More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0758 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  100 
 
 		 395 aa  783    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  66.58 
 
 		 400 aa  506  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  54.8 
 
 		 395 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  46.33 
 
 		 408 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  44.71 
 
 		 409 aa  301  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  42.74 
 
 		 409 aa  300  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  42.75 
 
 		 409 aa  298  9e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  43.01 
 
 		 409 aa  294  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  44.47 
 
 		 407 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  41.56 
 
 		 410 aa  289  6e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  37.19 
 
 		 399 aa  289  7e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  46.35 
 
 		 410 aa  281  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  40.21 
 
 		 411 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  43.36 
 
 		 414 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  41.65 
 
 		 414 aa  279  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  43.04 
 
 		 410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  41.71 
 
 		 413 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2364  DNA-directed DNA polymerase  41.37 
 
 		 409 aa  270  4e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259486  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  45.97 
 
 		 422 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  43.46 
 
 		 386 aa  268  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0370  DNA-directed DNA polymerase  39.29 
 
 		 423 aa  267  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2083  DNA-directed DNA polymerase  37.88 
 
 		 399 aa  266  4e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.968018  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1670  DNA-directed DNA polymerase  38.92 
 
 		 419 aa  265  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000999976  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  41.51 
 
 		 408 aa  264  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  37.98 
 
 		 385 aa  263  4e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  41.97 
 
 		 399 aa  263  4.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2316  DNA-directed DNA polymerase  37.56 
 
 		 411 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  36.79 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2727  DNA-directed DNA polymerase  37.44 
 
 		 400 aa  259  7e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115509  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  42.23 
 
 		 425 aa  257  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  40.31 
 
 		 408 aa  257  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  40.26 
 
 		 412 aa  256  7e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  44.04 
 
 		 420 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  39.33 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  44.42 
 
 		 406 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  42.36 
 
 		 430 aa  254  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  43.12 
 
 		 424 aa  252  7e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2007  UMUC domain protein DNA-repair protein  35.57 
 
 		 413 aa  251  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.470929  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  37.2 
 
 		 391 aa  250  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  35.31 
 
 		 412 aa  250  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  43.04 
 
 		 430 aa  250  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  44.15 
 
 		 356 aa  250  4e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1154  DNA-directed DNA polymerase  37.56 
 
 		 417 aa  249  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000057173  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  38.35 
 
 		 426 aa  249  7e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  34.79 
 
 		 412 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  42.32 
 
 		 399 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  36.68 
 
 		 390 aa  245  8e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  41.13 
 
 		 410 aa  245  9e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  34.54 
 
 		 412 aa  245  9e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  34.54 
 
 		 412 aa  245  9e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  40.16 
 
 		 385 aa  245  9e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  34.54 
 
 		 412 aa  245  9e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  34.79 
 
 		 412 aa  245  9e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  34.54 
 
 		 412 aa  245  9e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  34.28 
 
 		 412 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  34.54 
 
 		 412 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  37.15 
 
 		 408 aa  245  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  40.31 
 
 		 414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3921  DNA-directed DNA polymerase  36.51 
 
 		 432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019973  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  42.38 
 
 		 415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  43.65 
 
 		 419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  34.46 
 
 		 412 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  44.94 
 
 		 419 aa  242  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  37.82 
 
 		 371 aa  242  7e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  39.02 
 
 		 423 aa  241  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  41.1 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  35.92 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3025  DNA-directed DNA polymerase  39.95 
 
 		 418 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  39.22 
 
 		 384 aa  239  5e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  35.36 
 
 		 390 aa  239  5.999999999999999e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  33.16 
 
 		 412 aa  238  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  38.22 
 
 		 432 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  37.96 
 
 		 429 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0224  DNA-directed DNA polymerase  35.32 
 
 		 413 aa  237  3e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  41.39 
 
 		 419 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  38.05 
 
 		 417 aa  236  6e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  41.98 
 
 		 380 aa  236  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  42.45 
 
 		 355 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  41.97 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  40.26 
 
 		 449 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  35.73 
 
 		 425 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  40.26 
 
 		 417 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3810  DNA polymerase IV  41.4 
 
 		 428 aa  233  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0803828  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  41.07 
 
 		 421 aa  233  6e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  44.61 
 
 		 418 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2410  DNA polymerase IV  37.96 
 
 		 429 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.18017 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  37.79 
 
 		 385 aa  231  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  44.31 
 
 		 418 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  41.03 
 
 		 409 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  40.41 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0282  DNA-directed DNA polymerase  35.62 
 
 		 421 aa  230  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  36.6 
 
 		 431 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  44.61 
 
 		 418 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  38.27 
 
 		 407 aa  230  4e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  38.22 
 
 		 418 aa  229  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  37.53 
 
 		 445 aa  229  9e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3437  DNA-directed DNA polymerase  36.82 
 
 		 417 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000548211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1377  DNA polymerase IV  36.53 
 
 		 431 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  37.53 
 
 		 445 aa  228  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  41.74 
 
 		 378 aa  227  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>