More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1547 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 425 aa  875    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  42.64 
 
 		 390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  42.41 
 
 		 391 aa  300  3e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  41.62 
 
 		 390 aa  294  2e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  41.62 
 
 		 397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  38.97 
 
 		 425 aa  281  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  41.18 
 
 		 426 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  39.79 
 
 		 412 aa  279  7e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  37.44 
 
 		 393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  40.84 
 
 		 385 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  43.18 
 
 		 481 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  41.15 
 
 		 386 aa  265  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  42.06 
 
 		 384 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  39.64 
 
 		 424 aa  261  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  39.12 
 
 		 417 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  37.63 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3235  DNA-directed DNA polymerase  37.95 
 
 		 380 aa  253  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3247  DNA-directed DNA polymerase  39.07 
 
 		 459 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6871  DNA-directed DNA polymerase  38.46 
 
 		 404 aa  253  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13520  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  37.38 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  41.11 
 
 		 399 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  39.06 
 
 		 410 aa  249  5e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1370  DNA-directed DNA polymerase  36.88 
 
 		 385 aa  247  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.67195 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  36.79 
 
 		 399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  38.99 
 
 		 409 aa  246  4.9999999999999997e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  39.06 
 
 		 385 aa  245  9e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0687  DNA-directed DNA polymerase  36.06 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000344848  hitchhiker  0.00527115 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1555  DNA-directed DNA polymerase  37.41 
 
 		 422 aa  245  9.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.558973  normal  0.0210398 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  37.05 
 
 		 385 aa  245  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  37.44 
 
 		 418 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  37.92 
 
 		 418 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1274  DNA polymerase IV  38.52 
 
 		 436 aa  243  5e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0719979  normal  0.0370886 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  37.92 
 
 		 418 aa  243  7e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  35.66 
 
 		 409 aa  241  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  36.03 
 
 		 412 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  36.73 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  37.21 
 
 		 414 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  39.33 
 
 		 356 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06310  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  33.88 
 
 		 454 aa  239  8e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  37.79 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  36.56 
 
 		 368 aa  237  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  35.86 
 
 		 412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  34.46 
 
 		 412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  38.21 
 
 		 420 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  37.78 
 
 		 364 aa  234  3e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  35.08 
 
 		 412 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  35.73 
 
 		 395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  34.99 
 
 		 412 aa  233  5e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  34.99 
 
 		 412 aa  233  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  34.99 
 
 		 412 aa  233  5e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  34.87 
 
 		 409 aa  233  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  34.99 
 
 		 412 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  34.73 
 
 		 412 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  34.99 
 
 		 412 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  37.08 
 
 		 408 aa  232  8.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  35.79 
 
 		 408 aa  232  8.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3768  DNA-directed DNA polymerase  36.25 
 
 		 394 aa  231  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  39.53 
 
 		 378 aa  231  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  38.38 
 
 		 417 aa  231  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0276  DNA polymerase IV  38.92 
 
 		 351 aa  231  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.820662 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  34.73 
 
 		 412 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0260  DNA polymerase IV  38.92 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0265  DNA polymerase IV  38.92 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  37.24 
 
 		 406 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  33.85 
 
 		 409 aa  229  6e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4919  DNA-directed DNA polymerase  36.91 
 
 		 416 aa  229  7e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  36.81 
 
 		 408 aa  229  7e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3568  DNA-directed DNA polymerase  36.5 
 
 		 393 aa  229  8e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00226  DNA polymerase IV  38.64 
 
 		 351 aa  229  9e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3376  DNA-directed DNA polymerase  38.64 
 
 		 351 aa  229  9e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  35.06 
 
 		 408 aa  229  9e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3349  DNA polymerase IV  38.64 
 
 		 351 aa  229  9e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00229  hypothetical protein  38.64 
 
 		 351 aa  229  9e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  40.78 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0228  DNA polymerase IV  38.57 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.190428  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0285  DNA polymerase IV  38.64 
 
 		 351 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  37.16 
 
 		 372 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  38.21 
 
 		 435 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  37.96 
 
 		 432 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  35.55 
 
 		 395 aa  227  3e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  37.22 
 
 		 364 aa  227  3e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  36.07 
 
 		 429 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  37.53 
 
 		 413 aa  227  3e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  36.09 
 
 		 407 aa  227  3e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  37.89 
 
 		 445 aa  227  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  37.78 
 
 		 354 aa  227  4e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  38.46 
 
 		 402 aa  226  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  36.49 
 
 		 371 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  37.92 
 
 		 419 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  38.98 
 
 		 419 aa  226  7e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  38.64 
 
 		 417 aa  226  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  39.43 
 
 		 417 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  37.63 
 
 		 445 aa  225  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  40.16 
 
 		 834 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  38.64 
 
 		 449 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  37.28 
 
 		 453 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  37.95 
 
 		 466 aa  224  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  38.17 
 
 		 419 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0923  DNA polymerase IV  37.11 
 
 		 430 aa  224  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7420  DNA polymerase IV  35.28 
 
 		 429 aa  224  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>