More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1362 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 393 aa  806    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  43.78 
 
 		 399 aa  325  8.000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  44.68 
 
 		 425 aa  320  3e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  43.19 
 
 		 397 aa  317  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  42.3 
 
 		 410 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  41.18 
 
 		 385 aa  312  7.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  44.09 
 
 		 385 aa  309  6.999999999999999e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  43.73 
 
 		 389 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  42.56 
 
 		 384 aa  300  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  40.16 
 
 		 420 aa  298  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  40.89 
 
 		 424 aa  296  3e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  40.93 
 
 		 399 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  40.46 
 
 		 418 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  40.46 
 
 		 418 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  39.13 
 
 		 408 aa  290  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  41.18 
 
 		 426 aa  291  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  40.62 
 
 		 410 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  40.76 
 
 		 430 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  40.52 
 
 		 417 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  39.53 
 
 		 408 aa  286  5.999999999999999e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  39.95 
 
 		 418 aa  285  7e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  41.13 
 
 		 409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  42.61 
 
 		 374 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  42.45 
 
 		 378 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  42.45 
 
 		 378 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  40.11 
 
 		 419 aa  282  9e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  39.64 
 
 		 415 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  40.1 
 
 		 422 aa  281  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  38.83 
 
 		 419 aa  281  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  39.95 
 
 		 386 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  38.82 
 
 		 402 aa  280  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  40.1 
 
 		 432 aa  280  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  37.63 
 
 		 395 aa  280  5e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  39.48 
 
 		 417 aa  279  6e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  39.55 
 
 		 408 aa  278  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  42.04 
 
 		 385 aa  277  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  43.99 
 
 		 481 aa  277  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  39.32 
 
 		 406 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  41.59 
 
 		 354 aa  276  5e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  40.16 
 
 		 415 aa  275  1.0000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  38.44 
 
 		 430 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  40.68 
 
 		 412 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  40.11 
 
 		 385 aa  272  6e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  40.06 
 
 		 359 aa  272  6e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  42.73 
 
 		 355 aa  272  7e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  41.18 
 
 		 356 aa  272  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  37.44 
 
 		 425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  39.22 
 
 		 423 aa  270  4e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  38.28 
 
 		 417 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  37.31 
 
 		 391 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  39.9 
 
 		 417 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  39.9 
 
 		 449 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1274  DNA polymerase IV  37.5 
 
 		 436 aa  268  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0719979  normal  0.0370886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  40.06 
 
 		 371 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  37.53 
 
 		 431 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  36.32 
 
 		 407 aa  266  4e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  40.06 
 
 		 369 aa  266  5e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  37.11 
 
 		 407 aa  266  5e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  37.04 
 
 		 432 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  38.62 
 
 		 423 aa  264  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  38.59 
 
 		 371 aa  264  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  42.51 
 
 		 353 aa  264  2e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  37.11 
 
 		 435 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  41.3 
 
 		 385 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  42.73 
 
 		 364 aa  263  4.999999999999999e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  39.33 
 
 		 359 aa  262  6.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  40.41 
 
 		 363 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  36.58 
 
 		 429 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  36.79 
 
 		 395 aa  260  3e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  40.59 
 
 		 378 aa  259  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  39.07 
 
 		 402 aa  260  4e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2410  DNA polymerase IV  36.22 
 
 		 429 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.18017 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  40.94 
 
 		 466 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  38.28 
 
 		 414 aa  259  7e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  38.7 
 
 		 409 aa  259  8e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2507  DNA-directed DNA polymerase  40.53 
 
 		 358 aa  258  9e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  37.34 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  37.92 
 
 		 409 aa  258  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  36.94 
 
 		 445 aa  257  3e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  39.88 
 
 		 363 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  40.23 
 
 		 359 aa  256  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  38.52 
 
 		 419 aa  256  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1370  DNA-directed DNA polymerase  38.21 
 
 		 385 aa  256  5e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.67195 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  38.76 
 
 		 360 aa  256  6e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  36.94 
 
 		 445 aa  255  8e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  34.98 
 
 		 453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1429  DNA polymerase IV  36.98 
 
 		 429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.587123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  39.71 
 
 		 378 aa  254  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  37.28 
 
 		 408 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2445  DNA polymerase IV  35.75 
 
 		 429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255034  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  41 
 
 		 360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  39.64 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3394  DNA polymerase IV  40.88 
 
 		 364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320161  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0362  DNA polymerase IV  39.07 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.933253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0347  DNA polymerase IV  39.07 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  41.18 
 
 		 357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3530  DNA polymerase IV  38.81 
 
 		 421 aa  253  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  40.06 
 
 		 360 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0354  DNA polymerase IV  39.07 
 
 		 351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5685  DNA polymerase IV  36.64 
 
 		 424 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>