More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3609 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3609  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 405 aa  803    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  68.24 
 
 		 402 aa  545  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  60 
 
 		 407 aa  448  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5685  DNA polymerase IV  60.55 
 
 		 424 aa  431  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273553 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  57.18 
 
 		 419 aa  418  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5438  DNA polymerase IV  59.85 
 
 		 407 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5059  DNA polymerase IV  60.1 
 
 		 407 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315945  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  58.29 
 
 		 413 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5147  DNA polymerase IV  60.1 
 
 		 407 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1021  DNA polymerase IV  57.83 
 
 		 401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.6656  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  46.56 
 
 		 421 aa  301  9e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3810  DNA polymerase IV  45.85 
 
 		 428 aa  301  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0803828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  44.62 
 
 		 420 aa  289  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  49.12 
 
 		 419 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  46.88 
 
 		 430 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0380  DNA-directed DNA polymerase  50.86 
 
 		 358 aa  283  5.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154021  decreased coverage  0.00759765 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  45.94 
 
 		 410 aa  279  7e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  48.47 
 
 		 419 aa  276  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  44.67 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  41.82 
 
 		 408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  44.07 
 
 		 409 aa  269  5.9999999999999995e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  45.28 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  43.37 
 
 		 422 aa  267  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  44.97 
 
 		 406 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  42.97 
 
 		 414 aa  263  6e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  46.18 
 
 		 399 aa  262  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  43.73 
 
 		 415 aa  261  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  44.64 
 
 		 418 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  41.13 
 
 		 408 aa  256  4e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  43.04 
 
 		 415 aa  256  7e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  44.39 
 
 		 418 aa  256  7e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  45.6 
 
 		 407 aa  255  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  41.43 
 
 		 430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  41.75 
 
 		 410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  46.54 
 
 		 418 aa  253  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  37.47 
 
 		 393 aa  249  6e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  42.16 
 
 		 424 aa  247  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  40.16 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  39.38 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  40.06 
 
 		 378 aa  237  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  39.32 
 
 		 397 aa  238  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  34.9 
 
 		 385 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  40.36 
 
 		 400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  37.88 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13710  DNA polymerase IV involved in DNA repair  40.75 
 
 		 431 aa  234  3e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  39.14 
 
 		 407 aa  233  4.0000000000000004e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  38.85 
 
 		 412 aa  233  6e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  40.26 
 
 		 417 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  38.73 
 
 		 834 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  40.61 
 
 		 374 aa  229  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  38.9 
 
 		 385 aa  229  6e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  40.67 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  38.14 
 
 		 413 aa  228  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  35.37 
 
 		 408 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  34.9 
 
 		 445 aa  227  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5052  DNA-directed DNA polymerase  43.63 
 
 		 448 aa  227  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  39.55 
 
 		 378 aa  225  9e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  39.55 
 
 		 378 aa  225  9e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  34.73 
 
 		 453 aa  225  9e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  35.53 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  38.8 
 
 		 375 aa  225  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  40.56 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  34.65 
 
 		 445 aa  224  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  37.83 
 
 		 371 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  35.03 
 
 		 423 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  39.23 
 
 		 380 aa  223  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  37.47 
 
 		 426 aa  222  9e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  35.28 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  43.06 
 
 		 356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  37.15 
 
 		 417 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  36.68 
 
 		 436 aa  220  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  40.15 
 
 		 386 aa  220  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  37.31 
 
 		 449 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2975  DNA polymerase IV  39.2 
 
 		 443 aa  219  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.949481  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  38.38 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  36.34 
 
 		 372 aa  217  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  39.55 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  35.66 
 
 		 429 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1274  DNA polymerase IV  34.96 
 
 		 436 aa  217  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0719979  normal  0.0370886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  35.46 
 
 		 435 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  40.87 
 
 		 363 aa  217  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2445  DNA polymerase IV  35.19 
 
 		 429 aa  216  8e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255034  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  39.83 
 
 		 481 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13520  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  36.09 
 
 		 433 aa  215  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  37.32 
 
 		 363 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  36.23 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  34.3 
 
 		 385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  35.84 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1429  DNA polymerase IV  35.8 
 
 		 429 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.587123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0385  DNA polymerase IV  37.47 
 
 		 417 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.434794  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  35.82 
 
 		 389 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  36.9 
 
 		 432 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20590  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  38.67 
 
 		 489 aa  212  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  36.9 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  33.82 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  35 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  39.23 
 
 		 376 aa  210  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  37.5 
 
 		 378 aa  210  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10700  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  38.72 
 
 		 422 aa  210  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00310871  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1377  DNA polymerase IV  34.61 
 
 		 431 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>