More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0324 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0324  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 405 aa  836    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.86513 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3025  DNA-directed DNA polymerase  60 
 
 		 408 aa  505  9.999999999999999e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.346367  normal  0.0754009 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0305  DNA-directed DNA polymerase  43.47 
 
 		 401 aa  311  9e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.515183  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2282  DNA-directed DNA polymerase  32.62 
 
 		 424 aa  208  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0665124  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  34.2 
 
 		 409 aa  193  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5590  DNA-directed DNA polymerase  34.55 
 
 		 421 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  33.16 
 
 		 407 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  32.65 
 
 		 409 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  32.23 
 
 		 409 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  33.68 
 
 		 408 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  33.33 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  35.84 
 
 		 400 aa  174  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  31.22 
 
 		 409 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  32.07 
 
 		 410 aa  169  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  31.05 
 
 		 385 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  29.74 
 
 		 410 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3073  DNA-directed DNA polymerase  30.73 
 
 		 414 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  31.31 
 
 		 397 aa  158  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  31.03 
 
 		 411 aa  149  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  29.77 
 
 		 413 aa  147  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  30.15 
 
 		 426 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  27.66 
 
 		 395 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  34.07 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  29.3 
 
 		 385 aa  139  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  28.88 
 
 		 407 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  29.97 
 
 		 402 aa  136  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  28.21 
 
 		 395 aa  135  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13710  DNA polymerase IV involved in DNA repair  30.8 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  27.68 
 
 		 393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  29.66 
 
 		 399 aa  133  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  32.65 
 
 		 413 aa  133  6e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  29.84 
 
 		 386 aa  132  9e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  28.12 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  27.34 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  28.46 
 
 		 412 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  27.86 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  27.51 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  27.51 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  29.47 
 
 		 408 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  28.17 
 
 		 412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  29.38 
 
 		 466 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  28.2 
 
 		 412 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  28.2 
 
 		 412 aa  130  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  28.2 
 
 		 412 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  28.2 
 
 		 412 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  28.2 
 
 		 412 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  29.37 
 
 		 425 aa  129  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2975  DNA polymerase IV  35.71 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.949481  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  36.52 
 
 		 363 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  30.13 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  27.86 
 
 		 371 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  30.77 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3235  DNA-directed DNA polymerase  28.11 
 
 		 380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  31 
 
 		 368 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 419 aa  127  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  30.86 
 
 		 421 aa  127  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1370  DNA-directed DNA polymerase  25.8 
 
 		 385 aa  126  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.67195 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  27.03 
 
 		 385 aa  126  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  27.94 
 
 		 412 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  28.16 
 
 		 408 aa  126  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  31.77 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  34.77 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  35.32 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  26.23 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  35.37 
 
 		 369 aa  124  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  37.71 
 
 		 356 aa  124  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  27.44 
 
 		 385 aa  123  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  30.47 
 
 		 481 aa  123  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  30.63 
 
 		 356 aa  123  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  31.69 
 
 		 834 aa  123  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  35.32 
 
 		 409 aa  123  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  32.08 
 
 		 412 aa  122  8e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3810  DNA polymerase IV  27.8 
 
 		 428 aa  122  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0803828  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  34.26 
 
 		 419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  30.91 
 
 		 378 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  30.91 
 
 		 378 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  32.93 
 
 		 374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  31.8 
 
 		 372 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3552  DNA polymerase IV  31.37 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1555  DNA-directed DNA polymerase  27.75 
 
 		 422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.558973  normal  0.0210398 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  34.69 
 
 		 360 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  29.01 
 
 		 399 aa  121  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  29.59 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  34.44 
 
 		 359 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0951  DNA polymerase IV  32.6 
 
 		 379 aa  120  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126406  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  28.79 
 
 		 408 aa  119  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2871  DNA polymerase IV  29.82 
 
 		 359 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3609  DNA-directed DNA polymerase  28.01 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4919  DNA-directed DNA polymerase  24.54 
 
 		 416 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002716  DNA polymerase IV  30.99 
 
 		 356 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3427  DNA polymerase IV  31 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3355  DNA polymerase IV  31 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0935  DNA polymerase IV  31 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  32.53 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  34.02 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  27.09 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  33.2 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1279  DNA-directed DNA polymerase  28.44 
 
 		 423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl328  DNA polymerase IV (PolIV)  25.71 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  2.9387500000000003e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  34.23 
 
 		 378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>