More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1314 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  100 
 
 		 399 aa  822    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  42.01 
 
 		 414 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  37.19 
 
 		 395 aa  289  7e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  42.98 
 
 		 414 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  37.09 
 
 		 400 aa  277  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0370  DNA-directed DNA polymerase  40.1 
 
 		 423 aa  277  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  39.25 
 
 		 412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  39 
 
 		 412 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  39 
 
 		 412 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  39 
 
 		 412 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  39 
 
 		 412 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  38.5 
 
 		 412 aa  269  5e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  38.5 
 
 		 412 aa  269  8e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  37.75 
 
 		 412 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  37.72 
 
 		 395 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  37.75 
 
 		 412 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  37.59 
 
 		 412 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2727  DNA-directed DNA polymerase  38.21 
 
 		 400 aa  261  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115509  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  40.21 
 
 		 408 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2364  DNA-directed DNA polymerase  37.34 
 
 		 409 aa  261  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259486  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  37.25 
 
 		 412 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  38.14 
 
 		 409 aa  256  5e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  39.95 
 
 		 407 aa  256  6e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2007  UMUC domain protein DNA-repair protein  37.12 
 
 		 413 aa  256  6e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.470929  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  37.82 
 
 		 409 aa  255  7e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  39.44 
 
 		 397 aa  256  7e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  37.63 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2083  DNA-directed DNA polymerase  35.84 
 
 		 399 aa  253  3e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.968018  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  37.79 
 
 		 409 aa  249  4e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  37.79 
 
 		 409 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  35.99 
 
 		 410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  37.95 
 
 		 413 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  36.88 
 
 		 410 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  35.75 
 
 		 393 aa  240  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  37.5 
 
 		 385 aa  239  5.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3921  DNA-directed DNA polymerase  33.5 
 
 		 432 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019973  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  36.6 
 
 		 385 aa  236  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  35.13 
 
 		 425 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  35.32 
 
 		 411 aa  236  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  33.77 
 
 		 430 aa  235  9e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  35.29 
 
 		 385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  33.25 
 
 		 422 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  36.5 
 
 		 384 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1670  DNA-directed DNA polymerase  35.09 
 
 		 419 aa  233  6e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000999976  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0282  DNA-directed DNA polymerase  37.28 
 
 		 421 aa  232  7.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  36.91 
 
 		 371 aa  232  8.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  34.19 
 
 		 399 aa  229  9e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  36.43 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3235  DNA-directed DNA polymerase  34.51 
 
 		 380 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  34.78 
 
 		 410 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  35.71 
 
 		 412 aa  228  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  35.77 
 
 		 399 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2316  DNA-directed DNA polymerase  34.76 
 
 		 411 aa  228  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  36.18 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  35.92 
 
 		 391 aa  227  3e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22180  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  34.24 
 
 		 432 aa  227  3e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000141857  normal  0.0200421 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  35.09 
 
 		 408 aa  226  4e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  36.42 
 
 		 481 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  33.8 
 
 		 424 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  35.55 
 
 		 385 aa  224  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  32.91 
 
 		 417 aa  223  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  34.5 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  30.98 
 
 		 410 aa  221  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  34.23 
 
 		 419 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0224  DNA-directed DNA polymerase  34.53 
 
 		 413 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  32.31 
 
 		 415 aa  219  6e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  32.91 
 
 		 420 aa  219  7.999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  33.76 
 
 		 426 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  34.9 
 
 		 408 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1154  DNA-directed DNA polymerase  31.65 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000057173  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1370  DNA-directed DNA polymerase  33.68 
 
 		 385 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.67195 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  35.98 
 
 		 345 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3768  DNA-directed DNA polymerase  32.75 
 
 		 394 aa  216  4e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  33.92 
 
 		 409 aa  215  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  35.39 
 
 		 360 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  30.67 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  33.77 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  33.8 
 
 		 418 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  34.19 
 
 		 415 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3568  DNA-directed DNA polymerase  32.75 
 
 		 393 aa  212  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  33.52 
 
 		 418 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5871  DNA-directed DNA polymerase  33.78 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.937041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  36.44 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  32.66 
 
 		 408 aa  210  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  30.52 
 
 		 407 aa  209  6e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  35.84 
 
 		 358 aa  209  7e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  32.96 
 
 		 418 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  33.16 
 
 		 414 aa  207  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  33.53 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  34.78 
 
 		 367 aa  206  6e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  32.46 
 
 		 436 aa  206  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  31.87 
 
 		 432 aa  205  9e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  32.65 
 
 		 418 aa  205  9e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  34.62 
 
 		 378 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  34.62 
 
 		 378 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  31.98 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6871  DNA-directed DNA polymerase  31.7 
 
 		 404 aa  204  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1177  DNA-directed DNA polymerase  31.84 
 
 		 448 aa  204  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.515065  normal  0.177083 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  36.23 
 
 		 359 aa  202  6e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  30.96 
 
 		 435 aa  202  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>