More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2856 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 406 aa  805    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  74.94 
 
 		 410 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  68.8 
 
 		 422 aa  503  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  64.25 
 
 		 402 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  60.72 
 
 		 424 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  62.53 
 
 		 407 aa  443  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  58.72 
 
 		 420 aa  432  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  60.2 
 
 		 430 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  61.31 
 
 		 419 aa  430  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  57.43 
 
 		 417 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  57.7 
 
 		 408 aa  420  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  59.5 
 
 		 419 aa  418  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  56.14 
 
 		 408 aa  410  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  54.59 
 
 		 407 aa  391  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  56.1 
 
 		 430 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  55.75 
 
 		 415 aa  386  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  55.9 
 
 		 415 aa  385  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  53.94 
 
 		 410 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  54.34 
 
 		 414 aa  371  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  46.49 
 
 		 413 aa  315  7e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  46.98 
 
 		 399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13710  DNA polymerase IV involved in DNA repair  48.73 
 
 		 431 aa  300  3e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  43.4 
 
 		 408 aa  300  3e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  46.63 
 
 		 409 aa  298  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  45.58 
 
 		 425 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  48.57 
 
 		 418 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  40.1 
 
 		 393 aa  286  2.9999999999999996e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  47.71 
 
 		 418 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  47.71 
 
 		 418 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10700  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  46.09 
 
 		 422 aa  281  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00310871  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  44.42 
 
 		 386 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  44.57 
 
 		 481 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  41.78 
 
 		 384 aa  273  3e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  45.26 
 
 		 407 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  38.58 
 
 		 389 aa  270  5e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  45.61 
 
 		 399 aa  270  5e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  36.5 
 
 		 395 aa  269  8e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3609  DNA-directed DNA polymerase  44.97 
 
 		 405 aa  266  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3810  DNA polymerase IV  43.51 
 
 		 428 aa  266  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0803828  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  40.37 
 
 		 390 aa  266  5.999999999999999e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  41.15 
 
 		 408 aa  265  7e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  39.95 
 
 		 391 aa  266  7e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  39.15 
 
 		 390 aa  265  8.999999999999999e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  39.41 
 
 		 385 aa  265  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1686  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  39.8 
 
 		 424 aa  265  1e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  41.78 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  45.8 
 
 		 466 aa  264  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  41.56 
 
 		 426 aa  264  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  44.44 
 
 		 374 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  45.19 
 
 		 395 aa  259  8e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  37.76 
 
 		 409 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  44.27 
 
 		 402 aa  257  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  41.95 
 
 		 445 aa  256  4e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  37.76 
 
 		 409 aa  256  7e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  42.18 
 
 		 445 aa  255  9e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  47.94 
 
 		 378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  43.3 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  47.94 
 
 		 378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  42.71 
 
 		 417 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  43.35 
 
 		 385 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  39.58 
 
 		 412 aa  252  6e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5685  DNA polymerase IV  42.15 
 
 		 424 aa  253  6e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273553 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  42.74 
 
 		 373 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  42.17 
 
 		 834 aa  249  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  45.01 
 
 		 355 aa  249  5e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  41.1 
 
 		 385 aa  249  8e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0243  ImpB/MucB/SamB family protein  35.89 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  43.52 
 
 		 369 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  42.52 
 
 		 378 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  40.62 
 
 		 417 aa  247  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  42.45 
 
 		 359 aa  248  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  41.64 
 
 		 432 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2445  DNA polymerase IV  40.85 
 
 		 429 aa  246  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255034  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  37.76 
 
 		 409 aa  246  6e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  39.53 
 
 		 371 aa  246  6.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4326  DNA-directed DNA polymerase  47.55 
 
 		 463 aa  245  8e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  46.18 
 
 		 413 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  39.48 
 
 		 410 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1377  DNA polymerase IV  40.85 
 
 		 431 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5438  DNA polymerase IV  42.11 
 
 		 407 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3530  DNA polymerase IV  43.6 
 
 		 421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  40.89 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  40.89 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  43.89 
 
 		 421 aa  244  3e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  40.89 
 
 		 449 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5059  DNA polymerase IV  42.37 
 
 		 407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5147  DNA polymerase IV  42.37 
 
 		 407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  41.91 
 
 		 436 aa  243  5e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  41.91 
 
 		 418 aa  243  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  40.05 
 
 		 423 aa  243  6e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  40.05 
 
 		 435 aa  242  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  42.36 
 
 		 432 aa  242  7.999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  38.81 
 
 		 364 aa  242  9e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  45.51 
 
 		 356 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  42.42 
 
 		 419 aa  241  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  41.78 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  44.41 
 
 		 356 aa  239  4e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  37.63 
 
 		 395 aa  240  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1745  DNA polymerase IV  41.54 
 
 		 428 aa  239  6.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  39.36 
 
 		 453 aa  239  8e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>