More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3236 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  92.84 
 
 		 419 aa  732    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 419 aa  820    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  61.13 
 
 		 422 aa  437  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  61.54 
 
 		 402 aa  436  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  58.54 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  59.5 
 
 		 406 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  57.39 
 
 		 410 aa  423  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  55.91 
 
 		 410 aa  419  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  57.79 
 
 		 424 aa  413  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  56.2 
 
 		 415 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  57.95 
 
 		 417 aa  398  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  57.88 
 
 		 407 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  56.99 
 
 		 420 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  53.75 
 
 		 414 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  50.37 
 
 		 408 aa  366  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  53.23 
 
 		 415 aa  359  6e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  51.68 
 
 		 430 aa  356  5e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  51.71 
 
 		 407 aa  355  8.999999999999999e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  48.56 
 
 		 408 aa  350  3e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  53.78 
 
 		 418 aa  319  7e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  53.39 
 
 		 418 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  53.39 
 
 		 418 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  46.63 
 
 		 413 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  50.14 
 
 		 399 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  42.18 
 
 		 408 aa  298  9e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  45.55 
 
 		 399 aa  293  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13710  DNA polymerase IV involved in DNA repair  47.15 
 
 		 431 aa  291  2e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  39.09 
 
 		 393 aa  290  3e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  47.03 
 
 		 409 aa  286  5.999999999999999e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  45.27 
 
 		 386 aa  285  8e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  46.99 
 
 		 481 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  49.7 
 
 		 466 aa  279  7e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  40.21 
 
 		 409 aa  277  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  41.36 
 
 		 384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  41.43 
 
 		 371 aa  273  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3609  DNA-directed DNA polymerase  45.15 
 
 		 405 aa  273  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  49.83 
 
 		 407 aa  271  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  44.71 
 
 		 412 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  39.43 
 
 		 409 aa  270  4e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  41.51 
 
 		 408 aa  270  5e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  36.91 
 
 		 389 aa  270  5e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  44.88 
 
 		 425 aa  269  5e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10700  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  44.61 
 
 		 422 aa  269  7e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00310871  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  39.43 
 
 		 409 aa  269  8e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1686  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  40.05 
 
 		 424 aa  268  1e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  46.44 
 
 		 385 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  42.42 
 
 		 426 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  41.33 
 
 		 421 aa  267  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  37.34 
 
 		 395 aa  266  4e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  48.01 
 
 		 355 aa  265  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  40.75 
 
 		 453 aa  264  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  42.9 
 
 		 380 aa  264  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  39.95 
 
 		 413 aa  263  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  42.02 
 
 		 436 aa  263  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  37.11 
 
 		 410 aa  262  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  38.05 
 
 		 409 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  40.43 
 
 		 445 aa  261  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  40.43 
 
 		 445 aa  260  3e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  44.86 
 
 		 378 aa  260  3e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3810  DNA polymerase IV  40.55 
 
 		 428 aa  260  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0803828  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  40.52 
 
 		 397 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  47.04 
 
 		 402 aa  259  7e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  43.23 
 
 		 432 aa  259  7e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  41.98 
 
 		 418 aa  257  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  38.93 
 
 		 391 aa  257  2e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  36.5 
 
 		 411 aa  256  5e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  37.47 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  43.71 
 
 		 834 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0243  ImpB/MucB/SamB family protein  35.15 
 
 		 409 aa  253  5.000000000000001e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06310  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  41.6 
 
 		 454 aa  253  6e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  40.37 
 
 		 435 aa  252  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  39.59 
 
 		 410 aa  252  8.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  41.88 
 
 		 413 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  46.78 
 
 		 374 aa  252  9.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  42.06 
 
 		 375 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2975  DNA polymerase IV  50.15 
 
 		 443 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.949481  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  38.13 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  42.34 
 
 		 378 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  40.21 
 
 		 407 aa  251  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  45.74 
 
 		 381 aa  250  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  41.92 
 
 		 356 aa  250  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  43.17 
 
 		 363 aa  250  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  41.92 
 
 		 356 aa  250  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  43.81 
 
 		 395 aa  250  4e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  39.26 
 
 		 417 aa  249  6e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5438  DNA polymerase IV  47.18 
 
 		 407 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  38.18 
 
 		 429 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  45.16 
 
 		 356 aa  249  9e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  41.25 
 
 		 385 aa  248  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  50 
 
 		 378 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  50 
 
 		 378 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5685  DNA polymerase IV  46.51 
 
 		 424 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273553 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1377  DNA polymerase IV  40 
 
 		 431 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2410  DNA polymerase IV  38.96 
 
 		 429 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.18017 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5059  DNA polymerase IV  42.53 
 
 		 407 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5147  DNA polymerase IV  42.53 
 
 		 407 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  39.42 
 
 		 431 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1745  DNA polymerase IV  42.6 
 
 		 428 aa  246  6.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0923  DNA polymerase IV  42.43 
 
 		 430 aa  246  8e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1021  DNA polymerase IV  44.81 
 
 		 401 aa  246  8e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.6656  normal  0.0517924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>