More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2123 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2123  UMUC-like DNA-repair protein  100 
 
 		 387 aa  788    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48636  hitchhiker  0.00329078 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3545  UMUC-like DNA-repair protein  63.56 
 
 		 393 aa  481  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2067  DNA-directed DNA polymerase  62.07 
 
 		 388 aa  471  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0860005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0274  DNA-directed DNA polymerase  61.97 
 
 		 385 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0949  DNA-directed DNA polymerase  61.38 
 
 		 385 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.868276  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0008  DNA-directed DNA polymerase  62.7 
 
 		 385 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5871  DNA-directed DNA polymerase  59.68 
 
 		 381 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.937041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3123  DNA-directed DNA polymerase  61.74 
 
 		 384 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1234  DNA-directed DNA polymerase  60.21 
 
 		 396 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1323  DNA-directed DNA polymerase  55.53 
 
 		 416 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0937  DNA-directed DNA polymerase  59.15 
 
 		 436 aa  439  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3159  DNA-directed DNA polymerase  57.18 
 
 		 431 aa  435  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.382923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2649  DNA-directed DNA polymerase  56.14 
 
 		 403 aa  434  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3696  DNA-directed DNA polymerase  54.68 
 
 		 422 aa  429  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0931583  normal  0.897611 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1647  DNA-directed DNA polymerase  55.85 
 
 		 432 aa  431  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5287  DNA-directed DNA polymerase  55.65 
 
 		 437 aa  420  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2353  DNA-directed DNA polymerase  54.38 
 
 		 413 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48043  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1964  DNA-directed DNA polymerase  55.32 
 
 		 425 aa  418  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.560205  normal  0.0220335 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3296  DNA-directed DNA polymerase  53.52 
 
 		 399 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  39.17 
 
 		 354 aa  237  3e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  36.64 
 
 		 389 aa  227  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  35.6 
 
 		 371 aa  225  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  35.44 
 
 		 419 aa  222  8e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3476  DNA-directed DNA polymerase  38.48 
 
 		 370 aa  222  8e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0765318  normal  0.0172319 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  35.01 
 
 		 425 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  35.22 
 
 		 426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  35.11 
 
 		 419 aa  220  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  35.31 
 
 		 372 aa  219  8.999999999999998e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  36.36 
 
 		 385 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  36.07 
 
 		 420 aa  216  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  34.7 
 
 		 402 aa  215  8e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  36.05 
 
 		 466 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  39.13 
 
 		 360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  33.51 
 
 		 378 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  33.51 
 
 		 378 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  34.95 
 
 		 367 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  37.3 
 
 		 381 aa  213  7e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0622  DNA-directed DNA polymerase  36.46 
 
 		 365 aa  211  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  36.63 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  35.25 
 
 		 363 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  34.88 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  37.26 
 
 		 430 aa  209  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  34.79 
 
 		 384 aa  209  9e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  34.92 
 
 		 415 aa  209  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  33.51 
 
 		 371 aa  208  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  35.81 
 
 		 374 aa  207  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  37.13 
 
 		 409 aa  206  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  34.13 
 
 		 357 aa  206  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  33.86 
 
 		 369 aa  206  7e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  35.52 
 
 		 418 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  33.42 
 
 		 400 aa  204  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  35.52 
 
 		 418 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  35.04 
 
 		 481 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  36.24 
 
 		 834 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  35.01 
 
 		 355 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  34.78 
 
 		 410 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  33.7 
 
 		 408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  35.52 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  35.12 
 
 		 378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  35.16 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  35.85 
 
 		 386 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  35.54 
 
 		 378 aa  199  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  34.66 
 
 		 385 aa  199  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  35.15 
 
 		 407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  35.89 
 
 		 376 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5822  DNA polymerase IV  35.69 
 
 		 353 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.127311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  33.95 
 
 		 415 aa  197  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  33.88 
 
 		 430 aa  197  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  34.93 
 
 		 365 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4326  DNA-directed DNA polymerase  37.23 
 
 		 463 aa  195  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  35.05 
 
 		 364 aa  195  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2097  DNA-directed DNA polymerase  36.31 
 
 		 373 aa  195  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  33.6 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  33.6 
 
 		 418 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  34.35 
 
 		 412 aa  193  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  34.25 
 
 		 409 aa  193  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  35.22 
 
 		 356 aa  192  6e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5052  DNA-directed DNA polymerase  37.7 
 
 		 448 aa  192  8e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  34.03 
 
 		 395 aa  192  9e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  33.7 
 
 		 409 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3530  DNA polymerase IV  35.28 
 
 		 421 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3703  DNA polymerase IV  36.19 
 
 		 362 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.260929  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  35.34 
 
 		 354 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  32.38 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  35.85 
 
 		 413 aa  190  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  33.52 
 
 		 406 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  34.67 
 
 		 363 aa  190  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  31.78 
 
 		 424 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  33.78 
 
 		 408 aa  189  5.999999999999999e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  32.98 
 
 		 409 aa  189  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20590  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  34.24 
 
 		 489 aa  189  7e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  33.42 
 
 		 358 aa  189  8e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  31.85 
 
 		 390 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  31.95 
 
 		 390 aa  188  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13630  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  34.76 
 
 		 458 aa  189  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  33.15 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06310  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  34.05 
 
 		 454 aa  188  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  32.21 
 
 		 345 aa  188  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1370  DNA-directed DNA polymerase  31.45 
 
 		 385 aa  188  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.67195 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2071  DNA-directed DNA polymerase  32.96 
 
 		 348 aa  187  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>