More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3073 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3073  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 414 aa  845    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  35.68 
 
 		 410 aa  262  8e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  37.8 
 
 		 408 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  36.23 
 
 		 413 aa  256  6e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  35.21 
 
 		 409 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  36.85 
 
 		 411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  36.26 
 
 		 409 aa  251  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  34.39 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  36.53 
 
 		 409 aa  247  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  37.3 
 
 		 410 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  35.22 
 
 		 407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  36.2 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  35.4 
 
 		 395 aa  206  6e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13710  DNA polymerase IV involved in DNA repair  36.66 
 
 		 431 aa  205  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  35.62 
 
 		 410 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  33.5 
 
 		 397 aa  200  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  43.07 
 
 		 386 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  35.08 
 
 		 385 aa  195  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  33.68 
 
 		 384 aa  195  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  35.7 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  38.52 
 
 		 389 aa  190  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  31.67 
 
 		 399 aa  189  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  33.25 
 
 		 425 aa  187  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  30.81 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  33.16 
 
 		 408 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06310  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  33 
 
 		 454 aa  179  8e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0687  DNA-directed DNA polymerase  32.82 
 
 		 444 aa  177  3e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000344848  hitchhiker  0.00527115 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  39.64 
 
 		 481 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  36.34 
 
 		 419 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  34.34 
 
 		 415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  31.65 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  40.08 
 
 		 409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  33.17 
 
 		 419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  35.96 
 
 		 417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  35.1 
 
 		 418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  33.5 
 
 		 408 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  35.19 
 
 		 418 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1555  DNA-directed DNA polymerase  33.58 
 
 		 422 aa  172  6.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.558973  normal  0.0210398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  32.99 
 
 		 406 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  33.76 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  34.85 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  34.62 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  35.51 
 
 		 399 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  32.11 
 
 		 426 aa  170  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  33.95 
 
 		 385 aa  170  5e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  40.87 
 
 		 355 aa  169  7e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10700  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  38.28 
 
 		 422 aa  169  8e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00310871  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  36.45 
 
 		 419 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5438  DNA polymerase IV  31.54 
 
 		 407 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  34.42 
 
 		 407 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  42.62 
 
 		 420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  37.45 
 
 		 378 aa  167  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  37.45 
 
 		 378 aa  167  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  35.52 
 
 		 413 aa  167  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  35.47 
 
 		 356 aa  166  5e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5685  DNA polymerase IV  31.77 
 
 		 424 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273553 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  39.67 
 
 		 407 aa  166  6.9999999999999995e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  39.91 
 
 		 356 aa  166  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  29.08 
 
 		 399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  37.87 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3810  DNA polymerase IV  36.26 
 
 		 428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0803828  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  37.87 
 
 		 361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  37.87 
 
 		 408 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  28.85 
 
 		 425 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5059  DNA polymerase IV  39.56 
 
 		 407 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315945  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  31.77 
 
 		 430 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5147  DNA polymerase IV  39.56 
 
 		 407 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  32.08 
 
 		 412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3604  DNA polymerase IV  37.76 
 
 		 364 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1859  DNA polymerase IV  37.97 
 
 		 392 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  31.09 
 
 		 395 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  33.59 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3025  DNA-directed DNA polymerase  36.73 
 
 		 408 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.346367  normal  0.0754009 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1745  DNA polymerase IV  32.32 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  28.8 
 
 		 412 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2332  DNA-directed DNA polymerase  35.74 
 
 		 353 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353166  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  31.33 
 
 		 407 aa  160  5e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  29.46 
 
 		 412 aa  159  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0931  DNA polymerase IV  37.1 
 
 		 353 aa  159  7e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.643762  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1508  DNA polymerase IV  38.03 
 
 		 400 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408147  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1727  DNA polymerase IV  38.03 
 
 		 404 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2751  DNA polymerase IV  38.03 
 
 		 404 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  35.76 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0305  DNA-directed DNA polymerase  34.16 
 
 		 401 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.515183  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2675  DNA polymerase IV  38.03 
 
 		 406 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1128  DNA polymerase IV  38.24 
 
 		 429 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456598  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  34.71 
 
 		 466 aa  158  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  39.58 
 
 		 363 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2619  DNA polymerase IV  38.03 
 
 		 403 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  38.01 
 
 		 374 aa  159  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1342  DNA polymerase IV  36.13 
 
 		 359 aa  159  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2236  DNA polymerase IV  38.03 
 
 		 400 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.783166  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3083  DNA polymerase IV  38.03 
 
 		 400 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  30.63 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  32.38 
 
 		 371 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0324  DNA-directed DNA polymerase  30.73 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.86513 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  31.19 
 
 		 408 aa  157  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  35.25 
 
 		 421 aa  157  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  33.33 
 
 		 364 aa  157  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  35.74 
 
 		 380 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>