More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0935 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0935  ImpB/MucB/SamB family protein  100 
 
 		 420 aa  875    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1425  DNA-directed DNA polymerase  84.52 
 
 		 420 aa  769    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1454  DNA-directed DNA polymerase  84.52 
 
 		 420 aa  769    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0094  ImpB/MucB/SamB family protein  52.49 
 
 		 421 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000984715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3154  ImpB/MucB/SamB family protein  53.21 
 
 		 424 aa  456  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.405487  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0241  ImpB/MucB/SamB family protein  51.07 
 
 		 421 aa  456  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.969005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3053  impB/mucB/samB family protein  52.02 
 
 		 421 aa  455  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.937265  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0061  DNA-damage repair protein  51.78 
 
 		 421 aa  458  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3288  impB/mucB/samB family protein  52.02 
 
 		 421 aa  455  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3279  impB/mucB/samB family protein  51.54 
 
 		 421 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0140  DNA-damage repair protein  51.54 
 
 		 421 aa  448  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13250  DNA-directed DNA polymerase  41.37 
 
 		 419 aa  311  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000669241  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3437  DNA-directed DNA polymerase  40.19 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000548211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0974  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  34.81 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0264968  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1455  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  34.63 
 
 		 439 aa  244  3e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0794  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  35.58 
 
 		 420 aa  238  2e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.387249  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02290  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  33.81 
 
 		 425 aa  237  3e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1094  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  34.97 
 
 		 440 aa  234  3e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20731  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1339  SOS responce UmuC protein  32.32 
 
 		 471 aa  229  6e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0479412  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1329  DNA-directed DNA polymerase  32.78 
 
 		 421 aa  222  8e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1270  ImpB/MucB/SamB family protein  32.47 
 
 		 471 aa  219  5e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366213  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1117  UMUC domain protein DNA-repair protein  31.32 
 
 		 447 aa  218  2e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1465  UMUC domain protein DNA-repair protein  28.86 
 
 		 443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2148  DNA-repair protein  30.43 
 
 		 507 aa  208  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1306  DNA-repair protein  28.23 
 
 		 500 aa  191  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  33.17 
 
 		 395 aa  184  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  34.05 
 
 		 400 aa  182  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0871  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  33.05 
 
 		 529 aa  171  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  31.05 
 
 		 399 aa  170  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1266  UV damage repair protein, ImpB/MucB/SamB family  30.58 
 
 		 488 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.185174  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  30.33 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3025  DNA-directed DNA polymerase  30.62 
 
 		 418 aa  158  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  29.82 
 
 		 408 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  32.41 
 
 		 413 aa  146  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  29.4 
 
 		 412 aa  143  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0370  DNA-directed DNA polymerase  29.38 
 
 		 423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  31.54 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  29.8 
 
 		 412 aa  141  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  28.79 
 
 		 412 aa  140  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  28.79 
 
 		 412 aa  140  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  28.79 
 
 		 412 aa  140  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  28.79 
 
 		 412 aa  140  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  31.61 
 
 		 414 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  29.04 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  29.37 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  29.22 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  28.79 
 
 		 412 aa  136  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  29.92 
 
 		 410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  28.57 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  30.49 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  30.79 
 
 		 409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  26.28 
 
 		 410 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  30.13 
 
 		 409 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  29.67 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22180  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.23 
 
 		 432 aa  127  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000141857  normal  0.0200421 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2727  DNA-directed DNA polymerase  27.97 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115509  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1154  DNA-directed DNA polymerase  27.48 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000057173  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3921  DNA-directed DNA polymerase  28.93 
 
 		 432 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019973  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0282  DNA-directed DNA polymerase  28.3 
 
 		 421 aa  124  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  30.23 
 
 		 410 aa  124  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2316  DNA-directed DNA polymerase  27.25 
 
 		 411 aa  122  9e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.24 
 
 		 407 aa  120  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2007  UMUC domain protein DNA-repair protein  27.86 
 
 		 413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.470929  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1670  DNA-directed DNA polymerase  27.41 
 
 		 419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000999976  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  25.98 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0224  DNA-directed DNA polymerase  26 
 
 		 413 aa  116  6e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  26.1 
 
 		 408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  23.99 
 
 		 385 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  31.08 
 
 		 411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  25.88 
 
 		 399 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0949  DNA-directed DNA polymerase  29.37 
 
 		 385 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.868276  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  26.13 
 
 		 422 aa  111  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2083  DNA-directed DNA polymerase  26.28 
 
 		 399 aa  111  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.968018  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  25.67 
 
 		 424 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2162  DNA polymerase V subunit UmuC  26.45 
 
 		 422 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.229342 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  24.57 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  26.73 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2158  DNA polymerase V subunit UmuC  26.2 
 
 		 422 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.512063  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  25.12 
 
 		 386 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  25.82 
 
 		 420 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  25.38 
 
 		 402 aa  107  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2215  DNA polymerase V subunit UmuC  26.2 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69246  normal  0.844364 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2364  DNA-directed DNA polymerase  23.93 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259486  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  25.77 
 
 		 432 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1982  DNA-directed DNA polymerase  25.52 
 
 		 423 aa  103  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  25.79 
 
 		 430 aa  103  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  25.12 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  26.32 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  24.69 
 
 		 431 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2410  DNA polymerase IV  25.19 
 
 		 429 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.18017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  25.44 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6871  DNA-directed DNA polymerase  26.15 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  25.62 
 
 		 425 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  26.12 
 
 		 412 aa  100  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  28.46 
 
 		 360 aa  99.8  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  27.35 
 
 		 356 aa  98.2  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  27.9 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  24.49 
 
 		 429 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3235  DNA-directed DNA polymerase  26.62 
 
 		 380 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  25 
 
 		 384 aa  98.2  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>