More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl328 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl328  DNA polymerase IV (PolIV)  100 
 
 		 370 aa  749    Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  2.9387500000000003e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0423  ImpB/MucB/SamB family protein  37.4 
 
 		 408 aa  231  1e-59  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0327324  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  36.52 
 
 		 409 aa  225  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  34.45 
 
 		 408 aa  223  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  32.1 
 
 		 409 aa  206  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  31.83 
 
 		 481 aa  205  8e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  31.27 
 
 		 410 aa  203  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  31.83 
 
 		 410 aa  200  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  32.39 
 
 		 407 aa  199  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  31.04 
 
 		 412 aa  193  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  33.33 
 
 		 413 aa  192  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  31.32 
 
 		 412 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  31.32 
 
 		 412 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2364  DNA-directed DNA polymerase  29.34 
 
 		 409 aa  189  7e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259486  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2961  DNA-directed DNA polymerase  32.07 
 
 		 356 aa  188  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  30.4 
 
 		 409 aa  188  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  30.66 
 
 		 412 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  30.94 
 
 		 412 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  30.94 
 
 		 412 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  30.94 
 
 		 412 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  30.94 
 
 		 412 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  30.66 
 
 		 412 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  27.42 
 
 		 395 aa  186  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  31.59 
 
 		 412 aa  186  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  30.03 
 
 		 411 aa  186  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  30.66 
 
 		 412 aa  186  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  29.14 
 
 		 386 aa  185  9e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  28.65 
 
 		 384 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0483  DNA polymerase family protein  33.52 
 
 		 360 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0359018  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  30.11 
 
 		 409 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf186  Pol_IV_kappa DNA polymerase  31.07 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0102913  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  28.86 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  32.22 
 
 		 345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  29.63 
 
 		 425 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  28.85 
 
 		 355 aa  179  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  28.22 
 
 		 414 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  33.55 
 
 		 425 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  28.73 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  27.9 
 
 		 399 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  32.87 
 
 		 359 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  29.21 
 
 		 399 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  31.64 
 
 		 389 aa  172  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  29.8 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  28.85 
 
 		 354 aa  171  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  28.33 
 
 		 356 aa  170  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  30.05 
 
 		 397 aa  169  5e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  31.05 
 
 		 363 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  31.64 
 
 		 385 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  30.82 
 
 		 393 aa  168  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  28.38 
 
 		 418 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  30.3 
 
 		 357 aa  166  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  27.68 
 
 		 417 aa  166  5.9999999999999996e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  27.53 
 
 		 360 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2083  DNA-directed DNA polymerase  29.49 
 
 		 399 aa  165  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.968018  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  26.33 
 
 		 419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  30.2 
 
 		 412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2123  UMUC-like DNA-repair protein  31.27 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48636  hitchhiker  0.00329078 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  26.42 
 
 		 418 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  28.26 
 
 		 414 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  28.06 
 
 		 395 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  31.18 
 
 		 378 aa  162  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  26.36 
 
 		 449 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  31.81 
 
 		 365 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  26.39 
 
 		 402 aa  162  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  26.36 
 
 		 417 aa  162  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  35.71 
 
 		 359 aa  162  9e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2007  UMUC domain protein DNA-repair protein  31.53 
 
 		 413 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.470929  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  27.53 
 
 		 429 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  27.79 
 
 		 423 aa  162  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3095  DNA polymerase IV  27.79 
 
 		 454 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  31.38 
 
 		 380 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0370  DNA-directed DNA polymerase  27.7 
 
 		 423 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  26.99 
 
 		 432 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  26.78 
 
 		 417 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  25.21 
 
 		 419 aa  160  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  26.32 
 
 		 410 aa  160  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.57 
 
 		 415 aa  159  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3155  DNA polymerase IV  27.9 
 
 		 452 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.945689  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  32.43 
 
 		 368 aa  159  6e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3115  DNA polymerase IV  27.62 
 
 		 452 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.259823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1274  DNA polymerase IV  30.09 
 
 		 436 aa  159  6e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0719979  normal  0.0370886 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  26.14 
 
 		 418 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  28.73 
 
 		 356 aa  159  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  27.86 
 
 		 390 aa  159  7e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5871  DNA-directed DNA polymerase  29.56 
 
 		 381 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.937041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  27.12 
 
 		 431 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3530  DNA polymerase IV  27.35 
 
 		 421 aa  158  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  30.45 
 
 		 378 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  30.4 
 
 		 364 aa  158  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  31.45 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  27.4 
 
 		 445 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  27.12 
 
 		 453 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13520  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.79 
 
 		 433 aa  157  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  31.03 
 
 		 356 aa  157  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  29.4 
 
 		 369 aa  157  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2410  DNA polymerase IV  27.48 
 
 		 429 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.18017 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4721  DNA polymerase IV  29.34 
 
 		 425 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  28.13 
 
 		 359 aa  156  4e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3159  DNA-directed DNA polymerase  27.5 
 
 		 431 aa  157  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.382923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2445  DNA polymerase IV  27.43 
 
 		 429 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>