More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_0140 on replicon NC_011775
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3154  ImpB/MucB/SamB family protein  76.72 
 
 
424 aa  683    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.405487  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0241  ImpB/MucB/SamB family protein  80.76 
 
 
421 aa  727    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.969005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3053  impB/mucB/samB family protein  80.05 
 
 
421 aa  719    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.937265  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0061  DNA-damage repair protein  82.19 
 
 
421 aa  735    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0094  ImpB/MucB/SamB family protein  81.71 
 
 
421 aa  730    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000984715  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3279  impB/mucB/samB family protein  80.05 
 
 
421 aa  719    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3288  impB/mucB/samB family protein  80.05 
 
 
421 aa  719    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0140  DNA-damage repair protein  100 
 
 
421 aa  871    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0935  ImpB/MucB/SamB family protein  51.54 
 
 
420 aa  448  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1454  DNA-directed DNA polymerase  50.59 
 
 
420 aa  447  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1425  DNA-directed DNA polymerase  50.59 
 
 
420 aa  447  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3437  DNA-directed DNA polymerase  45.2 
 
 
417 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000548211  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13250  DNA-directed DNA polymerase  41.47 
 
 
419 aa  326  5e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000669241  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1094  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  37.06 
 
 
440 aa  277  3e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20731  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0974  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  36.21 
 
 
440 aa  269  5.9999999999999995e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0264968  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1455  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  35.24 
 
 
439 aa  269  7e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1339  SOS responce UmuC protein  33.84 
 
 
471 aa  262  1e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0479412  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0794  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  36.36 
 
 
420 aa  256  5e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.387249  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1270  ImpB/MucB/SamB family protein  35.42 
 
 
471 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366213  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02290  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  35.15 
 
 
425 aa  247  3e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1465  UMUC domain protein DNA-repair protein  32.88 
 
 
443 aa  240  4e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1117  UMUC domain protein DNA-repair protein  32.57 
 
 
447 aa  230  3e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1329  DNA-directed DNA polymerase  32.15 
 
 
421 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3025  DNA-directed DNA polymerase  34.13 
 
 
418 aa  202  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2148  DNA-repair protein  29.92 
 
 
507 aa  197  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  32.35 
 
 
395 aa  188  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1306  DNA-repair protein  28.6 
 
 
500 aa  179  5.999999999999999e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  32.59 
 
 
399 aa  176  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  31.16 
 
 
395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  31.4 
 
 
400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1266  UV damage repair protein, ImpB/MucB/SamB family  27.55 
 
 
488 aa  155  9e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.185174  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  31.41 
 
 
413 aa  151  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  30.95 
 
 
407 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  31.33 
 
 
408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  29.31 
 
 
409 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  28.81 
 
 
414 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2007  UMUC domain protein DNA-repair protein  28.68 
 
 
413 aa  144  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.470929  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0871  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  29.28 
 
 
529 aa  143  5e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1670  DNA-directed DNA polymerase  28.97 
 
 
419 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000999976  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  30.23 
 
 
410 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3921  DNA-directed DNA polymerase  30.38 
 
 
432 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019973  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  28.71 
 
 
408 aa  140  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  31.11 
 
 
409 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  30.15 
 
 
409 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  28.82 
 
 
409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  28.19 
 
 
425 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2727  DNA-directed DNA polymerase  30 
 
 
400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115509  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  29.13 
 
 
410 aa  134  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  29.8 
 
 
411 aa  132  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  29.62 
 
 
414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0370  DNA-directed DNA polymerase  28.19 
 
 
423 aa  130  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2364  DNA-directed DNA polymerase  27.3 
 
 
409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259486  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22180  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.59 
 
 
432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000141857  normal  0.0200421 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0282  DNA-directed DNA polymerase  29.53 
 
 
421 aa  123  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  26.23 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  26.38 
 
 
412 aa  119  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  26.88 
 
 
412 aa  119  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  26.38 
 
 
412 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2083  DNA-directed DNA polymerase  27.3 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.968018  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  27.02 
 
 
412 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  25.51 
 
 
412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1154  DNA-directed DNA polymerase  26.32 
 
 
417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000057173  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  26.08 
 
 
393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2316  DNA-directed DNA polymerase  25.44 
 
 
411 aa  117  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  26.23 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  25.25 
 
 
412 aa  117  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  25.25 
 
 
412 aa  117  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  25.25 
 
 
412 aa  117  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  25.25 
 
 
412 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  26.01 
 
 
412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  25.25 
 
 
412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  28.17 
 
 
420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1177  DNA-directed DNA polymerase  27.8 
 
 
448 aa  114  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.515065  normal  0.177083 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  26.51 
 
 
430 aa  112  9e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.73 
 
 
407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3073  DNA-directed DNA polymerase  25.81 
 
 
414 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  28.24 
 
 
422 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  27.3 
 
 
412 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  27.14 
 
 
385 aa  109  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  28.03 
 
 
354 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  26.25 
 
 
407 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.87 
 
 
415 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  26.13 
 
 
384 aa  107  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  26.84 
 
 
410 aa  106  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  24.68 
 
 
417 aa  106  9e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6871  DNA-directed DNA polymerase  26.15 
 
 
404 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0949  DNA-directed DNA polymerase  29.14 
 
 
385 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.868276  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  25.25 
 
 
385 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  27.23 
 
 
409 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  24.33 
 
 
421 aa  103  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0224  DNA-directed DNA polymerase  25.32 
 
 
413 aa  103  6e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2353  DNA-directed DNA polymerase  25.9 
 
 
424 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2458  DNA-directed DNA polymerase  26.15 
 
 
424 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  24.81 
 
 
386 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  25.94 
 
 
385 aa  103  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2005  DNA-directed DNA polymerase  25.9 
 
 
424 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000515421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  24.63 
 
 
435 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  27.48 
 
 
419 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2342  DNA-directed DNA polymerase  26.15 
 
 
424 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  27.39 
 
 
425 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>