0.0407739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>