More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3437 on replicon NC_012794
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012794  GWCH70_3437  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 417 aa  868    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000548211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13250  DNA-directed DNA polymerase  50.71 
 
 		 419 aa  433  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000669241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3279  impB/mucB/samB family protein  44.73 
 
 		 421 aa  342  9e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0241  ImpB/MucB/SamB family protein  44.29 
 
 		 421 aa  341  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.969005  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0061  DNA-damage repair protein  44.29 
 
 		 421 aa  341  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0094  ImpB/MucB/SamB family protein  44.29 
 
 		 421 aa  340  4e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000984715  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3053  impB/mucB/samB family protein  44.5 
 
 		 421 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.937265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3288  impB/mucB/samB family protein  44.5 
 
 		 421 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0140  DNA-damage repair protein  45.2 
 
 		 421 aa  331  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3154  ImpB/MucB/SamB family protein  43.79 
 
 		 424 aa  328  8e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.405487  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1425  DNA-directed DNA polymerase  39.72 
 
 		 420 aa  305  9.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1454  DNA-directed DNA polymerase  39.72 
 
 		 420 aa  305  9.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0935  ImpB/MucB/SamB family protein  40.19 
 
 		 420 aa  298  1e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  36.97 
 
 		 400 aa  232  8.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1339  SOS responce UmuC protein  33.05 
 
 		 471 aa  230  5e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0479412  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  36.82 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3025  DNA-directed DNA polymerase  35.34 
 
 		 418 aa  227  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0794  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  34.53 
 
 		 420 aa  225  1e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.387249  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  36.36 
 
 		 395 aa  222  9e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1094  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  33.33 
 
 		 440 aa  219  6e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20731  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0974  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  34.13 
 
 		 440 aa  219  7e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0264968  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1455  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  33.64 
 
 		 439 aa  216  7e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1270  ImpB/MucB/SamB family protein  33.19 
 
 		 471 aa  211  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366213  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  33.6 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  32.99 
 
 		 408 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  32.19 
 
 		 399 aa  188  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  34 
 
 		 414 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02290  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  31.74 
 
 		 425 aa  186  6e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  33.16 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  32.19 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  32.53 
 
 		 411 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1117  UMUC domain protein DNA-repair protein  30.14 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  31.75 
 
 		 409 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  32.37 
 
 		 410 aa  179  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1329  DNA-directed DNA polymerase  30.94 
 
 		 421 aa  178  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  30.63 
 
 		 409 aa  176  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  30.1 
 
 		 409 aa  176  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  32.34 
 
 		 410 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3921  DNA-directed DNA polymerase  30.71 
 
 		 432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019973  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1465  UMUC domain protein DNA-repair protein  31 
 
 		 443 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  32.13 
 
 		 414 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  31.9 
 
 		 399 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2364  DNA-directed DNA polymerase  30.83 
 
 		 409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259486  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  29.89 
 
 		 409 aa  161  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1266  UV damage repair protein, ImpB/MucB/SamB family  28.04 
 
 		 488 aa  154  2e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.185174  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  29.08 
 
 		 393 aa  153  5.9999999999999996e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  29.49 
 
 		 412 aa  153  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  29.49 
 
 		 412 aa  153  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  29.49 
 
 		 412 aa  153  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  29.49 
 
 		 412 aa  153  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  29.49 
 
 		 412 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2148  DNA-repair protein  27.58 
 
 		 507 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  31.3 
 
 		 385 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2083  DNA-directed DNA polymerase  28.33 
 
 		 399 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.968018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  29.23 
 
 		 412 aa  150  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  31.14 
 
 		 397 aa  149  8e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  29.29 
 
 		 412 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  29.55 
 
 		 412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1306  DNA-repair protein  27.16 
 
 		 500 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  28.97 
 
 		 412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0370  DNA-directed DNA polymerase  29.06 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  28.64 
 
 		 407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  29.04 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  29.04 
 
 		 412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2727  DNA-directed DNA polymerase  27.34 
 
 		 400 aa  146  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115509  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  29.85 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  29.41 
 
 		 425 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0871  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  28.12 
 
 		 529 aa  145  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  29.97 
 
 		 424 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  28.11 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  27.63 
 
 		 430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  27.25 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  30.41 
 
 		 425 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1670  DNA-directed DNA polymerase  28.64 
 
 		 419 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000999976  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  27.36 
 
 		 408 aa  139  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  26.63 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  30.45 
 
 		 406 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  28.01 
 
 		 430 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  29.81 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  27.96 
 
 		 408 aa  136  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1154  DNA-directed DNA polymerase  27.96 
 
 		 417 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000057173  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2316  DNA-directed DNA polymerase  28.32 
 
 		 411 aa  136  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  28.64 
 
 		 420 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0705  DNA-directed DNA polymerase  26.34 
 
 		 450 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  30.41 
 
 		 385 aa  133  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  26.63 
 
 		 419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0282  DNA-directed DNA polymerase  29.11 
 
 		 421 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  29.62 
 
 		 386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3073  DNA-directed DNA polymerase  26.02 
 
 		 414 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  28.21 
 
 		 419 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3609  DNA-directed DNA polymerase  29.93 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  26.43 
 
 		 421 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2007  UMUC domain protein DNA-repair protein  25.95 
 
 		 413 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.470929  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  28.82 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  29.36 
 
 		 367 aa  127  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  26.98 
 
 		 417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22180  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.99 
 
 		 432 aa  126  9e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000141857  normal  0.0200421 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  27.05 
 
 		 419 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1285  DNA polymerase IV  25.06 
 
 		 431 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25949  normal  0.0407739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  28.04 
 
 		 410 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>